Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: έγγραφα περί σκαφών αναψυχής
Β. Αλληλογραφία: έγγραφα περί προστασίας θαλάσσιου περιβάλλοντος, αλληλογραφία περί τοπικού σχεδίου αντιμετώπισης ρύπανσης
Γ. Λιμενική Αστυνομία: τριμηνιαία και εξαμηνιαία δικαιολογητικά Λιμενικής Αστυνομίας
Δ. Στοιχεία Αλιείας: άδειες αλιείας, έγγραφα περί αλιείας ξιφία και περί διενέργειας αλιείας από αλιευτικά σκάφη ξένης εθνικότητας.