Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Οικονομικά Στοιχεία: αποδείξεις, τιμολόγια, έγγραφα που αφορούν σε μισθολόγια προσωπικού του Λιμεναρχείου
Β. Στοιχεία Πλοίων και Πληρωμάτων: έγγραφα δρομολόγησης πλοίων και επιθεώρησης εμπορικών πλοίων, δελτία κινήσεως πλοίων, ποινολόγια πληρωμάτων
Γ. Αλληλογραφία: έγγραφα εισερχόμενα και εξερχόμενα, έγγραφα που αφορούν στις τοπικές συγκοινωνίες.