Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με Λιμενικές Αρχές και τον Οίκο Ναύτου, έγγραφα που αφορούν σε άνεργους ναυτικούς, έκδοση ναυτικών φυλλαδίων και χρηματαποστολές
Β. Οικονομικά Στοιχεία: πινάκια μισθοδοσίας προσωπικού του Λιμεναρχείου, έγγραφα που αφορούν σε οικογενειακά επιδόματα, σε συντάξεις και συλλογικές συμβάσεις εργασίας, οικονομικά έγγραφα Γραφείου Διαχείρισης και Γραφείου Κίνησης
Γ. Στοιχεία Πλοίων: έγγραφα σχετικά με τον έλεγχο εμπορικών πλοίων.

Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με το Γενικό Νοσοκομείο Σπάρτης, τις Λιμενικές Αρχές και τον Οίκο Ναύτου, έγγραφα περί χρηματαποστολών, αποδημίας - μετανάστευσης και ναυτολογίων
B. Οικονομικά Στοιχεία: βιβλία ταμείου, έγγραφα απολογισμών, έγγραφα δαπανών σε φάρμακα και ανεργία, έγγραφα περί μισθοδοσίας και συνταξιοδότησης προσωπικού Λιμεναρχείου
Γ. Δικαστικά Στοιχεία: έγγραφα σχετικά με τιμωρημένους και διωκόμενους ναυτικούς
Δ. Στοιχεία Προσωπικού: εγκύκλιοι κατάταξης στο λιμενικό σώμα, ατομικοί φάκελοι προσωπικού Λιμεναρχείου.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με τον Οίκο Ναύτου και το Ναυτικό Απομαχικό Ταμείο (Ν.Α.Τ.), έγγραφα περί αναζητήσεων και ανέγερσης Ηρώου Πεσόντων στον πόλεμο 1940-41.
Β. Στοιχεία Λιμανιών και Ακτών: πίνακες λιμένων, φαροδείκτης ελληνικών ακτών, έγγραφα περί κατάρτισης χαρτών λιμένων.

Το αρχείο συγκροτείται από φακέλους αλληλογραφίας του Λιμεναρχείου με την Αστυνομία και τον Οίκο Ναύτου, σχετικά με: ναυάγια, αλιεία, γυμνιστές, ρύπανση, εορτασμούς, απογραφή ναυτικών, ακτοπλοϊκές συγκοινωνίες, έκδοση αδειών τραπεζοκαθισμάτων και εκπαίδευση προσωπικού Λιμεναρχείου.

Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία του Λιμεναρχείου με τον Οίκο Ναύτου και τη Λιμενική Αστυνομία
Β. Οικονομικά Στοιχεία: βιβλία εσόδων, έγγραφα οδοιπορικών εξόδων, δικαιολογητικά οικονομικής διαχείρισης, έγγραφα αποζημίωσης μελών Τοπικού Κλιμακίου Επιθεώρησης Εμπορικών Πλοίων (Τ.Κ.Ε.Π.), τιμολόγια ιατρών, δικαιολογητικά καυσίμων χερσαίου πλωτού
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: προκηρύξεις προσλήψεων στο Λιμεναρχείο και αιτήσεις υποψηφίων, έγγραφα υγειονομικής περίθαλψης προσωπικού του Λιμεναρχείου.

Αλληλογραφία, περί δρομολογίων πλοίων, πίνακες διακίνησης επιβατών, πλοίων, οχημάτων, άγονων γραμμών, ναυτιλιακή κίνηση, δικαιολογητικά, δελτία καιρού - συμβάντων, δηλώσεις απωλείας, εξαφανίσεις προσώπων, άδειες διάφορες, εκχώρηση αιγιαλού, δικογραφίες, αλληλογραφία, αιτήσεις διάφορες, εισπράξεις, ναυτολογήσεις, καταστάσεις προσωπικού, εκδόσεις βεβαιώσεων, άνεργοι ναυτικοί, απολογισμοί, Οίκος Ναύτου, φάκελοι εκλογών, εκδόσεις αδειών αλιείας και κυκλοφορίας πλοίων, διάφορες απογραφές.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: πίνακες κρουαζιερόπλοιων, πίνακες προσεγγίσεως πλοίων υπό ξένη σημαία, άδειες, καταστάσεις και στατιστικά στοιχεία απόπλου και κατάπλου πλοίων και θαλαμηγών, καταστάσεις φορτώσεως σε πλοία, έγγραφα περί ονομασιών και σημαιών πλοίων και περί ελέγχων στελέχωσης πλοίων, στατιστικά στοιχεία θαλάσσιων συγκοινωνιών, δελτία συμβάντων, βιβλία διαιρέσεως φυλάκων πληρώματος, βιβλία ημερήσιας αναφοράς πληρώματος
Β. Οικονομικά στοιχεία: μπλοκ με αποδεικτικά εισπράξεως Λιμενικής Αρχής και Ειδικού Κλάδου Οικονομικής Ενίσχυσης Μερισματούχων Ναυτικών (Ε.Κ.Ο.Ε.Μ.Ν.), βιβλία αποθήκης και κατανάλωσης καυσίμων Λιμενικού Σταθμού Μονεμβασίας, έγγραφα περί τηλεπικοινωνιακών και φαρικών τελών
Γ. Αλληλογραφία: περί κανονισμού χερσαίας ζώνης και αδειών χρήσης αιγιαλού, έγγραφα περί κίνησης μοτοσυκλετών και περί λειτουργίας αιγιαλού και παραλίας
Δ. Στοιχεία Νομοθεσίας - Παραβάσεων - Προστίμων : έγγραφα περί οργανωμένου εγκλήματος
Ε. Στοιχεία Αλιείας: ατομικές, ερασιτεχνικές και επαγγελματικές άδειες αλιείας, άδειες αλιείας πελαγικών ψαριών, ημερολόγια αλιείας
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: απογραφές ναυτικών, έγγραφα Οίκου Ναύτου.