Το αρχείο περιλαμβάνει τεκμήρια (κυρίως αντίγραφα από αρχειακές και έντυπες πηγές) από τις έρευνες του Α. Αγγέλου σε βιβλιοθήκες της Ελλάδας και του εξωτερικού γύρω από πρόσωπα και θέματα της τουρκοκρατίας και του Διαφωτισμού, πρόσωπα και θέματα της νεοελληνικής λογοτεχνίας. Περιλαμβάνει επίσης μελέτες και σχέδια μελετών του Α. Αγγέλου σε αυτά τα ερευνητικά πεδία, τεκμήρια από την έκδοση ή τον σχεδιασμό έκδοσης έργων στη σειρά Νεοελληνική Βιβλιοθήκη των εκδόσεων Ερμής, τεκμήρια από την διδασκαλία του στο πανεπιστήμιο, στη ΧΕΝ κ.α., συναφείς με τα ενδιαφέροντά του δημοσιεύσεις ιστορικών και φιλολόγων.

Το αρχείο περιλαμβάνει τεκμήρια (χφα, δφα, εκτυπώσεις Η/Υ, φωτοαντίγραφα αρχειακών και έντυπων πηγών και βιβλιογραφίας) από τη μεταφραστική δραστηριότητα, τις φιλολογικές μελέτες του Π. Μουλλά (διδακτορική διατριβή, έρευνες, βιβλία, άρθρα, ομιλίες) και το διδακτικό του έργο στο πανεπιστήμιο. Περιλαμβάνει επίσης υπηρεσιακά έγγραφα από την σταδιοδρομία του στο πανεπιστήμιο (Γαλλία, Ελλάδα, Κύπρος), αλληλογραφία, κείμενα άλλων, έντυπα 19ου και 20ού αιώνα, φωτοαντίγραφα εντύπων, φωτογραφίες.

Το αρχείο περιέχει τεκμήρια σχετικά με τη Γεωπονική και Δασολογική Σχολή του ΑΠΘ.

Μεγάλο μέρος του αρχείου αποτελούν τεκμήρια (υπομνήματα, αλληλογραφία, καταθέσεις, πρακτικά συνελεύσεων, δικαστικές αποφάσεις) που σχετίζονται με δικαστικές διαμάχες του Ι. Παπαϊωάννου με άλλους καθηγητές της Σχολής και με τη διοίκηση του ΑΠΘ. Περιέχεται πλήθος πρακτικών από τις συνελεύσεις της σχολής. Ενδιαφέρον παρουσιάζει η αλληλογραφία του Ι. Παπαϊωάννου με υπάλληλους της Δασικής Υπηρεσίας και με δημοτικούς ή κοινοτικούς υπαλλήλους από όλη την Ελλάδα σχετικά με την παρουσία δασών πεύκης στην περιοχή τους (υποφάκελοι 5.3 και 5.4.). Ενδιαφέρον παρουσιάζουν ακόμη φωτογραφίες από δάση πεύκης και κυρίως από δέντρα με τομές ρητίνευσης. Ορισμένες από αυτές φέρουν τεκμηρίωση και απεικονίζουν ρητινεργάτες.