Πρωτόκολλα αλληλογραφίας, Πρακτικά Λιμενικής Επιτροπής, φάκελοι λυτών εγγράφων.

Υποβολή στατιστικών στοιχείων, έλεγχος ξενοδοχειακών εγκαταστάσεων, ρύπανση από πηγές ξηράς, αλληλογραφία με το Λιμεναρχείο Σάμου, δελτία σύνθεσης πληρωμάτων, ευκολίες υποδοχής, Μαρίνα Πυθαγορείου, μεταφορά ασθενών κ.ά..

Παλαιά πιστοποιητικά, αποδείξεις Μ.Τ.Ν., Λιμενικά τέλη, παραβάσεις, κλήσεις, ναυτολόγια, καταστάσεις πενθημέρου, νυχτερινή απασχόληση, μεταφορά ασθενών, δρομολόγια πλοίων, κ.ά..

Δελτία κίνησης Θ/Γ 2002, τέλη επιβατών, άδειες ανέλκυσης- καθέλκυσης, σήματα για ΝΑΤ, διανευρέσεις σκαφών, κοινό αρχείο ΝΑΤ κ.ά..

Ναυλοσύμφωνα, σήματα τουριστικών θαλαμηγών, καταστάσεις κατάπλου και απόπλου, Κ/2 καταστάσεις, τέλη, καταστάσεις κίνησης επιβατών.

Απόπλοι-κατάπλοι θαλαμηγών, δικαστικά, καταστάσεις θαλαμηγών, απογραφή 2009, μηνιαία έκθεση για το οργανωμένο έγκλημα, καταστάσεις πληρωμάτων Α/Κ, καταστάσεις αλιεργατών κ.ά..