Το αρχείο του Στρατηγού Αμβρόσιου Φραντζή αποτελεί μέρος του αρχείου Ιωάννη Φραντζή που δωρήθηκε στη Γεννάδειο Βιβλιοθήκη απο τον Κ. Ψημμένο τον Ιανουάριο του 1985.

Το αρχείο περιλαμβάνει προσωπικές χειρόγραφες και δακτυλόγραφες σημειώσεις του Αμβρόσιου Φραντζή σχετικά με τη στρατιωτική καριέρα του, λογοτεχνικές σημειώσεις (ποιήματα και πεζά κείμενα), αποκόμματα εφημερίδων, υλικό σχετικό με τον Πατριωτικό Όμιλο του οποίου ήταν ιδρυτικό μέλος, τα ανέκδοτα Απομνημονεύματα του, αλληλογραφία.

Το αρχείο Σπ. Μαρινάτου αποτελείται από περίπου 500 επιστολές Ελλήνων και ξένων που χρονολογούνται στο διάστημα 1929-1940. Ξεχωριστή θεματικά ενότητα αποτελούν οι επιστολές που σχετίζονται με το ταξίδι του ΣΜ στην Αμερική προσκεκλημένος του The Archaeological Institute of America. Επίσης ξεχωριστή ενότητα αποτελεί η μικρή συλλογή Στ. Ξανθουδίδη που αποτελείται από επιστολές του ΣΜ προς τον προκάτοχό του διευθυντή του Μουσείου Ηρακλείου και άλλα έγγραφα (1898-1928). Στους αλληλογράφους του ΣΜ περιλαμβάνονται γνωστοί Έλληνες και ξένοι αρχαιολόγοι όπως οι Γ. Μυλωνάς, Κ. Ρωμαίος, Γ. Μηλιάδης, Georg Karo και W. Doerpfeld, πολιτικοί όπως ο Ι. Μεταξάς, τοπικοί παράγοντες, πολίτες και ομογενείς.