Το αρχείο αφορά την αναγνώριση των τίτλων ιδιοκτησίας οθωμανικών κτημάτων από Έλληνες, στις περιοχές που, βάσει διεθνών συνθηκών, δεν θεωρήθηκε ότι κατέχονται από ελληνικά στρατεύματα την περίοδο της υπογραφής των συνθηκών της Ανεξαρτησίας (Θήβα, ν. Φθιώτιδος, Φωκίδος, Εύβοια, ν. Αττικής). Περιέχονται: αλληλογραφία της Επιτροπής με το Υπουργείο Οικονομικών, το Υπουργείο Εξωτερικών, νομάρχες, οικονομικούς εφόρους, κ.ά. Επίσης, αιτήσεις Ελλήνων για αναγνώριση ιδιοκτησίας, πωλητήρια και συμβολαιογραφικά έγγραφα (χοτζέτια και ταπιά σε οθωμανική γραφή και μετάφρασή τους). Πρωτόκολλα εξερχομένων της Επιτροπής, αποδεικτικά παραλαβής τίτλων, ευρετήρια κλπ.

Το αρχείο της Μικτής Επιτροπής μαζί με το αρχείο των Εθνικών Κτημάτων αναδεικνύουν τις διαδικασίες με τις οποίες το ελληνικό κράτος και έλληνες υπήκοοι απέκτησαν κυριότητα επί των οθωμανικών γαιών μετά την Επανάσταση.

Τμήμα του αρχείου του αγωνιστή της Επανάστασης του 1821 Ρήγα Παλαμήδη (1794-1872). Περιλαμβάνει αποδείξεις πληρωμής (1800-1801), αναφορές (1808, 1820-1821), καταγραφή εξόδων του ναΐπη της Τριπολιτσάς (1811), χοτζέτια από τις περιοχές της Αρκαδίας και της Τριπολιτσάς (1774-1818), ένα ταπί σπαχήδων από τους Μολάους Καρύταινας (1799-1800), ένα τεφτέρι καταγραφής των κρατικών εσόδων και εξόδων των πρώιμων και όψιμων προϊόντων των τσιφλικιών των καζάδων του Άργους και του Ναυπλίου (1819-1820), δημόσια έγγραφα και, κυρίως, δημόσια και ιδιωτική αλληλογραφία του Ρήγα Παλαμήδη:
φ. 1, Έγγραφα Τουρκικά (31 έγγραφα),
φ. 2, Έγγραφα (75 έγγραφα),
φ. 3, Έγγραφα 1836-1841 (54 έγγραφα),
φ. 4, Έγγραφα 1842-1852 (121 έγγραφα),
φ. 5, Έγγραφα 1853-1854 (185 έγγραφα),
φ. 6, Έγγραφα 1855-1862 (161 έγγραφα),
φ. 7, Έγγραφα 1863-1870 (107 έγγραφα),
φ. 8, Έγγραφα 1871-1874 & αχρονολόγητα (120 έγγραφα)

Έγγραφο με μετάφραση οθωμανικού ταπί που εκδόθηκε το 1215 Εγίρας (1800) και αφορά την περιοχή της Κορίνθου.