Αρχείο Αλέξανδρου Μαυροκορδάτου.
Φ. 1: τρία ημερολόγια του Αλ. Μαυροκορδάτου της περιόδου 1834-1837, Γενικό Πρωτόκολλο του Προέδρου του Εκτελεστικού, 1822-1823, "Βιβλίον Κάσσας Μετρητών. Μεσολόγκιον 1822", πρωτόκολλο επιστολών προς Μαυροκορδάτο της περιόδου 1825 - 1826.
Φ. 2: Μυστικό Πρωτόκολλο του Προέδρου του Εκτελεστικού Α. Μαυροκορδάτου των ετών 1822 - 1823, τεύχος με σημειώσεις για τα Ιόνια νησιά, κατάστιχο λογαριασμών "Η Κάσσα των Μετρητών του Πραΐδη" 1822-1823, επιστολές από Βιέννη, Βουκορέστι και Πίζα της περιόδου 1815-1820, γράμμα της Κοινότητας Ύδρας του 1803 με τον πρώτο ναυτεμπορικό νόμο του νησιού, έγγραφα της περιόδου 1821-1822.
Φ. 3: Έγγραφα του 1823 (Ιανουάριος - Ιούνιος)
Φ. 4: Έγγραφα του 1823 (Ιούλιος - Δεκέμβριος)
Φ. 5: Έγγραφα του 1824 (Ιανουάριος - Μάρτιος)
Φ. 6: Έγγραφα του 1824 (Απρίλιος - Ιούλιος)
Φ. 7: Έγγραφα του 1824 (Αύγουστος)
Φ. 8: Έγγραφα του 1824 (Σεπτέμβριος)
Φ. 9: Έγγραφα του 1824 (Οκτώβριος - Δεκέμβριος)
Φ. 10: Έγγραφα του 1825 (Ιανουάριος - Ιούλιος)
Φ. 11: Έγγραφα του 1825 (Αύγουστος - Δεκέμβριος)
Φ. 12α: Έγγραφα του 1826 (Ιανουάριος - Ιούλιος)
Φ. 12β: Έγγραφα του 1826 (Αύγουστος - Δεκέμβριος)
Φ. 13: Έγγραφα του 1827 (Ιανουάριος - Δεκέμβριος)
Φ. 14: Έγγραφα του 1828 (Ιανουάριος - Μάρτιος)
Φ. 15: Έγγραφα του 1828 (Απρίλιος - Δεκέμβριος)
Φ. 16: Έγγραφα του 1829
Φ. 17: Έγγραφα του 1830-1831
Φ. 18: Έγγραφα του 1832
Φ. 19: Έγγραφα του 1833-1836
Φ. 20: Έγγραφα του 1837-1840
Φ. 21: Έγγραφα του 1841
Φ. 22: Έγγραφα του 1842
Φ. 23: Έγγραφα του 1843
Φ. 24: Έγγραφα του 1844 (Ιανουάριος - Μάιος)
Φ. 25: Έγγραφα του 1844 (Ιούνιος - Δεκέμβριος)
Φ. 26: Έγγραφα του 1845-1853
Φ. 27: Έγγραφα του 1854-1859
Φ. 28: Έγγραφα του 1860-1880 και 1837-1870.

1. Έγγραφα (1792 - 1821) από την Ύδρα, τα περισσότερα των οποίων είναι διαταγές του "Διβανίου του Βασιλικού Τερσανά" προς το Κοινόν της Ύδρας (Κ4α_1).
2. Προκηρύξεις και εγκύκλιοι (1821 - 1831) από την Ύδρα (Κ4α_2).
3. Έντυπο "Ερμηνεία των Σενιάλων" (σενιάλα των Καπιτάνων των μερικών πλοίων προς το Ναύαρχο, σενιάλα της Πούσουλας, σενιάλα της νυκτός και σενιάλα με 2, 3, 4, 5 και 6 φανάρια) (Κ4α_2).
4. Εγκύκλιοι, προκηρύξεις και συμπληρωματικός πίνακας των δικαιούχων της Ύδρας (1822-1828, 1855) (Κ4α_2).
5. Κατάστιχο με τίτλο "Καταγραφή της Λαβής και Δόσεως" που περιέχει τους εράνους, εισπράξεις, δαπάνες κατά τις διάφορες εκστρατείες του Υδραϊκού στόλου κατά τη διάρκεια της Επανάστασης (1823 - 1826) (Κ4α_3).
6. Χειρόγραφο που περιλαμβάνει κανονισμό, πολιτικό και εμπορικό του Κοινού της νήσου της Ύδρας πριν από την Επανάσταση του 1821, πίνακα των σωζόμενων πλοίων της Ύδρας κατά το έτος 1830, των κατεστραμμένων πυρπολικών και άλλων λογαριασμών που συντάχθηκε το 1858 (Κ4α_3).
7. Διαταγές προς το Κοινό της Ύδρας του "Διβανίου του Βασιλικού Τερσανά", ναυτικά διπλώματα και διαβατήρια (1808-1836) (Κ4β).

1. Υπόμνημα περί της νήσου Ύδρας από τον Αντώνιο Μιαούλη.
2. Διήγηση θαυμάτων της Ιεράς εικόνας της Υπεραγίας Θεοτόκου της Φανερωμένης της ευρισκομένης στην Ύδρα.
3. Πωλητήριο του Νικ. Βότζου και του υιού του Πέτρου προς τον Νικολό Μπουντούρη από την Ύδρα στις 20 Οκτωβρίου 1783.
4. Ομολογία μεταξύ των αδελφών Γεωργίου και Γιάννη Μπουντούρη από την Ύδρα στις 17 Οκτωβρίου 1806.
5. Πωλητήριο της Ζώγκας θυγατρός Δήμα Μαστρογιάννη προς τη θυγατέρα της Ελένη, Ύδρα 11 Απριλίου 1817.
6. Κρυπτογραφικό δίπλωμα ιερέα της Φιλικής Εταιρείας στην Ύδρα, με το οποίο ο S. καθιερώνει ιερέα Φιλικόν τον Εμμανουήλ Ιωάννου Σπαή από την Ύδρα ετών 48 πραγματευτή,
7. Κατάσταση τριάντα δύο (32) πλοίων που περιλαμβάνει αύξοντα αριθμό, όνομα πλοιοκτήτη και αριθμό ναυτών εκάστου και έχει τίτλο "Μανόλη Σπαχή των κάτωθεν πλοίων θενά δώσης εκάστου ναύτου τρία τέταρτα".