Αρχείο Αλέξανδρου Μαυροκορδάτου.
Φ. 1: τρία ημερολόγια του Αλ. Μαυροκορδάτου της περιόδου 1834-1837, Γενικό Πρωτόκολλο του Προέδρου του Εκτελεστικού, 1822-1823, "Βιβλίον Κάσσας Μετρητών. Μεσολόγκιον 1822", πρωτόκολλο επιστολών προς Μαυροκορδάτο της περιόδου 1825 - 1826.
Φ. 2: Μυστικό Πρωτόκολλο του Προέδρου του Εκτελεστικού Α. Μαυροκορδάτου των ετών 1822 - 1823, τεύχος με σημειώσεις για τα Ιόνια νησιά, κατάστιχο λογαριασμών "Η Κάσσα των Μετρητών του Πραΐδη" 1822-1823, επιστολές από Βιέννη, Βουκορέστι και Πίζα της περιόδου 1815-1820, γράμμα της Κοινότητας Ύδρας του 1803 με τον πρώτο ναυτεμπορικό νόμο του νησιού, έγγραφα της περιόδου 1821-1822.
Φ. 3: Έγγραφα του 1823 (Ιανουάριος - Ιούνιος)
Φ. 4: Έγγραφα του 1823 (Ιούλιος - Δεκέμβριος)
Φ. 5: Έγγραφα του 1824 (Ιανουάριος - Μάρτιος)
Φ. 6: Έγγραφα του 1824 (Απρίλιος - Ιούλιος)
Φ. 7: Έγγραφα του 1824 (Αύγουστος)
Φ. 8: Έγγραφα του 1824 (Σεπτέμβριος)
Φ. 9: Έγγραφα του 1824 (Οκτώβριος - Δεκέμβριος)
Φ. 10: Έγγραφα του 1825 (Ιανουάριος - Ιούλιος)
Φ. 11: Έγγραφα του 1825 (Αύγουστος - Δεκέμβριος)
Φ. 12α: Έγγραφα του 1826 (Ιανουάριος - Ιούλιος)
Φ. 12β: Έγγραφα του 1826 (Αύγουστος - Δεκέμβριος)
Φ. 13: Έγγραφα του 1827 (Ιανουάριος - Δεκέμβριος)
Φ. 14: Έγγραφα του 1828 (Ιανουάριος - Μάρτιος)
Φ. 15: Έγγραφα του 1828 (Απρίλιος - Δεκέμβριος)
Φ. 16: Έγγραφα του 1829
Φ. 17: Έγγραφα του 1830-1831
Φ. 18: Έγγραφα του 1832
Φ. 19: Έγγραφα του 1833-1836
Φ. 20: Έγγραφα του 1837-1840
Φ. 21: Έγγραφα του 1841
Φ. 22: Έγγραφα του 1842
Φ. 23: Έγγραφα του 1843
Φ. 24: Έγγραφα του 1844 (Ιανουάριος - Μάιος)
Φ. 25: Έγγραφα του 1844 (Ιούνιος - Δεκέμβριος)
Φ. 26: Έγγραφα του 1845-1853
Φ. 27: Έγγραφα του 1854-1859
Φ. 28: Έγγραφα του 1860-1880 και 1837-1870.

Αρχείο του κόμητος Δημητρίου Καρούσου από την Κεφαλονιά, βουλευτή της Ιονίου Βουλής, επάρχου Κεφαλονιάς, γερουσιαστή και τελευταίου προέδρου της Ιονίου Γερουσίας και μετέπειτα βουλευτή Κεφαλονιάς στην Ελληνική Βουλή:

1. Νοταριακά (1662-1908)
2. Αλληλογραφία με διάφορα εξέχοντα πρόσωπα (1832-1881).
3. Απόγραφα, αποσπάσματα πρακτικών, κ.ά. (1853-1862)
4. Γράμματα επίσημα (1841-1852).
5. Οικογενειακό δέντρο Καρούσου.
6. Δίπλωμα διδακτορικό του Ν. Φίτσιου του 1898
7. Έγγραφα περί του τίτλου του κόμητος (1705-1840).
8. Έντυπα: εφημερίδες, προκηρύξεις κ.ά.
9. Ευρετήριο αλφαβητικό προσώπων με τα οποία είχε οικονομικές και άλλες σχέσεις ο Καρούσος.
10. Προσκλήσεις του Βασιλικού Αυλαρχείου (1866-1868).
11. Πρόσκληση σε γάμο του 1868.
12. Χειρόγραφο περί απονομής συντάξεως (1850-1865).
13. Χειρόγραφα της Αγγλικής Προστασίας στα Επτάνησα (1817-1864).
14. Κατάλογοι υπογραφών κατοίκων της Κεφαλονιάς που ευγνωμονούν τον κόμη Καρούσο.

Το ίδιο το αρχείο παρέχει πλούσιες πληροφορίες για τον τρόπο λειτουργίας της διοίκησης των Ηνωμένων Πολιτειών των Ιονίων Νήσων κατά την ύστατη περίοδο της αγγλοκρατίας, καθώς τα έγγραφα αποτυπώνουν όχι μόνο τις αρμοδιότητες που είχαν αποδοθεί στην Γερουσία, αλλά και τη ροή των εγγράφων μέσα σε όλη τη διοίκηση. Περιλαμβάνει αμιγώς τα εισερχόμενα προς την Ιόνιο Γερουσία έγγραφα, τα οποία αποστέλλονταν προς ενημέρωση αλλά κυρίως για την περαιτέρω γνωμάτευση της Γερουσίας, από διάφορες δημόσιες αρχές των Επτανήσων ή και ιδιώτες.

Από τη μελέτη των εγγράφων προκύπτει ότι η συνήθης οδός διακίνησης των εγγράφων προέβλεπε την αποστολή μέσω του Επάρχου κάθε νησιού των υποθέσεων που απαιτούσαν την επιδοκιμασία της Γερουσίας. Τα έγγραφα απευθύνονταν στο γραμματέα της και εκείνος ανάλογα με τη φύση της υπόθεσης την παρέπεμπε στο αντίστοιχο τμήμα, γενικό ή οικονομικό τμήμα. Το αρμόδιο κάθε φορά τμήμα μελετώντας την υπόθεση πρότεινε προς την Γερουσία τον τρόπο επίλυσης αυτής, ο οποίος αναγραφόταν πάνω στο ίδιο το έγγραφο. Σε αρκετές περιπτώσεις πάνω στο έγγραφο υπάρχει και παραπομπή σε πρακτικό της Γερουσίας. Δε λείπουν ωστόσο, οι περιπτώσεις τόσο ιδιωτών όσο και άλλων δημοσίων λειτουργών που απέστειλαν τα αιτήματά τους απευθείας στην Γερουσία.

Η θεματολογία του αρχείου, που αποτυπώνει και τις αρμοδιότητες της Γερουσίας, περιλαμβάνει: α) οικονομικά θέματα που αφορούν κατά κύριο λόγο δημόσιες δαπάνες του κράτους, οι οποίες απαιτούσαν την επιδοκιμασία της Γερουσίας, β) διοικητικά θέματα που αφορούν τη διοίκηση του προσωπικού των δημοσίων υπηρεσιών (άδειες απουσίας, διορισμοί, προβιβασμοί κ.λπ.) αλλά και εκθέσεις που αφορούν σε ελέγχους διοικητικών πράξεων και γ) δικαστικά θέματα που αφορούν αιτήσεις, ικετηρίους μεταλλαγής και χαριτοδοσίας ποινών κρατουμένων. Στην τελευταία αυτή κατηγορία, συναντά κανείς πλήθος δικαστικών αποφάσεων συνημμένες των αιτήσεων χαριτοδοσίας των κρατουμένων.

Αρχείο Μητροπολίτη Ιγνάτιου Ουγγροβλαχίας:

1. Τέσσερις (4) επιστολές: επιστολή του Εμ. Παπαδόπουλου από τη Ρωσία στις 15 Μαρτίου 1807 προς τους Καπεταναίους της Ελλάδας και Ηπείρου, επιστολή του κόμητος Γ. Μοτσενίγου από την Κέρκυρα στις 19 Μαρτίου 1807 προς τους Καπεταναίους της Ελλάδας και Ηπείρου, επιστολή του ίδιου από την Κέρκυρα στις 19 Μαρτίου 1807 προς τον Μητροπολίτη Ιγνάτιο, επιστολή καπεταναίων από την Αγία Μαύρα (Λευκάδα) στις 3 Απριλίου 1807 προς τον Ιγνάτιο.
2. Συνθήκη Επτανησίων και Αλή Πασά στην Κέρκυρα στις 9 Νοεμβρίου 1803.
3. Έγγραφα της Φιλομούσου Εταιρείας των ετών 1813, 1815, 1817 και 1820 και της Φιλεκπαιδευτικής Εταιρείας του 1836.
4. Εξήντα εννιά (69) επιστολές προς τον Ιγνάτιο των ετών 1799, 1807, 1816 έως 1827.
5. Ογδόντα πέντε (85) επιστολές προς τον Ιγνάτιο στη γαλλική γλώσσα των ετών 1809-1827.
6. Είκοσι μία (21) επιστολές και έγγραφα προς τον Ιγνάτιο σχετικά με την Επανάσταση των ετών 1819-1827
7. Διάφορα:
   -Τεύχος με αντίγραφο των Πρακτικών της Β' Εθνικής των Ελλήνων Συνελεύσεως, ήτοι του υπ΄αριθμ. 12 του Κώδικα των Νόμων περί Οργανισμού των Ελληνικών Επαρχιών.
   -Αντίγραφο του υπ' αριθμ. 12 του Κώδικα των Νόμων.
   -"Πρακτικά της Β΄ Εθνικής των Ελλήνων Συνελεύσεως".
   -"Πρόσκαιρος γενικός Οργανισμός της Πελοποννήσου και των άλλων μερών της Ελλάδος μέχρι της αποκαταστάσεως του Έθνους",
   -"Διαταγή της Ημέρας" Αλέξανδρου Υψηλάντη εν Ριμνίκω (Μολδοβλαχίας) τη 8η Ιουνίου 1821,
   • Δίφυλλο που συντάχθηκε στο Λιβόρνο στις 30 Νοεμβρίου 1827 και περιέχει συμφωνητικό των ομογενών του Λιβόρνο περί βοηθείας των αιχμαλώτων Ελλήνων.
     -"Grece, cause de sa Resolution et son Etat Actuel. Le 1/13 Octobre 1822. Pise (Πίζα)",
     -"La Grece en 1823". Pise (Πίζα) le 18/30 Avril 1824,
     -Το Σύνταγμα της Α' Εθνικής Συνελεύσεως,
     -Ίσον (αντίγραφο) από το μπουγιουρντί του Βεζίρ Η(Ο)μέρ Πασιά Εφεντός μας, Νεχώρι 8 Απριλίου 1823.
     -"Traduction de la Lettre de Lord Thomas Erskine au Comte de Liverpool au sujet des Grecs".
     -"Copie de la lettre de M. Eynard au Gouvernt grec. Geneve 27 Fevrier (1826?)".
     -Αντίγραφο επιστολής του Eynard στα γαλλικά προς την Ελληνική Κυβέρνηση εκ Beaulieu στις 27 Νοεμβρίου 1826.
     -"Declaration aux Puissances Chretiens" εκ Κορίνθου τη 15 Απριλίου 1822 εκδοθέν υπό του Εκτελεστικού.
     -Αντίγραφο των πρακτικών της Συνελεύσεως της Δυτικής Χέρσου Ελλάδος, Μεσολόγγι 4 Νοεμβρίου 1821.
     -"Το εκφωνηθέν λογίδριο παρά του Σχολαρχούντος διδασκάλου Κων. Βαρδαλάχου της εν Βουκουρεστίω Αυθεντικής Σχολής κατά την επισήμως γενομένη έναρξιν των μαθημάτων τη α' Σεπτ. 1820" και
     -¨Λογίδριον εκφωνηθέν παρά του εκλαμπροτάτου Πεηζαδέ Νικολάου Σούτζου κατά την επισήμως γενομένην έναρξιν των μαθημάτων εν τη Αυθεντική Σχολή τη εν Βουκουρεστίω τη α' Σεπτ. 1820".

Έντυπο "Πεντηκονταετηρίς της Ενώσεως της Επτανήσου 1864-1914, Δελτίον Γ".

Συλλογή με έντυπες δηλώσεις και διάφορες προκηρύξεις σχετικές με τις εκλογές του 1864 στα Επτάνησα, αμέσως μετά την ενσωμάτωσή τους στο ελληνικό κράτος.

Συλλογή εγγράφων από τα Επτάνησα: έγγραφα της Διοικήσεως των Ιονίων Νήσων (1808-1821), διάφορες αιτήσεις κατοίκων Κεφαλονιάς προς τον Έπαρχο Κεφαλονιάς (1845-1850), νοταριακό έγγραφο από την Κέρκυρα, έγγραφο του Ηγουμενοσυμβουλίου της Μονής Ασωμάτων Πετράκη προς τον πρώην ηγούμενο Νεκτάριο Κωνσταντή, κ.ά.

Συλλογή εγγράφων από τα Επτάνησα, κυρίως από την Ιθάκη, που αναφέρονται στον πρόξενο της Ρωσίας και της Δανίας στην Ιθάκη Δημήτριο Αλεξάνδρου Νικολάου.

Συλλογή εγγράφων από Κεφαλονιά που περιλαμβάνει επιστολές του Κ. Λομβάρδου από την Κέρκυρα και τη Ζάκυνθο προς τον Αιμ. Πυλαρινό (στις 30/11/1859, 21/12/1859, 24/10/1860 και 04/08/1861).

Συλλογή εγγράφων από την Κεφαλονιά που περιλαμβάνει επιστολές του Μ.Σ. Ιδρωμένου από την Κέρκυρα προς τον Αιμ. Πυλαρινό.

Συλλογή εγγράφων από την Κεφαλλονιά που περιλαμβάνει επιστολές του Ιωσήφ Μομφεράτου, ηγετικού στελέχους των Ριζοσπαστών στην Ιόνιο Βουλή, τρεις (3) από Οθωνούς και δύο (2) από Ερείκουσα, όπου ήταν εξόριστος (στις 12/10/1849, 20/12/1849, 03/03/1850, 05/10/1854 και 05/09/1856).

Συλλογή εγγράφων από την Κεφαλονιά που περιλαμβάνει επιστολές του Ανδρέα Μομφεράτου, μία (1) από Κέρκυρα και δύο (2) από Αργοστόλι, προς τον Αιμίλιο Πυλαρινό στο Παρίσι.

Συλλογή εγγράφων από το Ιστορικό Αρχείο Παξών και αφορούν την περίοδο 1942-1946: διαταγές των Εθνικών Ομάδων Ελλήνων Ανταρτών (ΕΟΕΑ) και του Φρουραρχείο Παξών του 1944, έγγραφα και διαταγές των ιταλικών στρατιωτικών και πολιτικών αρχών και της Μεραρχία Άκουι, εφημερίδα "Πολεμικά Νέα" του Γενικού Αρχηγείου ΕΟΕΑ (27/9/1944) και πρόγραμμα εορτασμού της 25ης Μαρτίου 1946 στους Παξούς.

Συλλογή εντύπων και εγγράφων από τα Επτάνησα.

Συλλογή Κώστα Καιροφύλα:

1. Αντίγραφα εγγράφων και χειρογράφων του Γάλλου Jean Savant αναφερόμενα στην ιστορία των Επτανήσων και της υπόλοιπης Ελλάδας (1816-1830).
2. Σαράντα πέντε (45) εικόνες με θέματα από γεγονότα και πρόσωπα της Ελληνικής Επανάσταση.
3. Αντίτυπο μοναδικό του ακυκλοφόρητου βιβλίου του Jean Savant, "Αι Ιόνιοι νήσοι υπό τον Ναπολέοντα I. Επιστολαί Donzelot, Dessiers, Lesseps & Pouqueville II. Ο Νικόλαος Μυλωνάς και η Ακαδημία Αθηνών", Εν Αθήναις, 1940.
4. Μελέτη του J. Savant "Νicolas Milonas et la renovation de l'Academie de Platon" (τεύχος δακτυλογραφημένο 75 σελίδων).

Συλλογή του Φώτου και της οικογένειας Τζαβέλα που περιλαμβάνει:

1. Χειρόγραφο σημειωματάριο και ημερολόγιο του Φώτου Τζαβέλα από 14 Φεβρουαρίου έως 22 Απριλίου 1792, υποδείγματα επιστολών, ενθυμήσεις γεννήσεων προσώπων της οικογένειας, λογαριασμούς, κ.ά.
2. Χειρόγραφο σημειωματάριο με οικογενειακές ενθυμήσεις.
3. Επιστολές (Αλή Πασά, Χασάν Τζαπάρη, Νότη Μπότσαρη, Γ. Κίτζου, Ιωάννη και Αυγουστίνου Καποδίστρια, διαφόρων Αλβανών και Σουλιωτών κ.ά.), ομολογίες, αποδείξεις, δανειστικά, τεζκερέδες, έγγραφα της ρωσικής κατοχής των Επτανήσων, της δεύτερης Γαλλοκρατίας των Επτανήσων, της Επανάστασης του 1821, της Καποδιστριακής περιόδου, της Οθωνικής περιόδου, κ.ά.

Πράξη παραχώρησης γης, νοταριακή πράξη μεταβίβασης γης, αρχιερατικό πρόσταγμα Σωφρονίου, Αρχιεπισκόπου Κεφαλληνίας, Ζακύνθου, και Ιθάκης της 27ης Φεβρουαρίου 1774 περί του παπά Ανδρέα Καλλίνικου.

Συλλογή που περιλαμβάνει
Α. Έντυπα:

1. Γενικοί Λογαριασμοί της Οικονομικής Διαχειρίσεως του Κράτους από 21 Ιανουαρίου 1833 μέχρι 31 Δεκεμβρίου 1843. Μετά της προς τον Βασιλέα Εκθέσεως του Υπουργού των Οικονομικών. Αθήνησιν, εν έτει 1849,
2. Μονόφυλλο επικολλημένο σε φύλλο χαρτιού όπου βενετικά σημειώματα με τίτλο "Διοίκησις των Ιονικών Νήσων. Ημερίς Κριτής της Ειρήνης εξ αναζητήσεως του Κυρ. Δομηνίγγου Γρόφου...Εδόθη τας 4/16 Ιουνίου 1814",
3. Μονόφυλλο "Προς τους απανταχού Συμπολίτας και Ομογενείς Έλληνας...Εν Αθήναις τη 18 Μαΐου 1880 ο Πρόεδρος Σ. Σωτηρόπουλος, ο Γραμματεύς Τιμολέων Φιλήμων, ο Ταμίας Μ. Χαρίλαος, τα Μέλη κλπ., περί της καταστάσεως των φυλακών" (εγκύκλιος άγνωστου σωματείου).
   Β. Χειρόγραφα:
4. Αντίγραφο της 15ης Φεβρουαρίου 1831 με τίτλο "Διδαχή του εν Αγίοις Πατρός ημών Κοσμά του Ιερομάρτυρος",
5. Έκθεση δακτυλογραφημένη "Ίδε οι άνθρωποι το πρώτον" σχετικά με την εκλογή του Επισκόπου Αρκαδίας.
   Γ. Έγγραφα:
6. Επιβεβαιωτήριο του Πατριάρχη Ιεροσολύμων Δαμιανού σχετικά με τη γνησιότητα του τιμίου ξύλου που δόθηκε στην Φλώραν Αγ. Κουτσογιάννη (20 Απριλίου 1911).
7. Επιβεβαιωτήριο του Πατριάρχη Ιεροσολύμων Δαμιανού σχετικά με τη γνησιότητα του τιμίου ξύλου που δόθηκε στην Καλλιόπη Κ. Τσουκαλά (20 Απριλίου 1911).
8. Τρία έγγραφα προς τον Ι. Παπαδόπουλο καθηγητή Πανεπιστημίου: α. του Πατριάρχη Κωνσταντινούπολης (20 Μαρτίου 1949), β. του δημάρχου της Lyon και προέδρου της Εθνικής Συνέλευσης της Γαλλίας Edouard Herriot (19 Ιουλίου 1947), γ. του προξένου του Ισραήλ στην Αθήνα (28 Απριλίου 1949).
9. Διάταγμα του Γεώργιου Α' (14 Νοεμβρίου 1881).
10. Επιστολή του Δημητρ. Π. Πασχάλη από την Άνδρο σε άγνωστο συγγραφέα μελέτης για τον Θ. Καΐρη (29 Ιανουαρίου 1926)
    Δ. Οθωμανικό φιρμάνι.