Αλληλογραφία της Κυβερνητικής περιόδου καθώς και αλληλογραφία των αδελφών του Αυγουστίνου και Βιάρου, αναφορές και διοικητικά έγγραφα που αφορούν στην περίοδο που συμμετείχαν στη Δημόσια Διοίκηση, καθώς και έγγραφα σχετικά με τη δολοφονία. Διακρίνεται σε εισερχόμενη (Φ. 585) και εξερχόμενη αλληλογραφία (Φ. 609). Επίσης περιέχεται μικρή υποσειρά 15 φακέλων με ποικίλα καποδιστριακά κατάλοιπα οικονομικού περιεχομένου.

Συλλογή του Φώτου και της οικογένειας Τζαβέλα που περιλαμβάνει:

1. Χειρόγραφο σημειωματάριο και ημερολόγιο του Φώτου Τζαβέλα από 14 Φεβρουαρίου έως 22 Απριλίου 1792, υποδείγματα επιστολών, ενθυμήσεις γεννήσεων προσώπων της οικογένειας, λογαριασμούς, κ.ά.
2. Χειρόγραφο σημειωματάριο με οικογενειακές ενθυμήσεις.
3. Επιστολές (Αλή Πασά, Χασάν Τζαπάρη, Νότη Μπότσαρη, Γ. Κίτζου, Ιωάννη και Αυγουστίνου Καποδίστρια, διαφόρων Αλβανών και Σουλιωτών κ.ά.), ομολογίες, αποδείξεις, δανειστικά, τεζκερέδες, έγγραφα της ρωσικής κατοχής των Επτανήσων, της δεύτερης Γαλλοκρατίας των Επτανήσων, της Επανάστασης του 1821, της Καποδιστριακής περιόδου, της Οθωνικής περιόδου, κ.ά.