Έγγραφα σχετικά με τη δράση του Απόστολου Δοξιάδη στην Πανθρακική Ένωση και στην κοινή των Αλυτρώτων Επιτροπεία (1917-1920). Εισηγήσεις και υπομνήματα για το προσφυγικό ζήτημα και την υγειονομική οργάνωση Θράκης (1918-1933).
Έγγραφα του Υπουργείου Υγιεινής Πρόνοιας και Αντιλήψεως (1922). Ταμείο Περιθάλψεως Προσφύγων, Επιτροπή Αστικής Αποκαταστάσεως (εκθέσεις, υπομνήματα, αλληλογραφία, νομοσχέδια έντυπα).
Πατριωτικό Ίδρυμα Προστασίας Παιδιού (1924-1933). Οργανικός νόμος, διοριστήρια έγγραφα του Απόστολου Δοξιάδη, οικονομικά, παιδικές εξοχές, συνέδρια, αλληλογραφία.
Υφυπουργείο Υγιεινής Πρόνοιας και Αντιλήψεως (1928-1929)ˑ θέματα υγιεινής πολιτικής, νομοθετικά διατάγματα, νομοσχέδια, εισηγητικές εκθέσεις, εγκύκλιοι, εκθέσεις κ.ά.
Αλληλογραφία του Απόστολου Δοξιάδη (1917-1941). Προσωπικά έγγραφαˑ συγγραφική δραστηριότητα (1905-1941)ˑ φιλολογικά δοκίμια, μελέτες άρθρα και δημοσιεύματα με θέματα κοινωνικά, παιδαγωγικά, βιολογικά, αναμνήσεις από τη ζωή του, κ.ά.
Νεκρολογίες, προσωπικά αντικείμενα, χάρτες.

Πρωτόκολλα αλληλογραφίας, δελτία εισαγωγής και εξαγωγής τροφίμων, απολογιστικά τροφίμων, παρουσιολόγια κ.ά., φάκελοι αλληλογραφίας, προσωπικού, εγγραφών βρεφών κ.ά.

Περιλαμβάνει : α. Αλληλογραφία : βιβλία πρωτοκόλλου, εγκυκλίους, διαβιβαστικά, β. Μητρώο νηπίων : αιτήσεις για εγγραφή - επανεγγραφή - διαγραφή, ενστάσεις, γ. Θέματα προσωπικού, μισθοδοτικές καταστάσεις, ατομικούς φακέλους, άδειες, βιβλιάρια ενσήμων, αιτήσεις πρόσληψης, ιατρικούς ελέγχους, βιβλίο προσέλευσης, αλληλογραφία, εμπιστευτικά, δ. Έγγραφα διοικητικού συμβουλίου : βιβλία πρακτικών και αποφάσεων, εισηγήσεις - τροποποιήσεις Δ.Σ, συγκροτήσεις Δ.Σ, αποζημιώσεις μελών, αλληλογραφία, ε. Τροφοδοσία ΠΙΚΠΑ : δημοπρασίες, προμήθειες τροφίμων, δελτία εισαγωγής και εξαγωγής προϊόντων, βιβλία τροφίμων ακι αναλώσιμου υλικού, βιβλία ελέγχου συσσιτούντων, βιβλία μη αναλώσιμου υλικού, προμήθεια παιχνιδιών, διαχείριση υλικού, προτόκολλα καταστροφής υλικού, στ. Διδακτική ύλη : βιβλία διδαχθείσας ύλης, εκπαιδευτικό υλικό, κατάλογος εκπαιδευτικών παιχνιδιών, ζ. Στατιστικά στοιχεία, η. Διαγωνισμοί - μελέτες, θ. Μισθώσεις κτηρίου, ι. Κανονισμοί λειτουργίας, ια. Τηλεπικοινωνίες και ηλεκτροφωτισμός, ιβ. Σχεδιασμός εκτάκτου ανάγκης, ιγ. Καταστάσεις, δικαιολογητικά, απολογισμοί, ιδ. Οικονομικά : προϋπολογισμοί - απολογισμοί, γραμμάτια, εντάλματα, μπλοκ επιταγών, δικαιολογητικά δαπανών, βιβλία εσόδων - εξόδων

Βιβλία αποθεμάτων εφοδίων, αποθήκης, διανομών Π.Ι.Κ.Π.Α., επιδοτήσεως απόρων, γενικών - ειδικών διανομών, καυσίμων. Φάκελοι αγορανομικής επιτροπής, Αμερικάνικης βοήθειας, διανομής εφοδίων σε θύματα πολέμου, καταστάσεων διανομής εφοδίων σε Δ.Υ., αποδόσεως λογαριασμού διαφόρων μηνών

Το αρχειακό υλικό αφορά διάφορες υπηρεσίες του Υπουργείου που άσκησαν τις λειτουργίες υγείας και πρόνοιας. Επίσης υπάρχει αρχειακό υλικό σχετικό με δοικητικά θέματα και την οικονομική διαχείριση. Υγεία: Δημόσια υγεία (λοιμώδη νοσήματα), νοσοκομειακή περίθαλψη (κυρίως μαιευτήρια), ψυχική υγεία, φαρμακεία (ευρετήρια, μητρώα) κ.ά. Πρόνοια: Κοινωνική πολιτική στέγασης (Λαϊκή Στέγη, προστασία παιδικής ηλικίας, πρόσφυγες Μέσης Ανατολής περιόδου 1940-1944 (μητρώα και ευρετήρια), επαγγελματική κατάρτιση (αγροτικές μεταβατικές οικοκυρικές σχολές), ορφανοτροφεία κ.ά. Μεγάλο μέρος του υλικού αφορά την αποκατάσταση των αστών προσφύγων μικρασιατικής καταστροφής, στο οποίο περιλαμβάνονται το διοικητικό αρχείο του Ταμείου Ανταλλαξίμων Κοινοτικών Περιουσιών, παραχωρητήρια, επιτάξεις και απαλλοτριώσεις, φάκελοι προσφυγικών συνοικισμών, οικονομικά στοιχεία για την αποκατάσταση αστών προσφύγων, κτηματολογικοί πίνακες και διαγράμματα συνοικισμών. Διοικητικά: Εμπιστευτική αλληλογραφία (φάκελοι και πρωτόκολλα), Υπηρεσιακά συμβούλια, Συμβούλια Νομιμοφροσύνης και γενικότερα θέματα προσωπικού, Οικονομικά θέματα, κ.ά.