Καθολικά (ledgers) ισολογισμών δημοσίου, γενικού ταμείου και τοπικών ταμείων κάθε νήσου, μηνιαίες καταχωρίσεις ανά νησί (gran quaderno), μηνιαίες καταχωρίσεις εσόδων-εξόδων, μηνιαίες ονομαστικές καταχωρίσεις, μηνιαίες καταχωρίσεις μισθών, συντάξεων, αλληλογραφία, εγκύκλιοι, καθημερινές καταχωρίσεις (cassa), απολογισμοί, επιτομές ισολογισμών, εισπράξεις σε χρυσό, εντάλματα, έντοκα γραμμάτια, εγγυήσεις, καθώς και λογιστικά βιβλία του ταμείου δικαιοσύνης, του δημοτικού ταμείου, της Εκτελεστικής Αστυνομίας, της Ιατρικής Σχολής, του Πετριδείου Κληροδοτήματος, του ταμείου για την οδοποιϊα, το στρατό, τα φρούρια.

Έντυπο υλικό, περιοδικά, εφημερίδες του επτανησιακού και του ευρύτερου ελληνικού χώρου καθώς και ευρωπαϊκά, μονόφυλλα (πρωτότυπα και αντίγραφα), χειρόγραφες σημειώσεις του Κώστα Δαφνή, προσωπικό αρχείο, αρχείο τεκμηρίωσης κερκυραϊκής ιστορίας και προσωπογραφίας, ημερολόγια, αφίσες, παρτιτούρες, αρχείο πολιτιστικών εκδηλώσεων, φωτογραφικό αρχείο, εξαρτήματα τυπογραφείου και μία στοιχειοθήκη καθώς και το αρχείο Ιωάννη-Βαπτιστή Θεοτόκη.

Προσωπικό και υπηρεσιακό αρχείο, του Κερκυραίου λογίου, υλικό από αρχειακές και ιστορικές έρευνες

Ιδιωτικά έγγραφα και τμήμα της βιβλιοθήκης της οικογένειας Θεοτόκη (Σταθάκια)

Ιδιωτικά έγγραφα διαχείριση ακίνητης ιδιοκτησίας οικογένειας Θεοτόκη (Σταθάκια) και συγγενικών οικογενειών (Πετρετίνη, Βλασσόπουλου, Βαρλαάμ, Καραγιάννη, Σορδίνα κλπ.). Αντίγραφα συμβολαίων, εμφυτεύσεις, αγροληψίες, προεκτιμήσεις της ελαιοπαραγωγικής εσοδείας, πραγματογνωμοσύνες, κλήσεις, απογραφές, δικογραφίες καθώς και ποικίλα προσωπικά έγγραφα, ορισμένα αφορώντα τον Νικηφόρο Θεοτόκη και τον Ιωάννη Καποδίστρια.