1) Τμήμα 1ο Φάκελος ημερησίων διαταγών ΔΕΕΠ. Φάκελοι εγγραφής πτυχιούχων ναυπηγών στο μητρώο ΔΕΕΠ. Φάκελος αλληλογραφίας εκκαθάρισης αρχείου. Φάκελοι προστίμων για παραβάσεις ασφάλειας ναυσιπλοΐας, προστασίας περιβάλλοντος. Παρατηρήσεις, συστάσεις για αντικανονικότητες που διαπιστώθηκαν σε έκτακτες επιθεωρήσεις πλοίων 2) Τμήμα 3ο Διαγραφές πλοίων με διακριτικό σταθμό πλοίου (Δ.Σ.Π.). Πιστοποιητικά πλοίων με ξένη σημαία εκδοθέντα από ΔΕΕΠ. Πιστοποιητικά πλοίων εκδοθέντα από ΔΕΕΠ. Εκδοθείσες άδειες Τ/Κ σταθμών πλοίων.