Η συλλογή περιέχει πρωτότυπα έγγραφα και χειρόγραφα που αφορούν, κυρίως, στην εκκλησιαστική, πολιτική και εσωτερική ιστορία των νησιών του Αιγαίου Πελάγους και άλλων ελληνικών χωρών τους χρόνους της Φραγκοκρατίας και της Τουρκοκρατίας, αντίγραφα και φωτογραφίες εγγράφων και χειρογράφων από αρχεία της Ευρώπης, της Ελλάδας και της Ανατολής, διάφορα χειρόγραφα και σημειώματα του ιστοριοδίφη καθώς και την αλληλογραφία του με διαπρεπείς Έλληνες και ξένους επιστήμονες.
Επίσης, περιλαμβάνει διάφορα φιρμάνια, μπουγιουρντί, ακτιναμέδες (ahitname) και άλλα έγγραφα, που αφορούν ποικίλες υποθέσεις των νησιών του Αιγαίου Πελάγους, όπως φορολογικές υποθέσεις, απόδοση ιλτιζάμ (iltizam) νήσων και εκμίσθωση δεκάτης, διενέξεις Φράγκων και Ρωμαίων, αποστολή ανδρών και υλικών για τις ανάγκες του αυτοκρατορικού στόλου, περί προστασίας ρωσικών εμπορικών πλοίων, περί μη καταπίεσης ραγιάδων, περί επίλυσης διαφορών ραγιάδων, κ.ά.

Ο κατάλογος της συλλογής διαιρείται σε εννιά (9) κεφάλαια:

1. Εκκλησιαστικά και μοναστηριακά (Πατριαρχεία Κωνσταντινουπόλεως, Ιεροσολύμων, Μητροπόλεις Αγαθοπόλεως, Αθηνών, Άρτης, Βάρνας, Ευρίπου, Εφέσου, Ηρακλείας, Ιωαννίνων, Καισαρείας, Μονεμβασίας, Σάμου, Τυρνόβου, Επισκοπές, Μονές, Μονύδρια, Ναοί)
2. Λατινική Εκκλησία των Νήσων,
3. Σχολικά (Κάσος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Φολέγανδρος),
4. Κοινοτικά (Κέα, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Πάτμος, Σύρος, Φολέγανδρος),
5. Διοικητικά και Φορολογικά (Λατίνοι δυνάστες, Τουρκοκρατία-Νήσοι Αιγαίου, Άνδρος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Σίκινος, Σύρος, Φολέγανδρος),
6. Ελληνικές Παροικίες του Εξωτερικού (Ανκόνα & Λιβόρνο),
7. Ιδιωτικά,
8. Διάφορα,
9. Χειρόγραφα
   και εντός των κεφαλαίων έγιναν μικρότερες υποδιαιρέσεις κατά γεωγραφικές ενότητες.

Αναλυτικότερα:
Κ36_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: χειρόγραφα 1-6
Κ37_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 1-43
Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 44-59,
Κ38_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 60-90
Κ39_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 91-110
Κ40_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 111-135
Κ41_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 136-155
Κ42_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 156-172
Κ43_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 173-185

• " Έγγραφα Καστελλορίζου Νομαρχιακά", αναφερόμενα στην ιστορία της νήσου Μεγίστης (Κ1α).
• Πρωτόκολλο πράξεων του Εκκλησιαστικού Δικαστηρίου της Αρχιεπισκοπής Καστελλόριζου (Κ1β)
• Συλλογή οθωμανικών εγγράφων (εκ των οποίων ένα λιθόγραφο): δύο φιρμάνια του 19ου αιώνα σχετικά με την άδεια κατασκευής πλοίων, την ανακαίνιση του βακουφιού του Μπαμπά Τουρμπεσί, ένα δίπλωμα πλοιαρχίας κ.ά. (Κ1γ)
• Έγγραφα Καστελλόριζου, αποδείξεις πληρωμών φόρου, κ.ά. (Κ1δ)
• Μαθητολόγιο της Αστικής Σχολής Μεγίστης (Κ1ε)
• Απανταχούσα επισκοπική περί συλλογής εράνων υπέρ ανακαινίσεως ναού στο Καστελόριζο, πράξη προικοδοσίας της Κυράτζας Παπαδίας θυγατρός Χατζή-Βασιλείου, υπογεγραμμένη υπό του Αμασείας Παϊσίου (Κωνσταντινούπολη, 1818), προικοσύμφωνο Μαρίας Μιχαλιά και Κωνσταντή Χατζή-Πέτου στο Καστελόριζο (Κ1στ).

Συλλογή εγγράφων διαφόρων Μονών της Αιτωλίας (πωλητήρια, διαθήκες, ψυχοχάρτια, αφιερωτικά, ομολογίες, επιστολές, οθωμανικά ταπιά (tapu), χοτζέτια (huccet), φετφάδες (fetva), μπουγιουρντί (buyuruldu), τεζκερέδες (tezkere), κ.ά.) που αφορούν, κυρίως, στην κτηματική περιουσία των Μονών.

Διαταγές του Οθωμανού διοικητή της περιοχής των Τρικάλων.

Συλλογή εγγράφων από τον Βυθό Κοζάνης:

1. Υιοθεσία του έτους 1761.
2. Αναφορά κατοίκων Βυθού Κοζάνης παραπονούμενων προς τον βεζίρη του έτους 1807.
3. Μπουγιουρντί του βεζίρη Μαχμούτ Χαμίτ της 1ης Ιουνίου 1836.
4. Διαθήκες.
5. Πωλητήρια.
6. Έγγραφα διανομής περιουσίας.

Συλλογή εγγράφων από τον Βυθό Κοζάνης:

1. Απόδειξη παραλαβής άσπρων (1819).
2. Δύο (2) φορολογικοί κατάλογοι άσπρων (1830).
3. Κατάλογος εμφαίνων τα κονάκια (1830).
4. Ενδεικτικό (1855).
5. Συμφωνητικό (1861).
6. Τα μουσαρίφια της χώρας (1866).
7. Κατάλογος (1867).
8. Έγγραφα διορισμού διδασκάλου (1870, 1871, 1872).
9. Έγγραφο διανομής περιουσίας (1882).
10. Συμφωνητικό (1882).
11. Ενδεικτικό Ιεράς Μητροπόλεως Σισανίου & Σιατίστης (1892).
12. Βικαέδες από δρόμο (1895-1896).
13. Κανονισμός Κοινότητας Καβάλας (1899).
14. Τεφτέρι μουχτάρη Βυθού (1900).
15. Λογαριασμός μουχτάρη Βυθού (1901).
16. Δύο (2) συμβόλαια διορισμού διδασκάλων (1904-1905).
17. Σχολική διάταξη (1908).
18. Έγγραφο προξένου Βοστώνης (1911).
19. Φύλλο άδειας στρατιώτη στο Manchester (1912).
20. Ενδεικτικό (1913).
21. Σχολικό πρόγραμμα (1915).
22. Επιστολή άνευ χρονολογίας,
23. Οκτώ τεφτέρια αρχιμάστορα (1872-1894).

Δύο (2) οθωμανικά έγγραφα (φιρμάνια).

1. Οθωμανικά έγγραφα, εκ των οποίων ένα φιρμάνι, του 19ου αιώνα για την περιοχή της Καβάλας.
2. Προϋπολογισμός δαπάνης για την κατασκευή ανδριάντα του Γρηγορίου του Ε΄ στη Δημητσάνα (1899)
3. Έγγραφα της οικογένειας Καμπανάρη: αποδείξεις καταβολής χρημάτων στην Τράπεζα της Κρήτης (1901) και το Κοινωφελές Ταμείο Κρήτης (1904), συμβολαιογραφικές πράξεις (1901-1912) και έντυπη απεικόνιση της σύνθεσης του γλύπτη Γιάννη Καμπανάρη με θέμα "Η εξέγερση της Κρήτης".
4. Έγγραφο της Εταιρείας Σιδηροδρόμων Πειραιώς - Αθηνών - Πελοποννήσου σχετικά με την αύξηση του μισθού του επιθεωρητή Ευθ. Καζάκου (1903).
5. Έγγραφα της Δ/νσης Επιμελητείας του Γ΄ Σώματος Στρατού, της Σχολής Υπαξιωματικών και άλλων στρατιωτικών υπηρεσιών σχετικά με ζητήματα επιμελητείας και λειτουργίας στρατιωτικών σχολών.
6. Ποιήματα των Κυπριώτη και Πολέμη που απαγγέλθηκαν στο Ελληνικό Προξενείο Μανσούρας (Αίγυπτος) και στη Δημαία Σχολή Μανσούρας για την εκατονταετηρίδα της Ελληνικής Επανάστασης.
7. Προκήρυξη των Τούρκων στρατιωτών προς τους Έλληνες στρατιώτες κατά τη Μικρασιατική Εκστρατεία.
8. Ανυπόγραφη επιστολή προς τη βασίλισσα της Ελλάδας (1931;).
9. Επιστολή προς τον στρατηγό Δούσμανη από το Παρίσι (1932).
10. Εγκύκλιοι της Μητρόπολης Δράμας, Φιλίππων και Νευροκοπίου (1933-1939) και έγγραφο του Πρωτοσύγκελου του Ιεράς Μητρόπολης Δράμας προς το Υπουργείο Παιδείας σχετικά με τις βουλγαρικές βιαιοπραγίες κατά την κατάληψη της Δράμας και της Ανατολικής Μακεδονίας (Ιούνιος 1941).
11. Φάκελος Συνταγματάρχη Θεοχάρη με υπηρεσιακή αλληλογραφία για ζητήματα κυρίως επιμελητείας και προμηθειών (1939-1944).
12. Ασπρόμαυρη φωτογραφία έφιππου αξιωματικού.
13. Προκηρύξεις Ε.Ο.Ν. (1940-1941)
14. Λιθογραφημένο μήνυμα του Γεωργίου Β΄ προς τους στρατιώτες του αλβανικού μετώπου για το νέο έτος (1940-1941).
15. Ποίημα "Η Ελλάδα θα ζήση" της Δέσπω Παναγιωτίδη.
16. Αντίγραφο επιστολής των Ελλήνων του Καΐρου προς τον πρόεδρο της Ελληνικής Κυβέρνησης Αλ. Παπάγο σχετικά με αναπήρους και θύματα πολέμου.

1. Έγγραφα (1792 - 1821) από την Ύδρα, τα περισσότερα των οποίων είναι διαταγές του "Διβανίου του Βασιλικού Τερσανά" προς το Κοινόν της Ύδρας (Κ4α_1).
2. Προκηρύξεις και εγκύκλιοι (1821 - 1831) από την Ύδρα (Κ4α_2).
3. Έντυπο "Ερμηνεία των Σενιάλων" (σενιάλα των Καπιτάνων των μερικών πλοίων προς το Ναύαρχο, σενιάλα της Πούσουλας, σενιάλα της νυκτός και σενιάλα με 2, 3, 4, 5 και 6 φανάρια) (Κ4α_2).
4. Εγκύκλιοι, προκηρύξεις και συμπληρωματικός πίνακας των δικαιούχων της Ύδρας (1822-1828, 1855) (Κ4α_2).
5. Κατάστιχο με τίτλο "Καταγραφή της Λαβής και Δόσεως" που περιέχει τους εράνους, εισπράξεις, δαπάνες κατά τις διάφορες εκστρατείες του Υδραϊκού στόλου κατά τη διάρκεια της Επανάστασης (1823 - 1826) (Κ4α_3).
6. Χειρόγραφο που περιλαμβάνει κανονισμό, πολιτικό και εμπορικό του Κοινού της νήσου της Ύδρας πριν από την Επανάσταση του 1821, πίνακα των σωζόμενων πλοίων της Ύδρας κατά το έτος 1830, των κατεστραμμένων πυρπολικών και άλλων λογαριασμών που συντάχθηκε το 1858 (Κ4α_3).
7. Διαταγές προς το Κοινό της Ύδρας του "Διβανίου του Βασιλικού Τερσανά", ναυτικά διπλώματα και διαβατήρια (1808-1836) (Κ4β).

Γράμματα του Αλή πασά Τεπελενλή, του Βελή πασά, Βελή μπέη κ.λπ. απευθυνόμενα προς διάφορες οθωμανικές αρχές σχετικά με την Πόρτα των Αγράφων, προς τον Δερβέναγα Τρικάλων, τον ηγούμενο της Μονής Δουσίκου κ.λπ. καθώς και ένα αντίγραφο επιστολής του Επισκόπου Σταγών.

Συλλογή οθωμανικών και καραμανλίδικων εγγράφων και εντύπων σχετικά με την Κοινότητα Ταβλοσούν της Καισαρείας της Μικράς Ασίας:

• Έγγραφο του υπουργείου Οικονομικών προς την υποδιοίκηση Καισαρείας αναφορικά με τη σύνταξη καταλόγου πόλεων και χωριών με ελληνικούς πληθυσμούς για την είσπραξη φόρων του Δημοσίου και του Πατριαρχείου (1863).
• Πίνακας με τους φόρους που αναλογούν στη μερίδα κάθε ραγιά ή ισλάμ στην περιοχή της Καισαρείας (1840).
• Διάφορες αγωγές και δικαστικές αποφάσεις για οικονομικές και κτηματικές διαφορές (1865-1866),
• Έγγραφα σχετικά με αίτημα αποφυλάκισης,
• Μία ιδιωτική επιστολή σχετικά με εμπορικές δοσοληψίες στα καραμανλίδικα (1823),
• Μία εγκύκλιο της Επιτροπής των Ελεών υπέρ των Φιλανθρωπικών Καταστημάτων Κωνσταντινούπολης προς την ορθόδοξη Κοινότητα Ταβλοσούν στα καραμανλίδικα.
• Ένα φύλλο της εφημερίδας "Ζενπούρ" (Κωνσταντινούπολη, 30 Μαρτίου 1866) στα καραμανλίδικα
• Ένα φύλλο της εφημερίδας "Ceride-i Havadis" (Κωνσταντινούπολη 1853) στα οθωμανικά.

Συλλογή εγγράφων που περιλαμβάνει:

1. Εικοσιτέσσερα (24) έγγραφα των ετών 1824-1839, από τα οποία ενυπόγραφα του Οδυσσέα Ανδρίτζου, Γ. Μαυρομμάτη, Μιχ. Τοσίτζα, Εμ. Σπυρίδωνος, Χριστόδουλου Χατζηπέτρου, Νικολάου Στουρνάρη, Πετρ. Μαυρομιχάλη, Κωνσταντή Μασκλαβάνη, πασά των Ιωαννίνων (1830), πασά της Όχριδος (1835), εγγυητικά και άλλα γράμματα κατοίκων των Γρεβενών και του Μητροπολίτη Γρεβενών.
2. Πέντε (5) αχρονολόγητα έγγραφα: τεμάχια χάρτου, καταστατικό πατριωτικής αδελφότητας, γράμμα του Τζεφλικόπουλου, τετράφυλλο με ειδήσεις του Αλή πασά,
3. Τεμάχια, στα οποία αναγράφονται λογαριασμοί του 1839 σχετικοί με χαράτσια από τα χωριά: Βαρόσι, Μηλιά, Βεβίστι, Ασπρόκαμπο, Μικρό Σερίνι, Σπάτα, Ζυγώστι, Διμινίτζα, Ραντοσίνιστα, Σίταβο, Κουσκό,
4. Επτά (7) κατάστιχα.
5. Δεκαεπτά (17) χειρόγραφα, κυρίως σπαράγματα, σχεδιάσματα διδακτικά που περιέχουν ύλη φιλολογική, θρησκευτική και μουσική με διαστίχους ερμηνείας.

(Κ18α) Ιδιωτική αλληλογραφία από διάφορες περιοχές:
1.Παροναξίας (1667-1840) και απόσπασμα κτηματολογίου (11 Οκτωβρίου 1665).

2. Αργολίδας (1755-1831).
3. Κέας (1790-1836).
4. Τήνου (1756).
5. Ζακύνθου (1786).
6. Πατρών (1838).
7. Έγγραφα της Επανάστασης του 1821 εκ των οποίων το ένα της Φιλικής Εταιρείας (αχρονολόγητο) και το άλλο του 1827.

(Κ18β) Έγγραφα που αναφέρονται, κυρίως, στην Κοινότητα των Καθολικών στη Σύρο (συμβόλαια, επιστολές προς τον εν Κωνσταντινουπόλει Τερσανά, την Αγία Έδρα, αλληλογραφία του Καθολικού Επισκόπου της νήσου και βιβλίο αυτής, ρίμα σατιρική κ.ά.)
1ος υ/φ.: Σαράντα δύο (42) ιδιωτικά έγγραφα των ετών 1610-1696.
2ος υ/φ.: Πενήντα τρία (53) ιδιωτικά έγγραφα των ετών 1701-1799.
3ος υ/φ.: Δεκαεννιά (19) ιδιωτικά έγγραφα των ετών 1803-1836.
4ος υ/φ.: Εικοσιεννιά (29) ιδιωτικές επιστολές των ετών 1755-1831.
5ος υ/φ.: Έγγραφα επισκόπου Καθολικών Σύρας:
α. Βιβλίο αλληλογραφίας, που περιέχει επιστολές από την 14η Απριλίου 1821 έως 17 Σεπτεμβρίου 1824.
β. Συλλογή επιστολών, μεταξύ των οποίων ένα τετράδιο αντιγράφων αλληλογραφίας , έκθεση της ανακλήσεως του επισκόπου Καθολικών Σύρας στη Ρώμη με χρονολογία 14 Απριλίου 1821, αντίγραφο βούλλας Πάπα Πίου με ημερομηνία 4 Σεπτεμβρίου 1560, όμοιο Πάπα Βενέδικτου με ημερομηνία Αυγούστου 1761.
6ος υ/φ.: Είκοσι (20) έγγραφα Κοινότητας Καθολικών Σύρας των ετών 1733-1815, μεταξύ των οποίων και τετράδιο (registro) του έτους 1788, επιστολές προς διαφόρους Οθωμανούς αξιωματούχους σχετικές προς την φορολογία του νησιού, πράξεις φορολογικές και διαταγή του βασιλικού Τερσανά,
7ος υ/φ.: Εικοσιεπτά (27) έγγραφα- διάφοροι λογαριασμοί των ετών 1744-1828.
8ος υ/φ.: Τρία (3) έγγραφα "Σημειώματα"δύο με σατιρικούς στίχους και ένα με αναγραφή ειδήσεων των Ναπολεόντειων πολέμων.

1. Δεκαέξι (16) τακρίρια (takrir) των Πατριαρχών Κωνσταντινούπολης, Ιπεκίου και Αχρίδας (Αρχιεπισκοπής) προς την Υψυλή Πύλη, ορισμένα εκ των οποίων φέρουν αυτόγραφες διαταγές του Σουλτάνου και σημειώσεις του Δεφτερδάρη (defterdar).
2. Έξι (6) αναφορές του Μεγάλου Βεζύρη στο βοεβοδιλίκι Αθηνών και σε επαναστατικά κινήματα στην Πελοπόννησο και τη Μυτιλήνη.
3. Πέντε (5) έγγραφα αναφερόμενα στα προνόμια των παρά τη Οθωμανική Αυτοκρατορία ξένων και ελληνικών αρχών.

Συλλογή Ιωάννη Χώτζη:

1. Επτά (7) επιστολές και έγγραφα από το αρχείο Δασίου.
2. Δέκα (10) επιστολές της περιόδου πριν από την Επανάσταση του 1821.
3. Έντεκα (11) έγγραφα της εποχής του Αλή πασά, λογαριασμοί και διαταγές (1810-1815).
4. Λογαριασμός (1805).
5. Λογαριασμός (1807).
6. Επτά (7) επιστολές και ένας (1) λογαριασμός αναφερόμενος σε Φαναριώτικες οικογένειες.
7. Σημείωμα (1808).
8. Ιδιωτικό κατάστιχο, που περιέχει σημειώματα και λογαριασμό (1800-1809).
9. Σημείωμα (1812).
10. Παλιό αντίγραφο διατάξεων της Φιλόμουσου Εταιρείας.
    11-12. Κατάλογοι.
11. Φορολογικός πίνακας που εμφανίζει το αντίτιμο των δημόσιων κτημάτων του σαντζακίου Ναυπάκτου,
12. Διαταγή με οπισθόγραφο των μαστόρων "'όπου δουλεύουν στο κάστρο Παντοκράτορα" (Πρέβεζα, 1818),
13. Τεύχος (1829).

Συλλογή Ιωάννη Χώτζη:

1. Οθωμανικό έγγραφο σχετικά με ειδήσεις από το Ναύπλιο (1825).
2. Επιστολή με πολιτικές ειδήσεις από την Κωνσταντινούπολη (1789).
3. Τρία (3) ενετικά έγγραφα του τέλους του 17ου αι.
4. Πενήντα εννιά (59) οθωμανικοί φετφάδες.
5. Έγγραφο που περιέχει έκθεση υπαλλήλου του σουλτάνου.
6. Επτά (7) αυτοκρατορικά φιρμάνια και βεράτια.
7. Δεκαπέντε (15) εκθέσεις μεγάλων βεζιρηδων (τακρίρια) προς τους σουλτάνους.

Συλλογή της Διαμάντως Σταρά:

1. Έγγραφα από την Ήπειρο των ετών 1813-1868, εκ των οποίων μπουγιουρντί των: Αλή Πασά (23 Μαρτίου 1813), Βεζύρη Ομέρ Πασά (23 Ιανουαρίου 1824, 20 Μαΐου 1824 και 2 Σεπτεμβρίου 1824), Βεζύρη Μεχμέτ Ρεσήτ Πασά (19 Ιουνίου 1828), (19 Ιουνίου 1828), Πασά των Ιωαννίνων (17 Οκτωβρίου 1841), που παρέχουν φορολογικές και άλλες ευκολίες στο Μήτζη Παπά Γιώργη Παπά από Γρατζανά,
2. Έντυπο που περιέχει αυτοκρατορικό φιρμάνι προς τον Μαχμούτ Νεδίμ πασά, 30 Σεπτεμβρίου 1875,
3. Φύλλο της εφημερίδας "Ιωάννινα", 2 Μαρτίου 1882.

Χειρόγραφο που περιλαμβάνει δύο τόμους (σ. 1-363 και 1-665), και φέρει γενικό τίτλο "Βιογραφίαι των Ελλήνων Μεγάλων Διερμηνέων του Οθωμανικού Κράτους ή Σελίδες της μετά την άλωσιν Εθνικής Ιστορίας. Γράψαντος Επαμ. Ι. Σταματιάδου Εταίρου πολλών σοφών Εταιρειών. Εν Σάμω". Ο πρώτος τόμος, "Σελίδες της μετά την άλωσιν Εθνικής Ιστορίας" περιλαμβάνει τα εξής πέντε κεφάλαια: "Το εθνικόν ναυάγιον", "Η Εκκλησία σώτειρα κιβωτός", Οι επιπλέοντες", "Φαναριώται", "Οι Έλληνες αυθένται εν ταις παρίστριοις ηγεμονίαις". Ο δεύτερος τόμος περιέχει βιογραφίες των μεγάλων δραγουμάνων κατά χρονολογική σειρά, από το 1661 έως το 1821 (ενδεικτικά: Νικούσιος, Μαυροκοδράτοι, Σούτσοι, Καρατζάδες, Υψηλάντης, Μουρούζηδες). Τα κείμενα συνοδεύονται από έγχρωμη εικονογράφηση.

Το αρχείο περιλαμβάνει κώδικες, φιρμάνια, πατριαρχικά γράμματα, βεράτια και διάφορα άλλα τεκμήρια που παρήχθησαν ή συγκεντρώθηκαν από τα λειτουργούντα στο πλαίσιο της οθωμανικής διοίκησης εκκλησιαστικά και κοινοτικά όργανα του ελληνορθόδοξου μιλλέτ των περιοχών της Μικράς Ασίας, του Πόντου και της Ανατολικής Θράκης.

Ο κύριος όγκος του αρχειακού υλικού αποτελείται κυρίως από κώδικες που κρατούσαν οι κατά τόπους εκκλησίες και κοινότητες, αφορούν τον 19ο αιώνα και φτάνουν έως το 1922. Το υλικό χωρίζεται κατά κύριο λόγο σε δύο κατηγορίες, τους κοινοτικούς και τους εκκλησιαστικούς κώδικες, η τυπολογία των οποίων παρουσιάζει μεγάλη ποικιλία ενώ υπάρχουν και κώδικες που μετέχουν και των δύο κατηγοριών (κοινοτικοί και εκκλησιαστικοί). Οι κοινοτικοί κώδικες περιλαμβάνουν πρακτικά συνεδριάσεων της δημογεροντίας, κανονισμούς σωματείων, πωλητήρια, δωρητήρια, συμβόλαια δασκάλων, έξοδα συντήρησης σχολείων, καταλόγους βιβλιοθηκών, πατριαρχικές εγκυκλίους, όπως διάφορες ενθυμήσεις για σεισμούς, λιμούς κ.λ.π. αλλά και πληροφορίες για δοσοληψίες με την οθωμανική εξουσία μέσω των φόρων και των απογραφών. Στους εκκλησιαστικούς κώδικες καταγράφονται έσοδα και έξοδα, βαπτίσεις, γάμοι, διαθήκες, θέματα διαχείρισης της εκκλησιαστικής και μοναστικής περιουσίας, το φιλανθρωπικό έργο αλλά και τα ιερά σκεύη και τα κτήματα των εκκλησιών και μοναστηριών με την προοπτική της Ανταλλαγής.

Στο αρχείο εκτός από τους κώδικες διασώζονται φιρμάνια, βεράτια και πατριαρχικά γράμματα κυρίως από τις περιοχές της Καππαδοκίας, του Πόντου, της Κιλικίας, της Ανατολικής Θράκης και της Βιθυνίας που αποτυπώνουν το πλαίσιο των σχέσεων των κοινοτικών και εκκλησιαστικών οργάνων του ελληνορθόδοξου μιλλέτ με την οθωμανική διοίκηση και το Οικουμενικό Πατριαρχείο.

Προσωπογραφία του Sinam Bassa
Σχεδιαστής: Georgius Wickgram Spirensis
Χαράκτης: Dominicus Custodis

Προσωπογραφία του Αλή Πασά.
Σχεδιαστής: Stone, F.
Χαράκτης: Finden, W.
Εκδότης: A. Fullarton & Co
Τόπος έκδοσης χαρακτικού: London & Edimburgh
Τόπος έκδοσης χαρακτικού: [Λονδίνο - Εδιμβούργο]

Προσωπογραφία του Αλή Μπέη καπουδάν Πασά, Τούρκου αξιωματούχου, υπεύθυνου για την καταστροφή της Χίου.

Προσωπογραφία του Χουρσίτ Πασά.

Προσωπογραφία του Χουρσίτ Πασά.

Απεικόνιση του Βαγιαζήτ Α΄, σουλτάνου της Οθωμανικής Αυτοκρατορίας (1354 -1403).
Χαράκτης: Rosseti
Χαράκτης: Lenghi, G.
Εκδότης: Pagnoni, Francesco
Τόπος έκδοσης χαρακτικού: Milano
Τόπος έκδοσης χαρακτικού: [Μιλάνο]

Χαρακτικό με δύο θέματα. Πρόκειται για δύο προσωπογραφίες: η πρώτη είναι του Ανδρέα Μιαούλη και η δεύτερη του Μαχμούτ Β' (1785 – 1839).

Τμήμα του αρχείου του αγωνιστή της Επανάστασης του 1821 Ρήγα Παλαμήδη (1794-1872). Περιλαμβάνει αποδείξεις πληρωμής (1800-1801), αναφορές (1808, 1820-1821), καταγραφή εξόδων του ναΐπη της Τριπολιτσάς (1811), χοτζέτια από τις περιοχές της Αρκαδίας και της Τριπολιτσάς (1774-1818), ένα ταπί σπαχήδων από τους Μολάους Καρύταινας (1799-1800), ένα τεφτέρι καταγραφής των κρατικών εσόδων και εξόδων των πρώιμων και όψιμων προϊόντων των τσιφλικιών των καζάδων του Άργους και του Ναυπλίου (1819-1820), δημόσια έγγραφα και, κυρίως, δημόσια και ιδιωτική αλληλογραφία του Ρήγα Παλαμήδη:
φ. 1, Έγγραφα Τουρκικά (31 έγγραφα),
φ. 2, Έγγραφα (75 έγγραφα),
φ. 3, Έγγραφα 1836-1841 (54 έγγραφα),
φ. 4, Έγγραφα 1842-1852 (121 έγγραφα),
φ. 5, Έγγραφα 1853-1854 (185 έγγραφα),
φ. 6, Έγγραφα 1855-1862 (161 έγγραφα),
φ. 7, Έγγραφα 1863-1870 (107 έγγραφα),
φ. 8, Έγγραφα 1871-1874 & αχρονολόγητα (120 έγγραφα)

Τρία (3) οθωμανικά έγγραφα, πιθανώς φιρμάνια σουλτανικά, και μετάφραση ελληνική φιρμανίου "προς τον κριτήν της Κορίνθου" με ημερομηνία Σεπτέμβριος 1797.

Ικετήριος αναφορά προυχόντων Πρέβεζας προς Τούρκο πασά.

Έγγραφο του "Ισμαήλ Πασά ελέω θεού Βεζύρη και καπουδάν πασά" με το οποίο διορίζεται μέλος της οικογένειας Γρηγοράκη εκ νέου "πάς πογού" (ηγεμών) Μάνης (αωιθ Νοεμβρίου κε').