Το υλικό του αρχείου αποτελείται από την κοινή αλληλογραφία του Προξενικού Λιμεναρχείου Αμβούργου με τις υπηρεσίες του Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας (αναφορές, στατιστικοί πίνακες, έντυπα σήματα, αποσπάσματα Τύπου) και αντανακλά ένα ευρύ φάσμα από τις αρμοδιότητες του Λιμεναρχείου: προσωπικό του Λιμενικού Σώματος, επιβολή προστίμων και ενέργειες για την προστασία του θαλάσσιου περιβάλλοντος, ασφάλεια ναυσιπλοΐας,, στατιστικά στοιχεία, θέματα ναυτικής εργασίας (πειθαρχικά, ναυτικά φυλλάδια), είσπραξη ναυτιλιακών τελών, ανακρίσεις, ασφάλιση Ναυτικών (Ν.Α.Τ.), δαπάνες προξενείου, μελέτες, δημόσιες σχέσεις (μεταξύ άλλων αποστολή αποσπασμάτων γερμανικού τύπου και ενέργειες του λιμεναρχείου προς γερμανικά μέσα ενημέρωσης σχετικά με το ναυάγιο του Εξπρές Σάμινα τον Σεπτέμβριο του 2000), εκδηλώσεις κλπ.

Το υλικό του αρχείου αποτελείται από την κοινή αλληλογραφία του Προξενικού Λιμεναρχείου Αμβούργου με τις υπηρεσίες του Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας (αναφορές, στατιστικοί πίνακες, έντυπα σήματα, κλπ) και αντανακλά ένα ευρύ φάσμα από τις αρμοδιότητες του Λιμεναρχείου: προσωπικό του Λιμενικού Σώματος, επιβολή προστίμων και ενέργειες για την προστασία του θαλάσσιου περιβάλλοντος, ασφάλεια ναυσιπλοΐας, στατιστικά στοιχεία, θέματα ναυτικής εργασίας (πειθαρχικά, ναυτικά φυλλάδια), είσπραξη ναυτιλιακών τελών, ανακρίσεις, ασφάλιση Ναυτικών (Ν.Α.Τ.), δαπάνες προξενείου, μελέτες, κ.λπ.

Το αρχείο περιλαμβάνει βιβλία και φακέλους αλληλογραφίας. Υπηρεσιακά βιβλία: Απόπλου-κατάπλου, μεταβολών πληρωμάτων εμπορικών πλοίων, πρωτοκόλλου απορρήτων εγγράφων, θεωρήσεων πιστοποιητικών ξένης υπηρεσίας, κινήσεως πάγιας προκαταβολής Προξενικού Λιμεναρχείου Αμβέρσης, πρωτότυπων ναυτολογίων, γενικού πρωτοκόλλου. Φάκελοι: Πίνακες καταπλευσάντων πλοίων με ελληνική σημαία στην Αμβέρσα, αλληλογραφία με ΥΕΝ και υπηρεσίες του ΥΕΝ (κυρίως Διεύθυνση Ωκεανοπόρου Ναυτιλίας/ΔΩΝ, Διεύθυνση Υποστήριξης Ασφαλιστικών Οργανισμών/ΔΥΑΣΟ, Επιθεώρηση Εμπορικών Πλοίων/ΕΕΠ), πίνακες κίνησης πλοίων με ελληνική σημαία, ναυτικά ατυχήματα.

Τμήμα αρχείου του Αλέξανδρου Κοντόσταυλου που περιλαμβάνει αλληλογραφία με τους εμπόρους Ροδοκανάκη, Μεσέρη, Πρασακάκη, Ράλλη, Σκυλίτση, Τοσίτζα, Πετροκοκκίνου, Φραγκιάδη, Γαλάτη κ.ά. από τη Σμύρνη, την Τεργέστη, το Λονδίνο, τη Μασσαλία, τη Μελίτη (Μάλτα), το Λιβόρνο, την Αλεξάνδρεια, την Κέρκυρα, την Κωνσταντινούπολης, τη Σύρο, τη Βιέννη, τη Λειψία, το Βερολίνο κ.ά. (Κ83α).

Τμήμα του αρχείου του Αλέξανδρου Κοντόσταυλου που αναφέρεται στο δάνειο για την κατασκευή φρεγατών το 1826, στη δίκη για την κατάχρηση δημοσίου χρήματος κατά την ναυπήγηση των φρεγατών και στην απολογία στο Ελεγκτικό Συνέδριο των υπόλογων για τη διαχείριση του δανείου, στην αγορά του Νομισματοκοπείου στη Μάλτα και σε εμπορική αλληλογραφία μεταξύ συγγενών και εμπόρων (Κ83β).

• " Έγγραφα Καστελλορίζου Νομαρχιακά", αναφερόμενα στην ιστορία της νήσου Μεγίστης (Κ1α).
• Πρωτόκολλο πράξεων του Εκκλησιαστικού Δικαστηρίου της Αρχιεπισκοπής Καστελλόριζου (Κ1β)
• Συλλογή οθωμανικών εγγράφων (εκ των οποίων ένα λιθόγραφο): δύο φιρμάνια του 19ου αιώνα σχετικά με την άδεια κατασκευής πλοίων, την ανακαίνιση του βακουφιού του Μπαμπά Τουρμπεσί, ένα δίπλωμα πλοιαρχίας κ.ά. (Κ1γ)
• Έγγραφα Καστελλόριζου, αποδείξεις πληρωμών φόρου, κ.ά. (Κ1δ)
• Μαθητολόγιο της Αστικής Σχολής Μεγίστης (Κ1ε)
• Απανταχούσα επισκοπική περί συλλογής εράνων υπέρ ανακαινίσεως ναού στο Καστελόριζο, πράξη προικοδοσίας της Κυράτζας Παπαδίας θυγατρός Χατζή-Βασιλείου, υπογεγραμμένη υπό του Αμασείας Παϊσίου (Κωνσταντινούπολη, 1818), προικοσύμφωνο Μαρίας Μιχαλιά και Κωνσταντή Χατζή-Πέτου στο Καστελόριζο (Κ1στ).