Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: φάκελοι των πλοίων «ΠΑΝΑΓΙΤΣΑ», «ΕΛΑΦΟΝΗΣΟΣ», «ΜΥΡΤΙΩΤΙΣΣΑ», «ΠΑΝΑΓΙΑ ΚΟΙΜΗΣΗΣ», «ΕΛΑΦΙ», «ΑΡΧΑΓΓΕΛΟΣ» και «ΠΟΡΦΥΡΟΥΣΑ», ημερήσιες αναφορές πληρωμάτων
Β. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με Διεύθυνση Προγραμματισμού Οργάνωσης και Εκπαίδευσης, Διεύθυνση Λιμενικής Αστυνομίας (Δ.Λ.Α.), Διεύθυνση Ασφαλείας Ναυσιπλοΐας (Δ.Α.Ν.), Διεύθυνση Οργάνωσης και Ποιότητας Υπηρεσιών, Διεύθυνση Προσωπικού Λιμενικού Σώματος (Δ.Π.Λ.Σ.), Γραφείο Επικοινωνίας και Μέσων Μαζικής Ενημέρωσης (Γ.Ε.Μ.Μ.Ε.) και 5η Περιφερειακή Διοίκηση Λιμενικού Σώματος (5η ΠΕ.ΔΙ.Λ.Σ.), έγγραφα περί έκδοσης αδειών τραπεζοκαθισμάτων, καύσης πυροτεχνημάτων και μεταφοράς νεκρού
Γ. Στοιχεία Αλιείας: ατομικές άδειες επαγγελματικής αλιείας, έγγραφα περί ανανεώσεως αδειών αλιείας
Δ. Στοιχεία Προσωπικού: πίνακες βαρδιών προσωπικού, ανακοινώσεις και έγγραφα περί συνδικαλιστικών θεμάτων, προερχόμενα από την Πανελλήνια Ομοσπονδία Ενώσεων Προσωπικού Λιμενικού Σώματος και την Πανελλήνια Ομοσπονδία Αξιωματικών Λιμενικού Σώματος
Ε. Οικονομικά Στοιχεία: έγγραφα περί οδοιπορικών εξόδων και καταστάσεις μισθοδοσίας προσωπικού Λιμεναρχείου
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: έγγραφα περί εγγεγραμμένων ναυτικών και ναυτολόγησής τους, θεωρήσεις αποδεικτικών ναυτικής ικανότητας.