Ενότητα Ι. Προσωπικό Αρχείο Κων/νου Σημίτη: Περιλαμβάνει έγγραφα που αφορούν την δράση του παραγωγού πριν την περίοδο της πρωθυπουργίας του. Το υλικό αυτό αφορά τις δραστηριότητές του ως Υπουργού, Βουλευτή Πειραιά, στελέχους του ΠΑΣΟΚ, πανεπιστημιακού και ιδιώτη δικηγόρου. Καλύπτει κυρίως τις δεκαετίες 1970-1990, αλλά περιλαμβάνει και κάποια παλαιότερα τεκμήρια, κυρίως νομοθεσία (το παλαιότερο τέτοιο έγγραφο χρονολογείται, όπως ήδη σημειώθηκε, από το 1946).

Ενότητα ΙΙ. Γενικό Αρχείο Πρωθυπουργού Κων/νου Σημίτη: Περιλαμβάνει το αρχείο του Πολιτικού Γραφείου του Πρωθυπουργού και των Γραφείων που υπάγονταν σε αυτό: του Γραφείου Τύπου, του Τμήματος Δημοσίων Σχέσεων, της Γραμματείας του Γραφείου Οργάνωσης και Διοίκησης, του Τμήματος Σχέσεων με τους Πολίτες, καθώς και τα αρχεία τεσσάρων (4) Συμβούλων του Πρωθυπουργού (οι δύο από αυτούς υπάγονταν στο Γραφείο Σχεδιασμού Στρατηγικής).

Ενότητα ΙΙΙ. Ιδιαίτερο Αρχείο Πρωθυπουργού Κων/νου Σημίτη. Περιλαμβάνει το υλικό που συγκροτεί το αρχείο του Ιδιαίτερου Γραφείου του: την αλληλογραφία του, ελληνική και ξένη, και ποικίλο άλλο αρχειακό υλικό.

Το αρχείο περιέχει υλικό που σχετίζεται με τον αντιδικτατορικό αγώνα, τη βουλευτική θητεία της Αμαλίας Φλέμιγκ και την ένταξή της στο ΠΑ.ΣΟ.Κ., τον αγώνα της για τα ανθρώπινα δικαιώματα, τη δράση της στο γυναικείο κίνημα, το Κυπριακό, καθώς και τη θητεία της στο Ευρωπαϊκό Συμβούλιο. Περιέχονται επίσης διάφορα έγγραφα σχετικά με τον Αλέξανδρο Φλέμιγκ.
Αναλυτικότερα το αρχείο περιλαμβάνει τις εξής σειρές
Α) : Mαρτυρίες πολιτικών κρατουμένων για βασανιστήρια, εκκλήσεις της Αθηνάς Παναγούλη για τη σωτηρία των δύο γιων της, κείμενα για το Πολυτεχνείο, έντυπα διαφόρων αντιστασιακών οργανώσεων του εξωτερικού (ανάμεσά τους και του ΠΑΚ), σειρά του ενημερωτικού δελτίου της Κεντρικής Επιτροπής Πολιτικών Προσφύγων Ελλάδας Καθημερινό Δελτίο Ειδήσεων, αποκόμματα ελληνικών και ξένων εφημερίδων για την κατάσταση στην Ελλάδα και τις διώξεις εναντίον της Αμαλίας Φλέμιγκ καθώς και συμφωνητικά , δακτυλογραφημένα αντίγραφα και αλληλογραφία για την έκδοση του βιβλίου της A piece of truth.
Β) Βουλή: Διάφορα βουλευτικά και υλικό σχετικά με επερωτήσεις της σε διάφορα υπουργεία
Γ) Ανθρώπινα δικαιώματα: Αναφορές και αλληλογραφία σχετικά με την παραβίαση των ανθρωπίνων δικαιωμάτων σε διάφορες χώρες: Βραζιλία, Παλαιστίνη, Ινδονησία, Τουρκία (Κουρδιστάν), Αϊτή, Ουρουγουάη Ιράν, Βολιβία (1971-1984) και στην Ελλάδα κυρίως για υποθέσεις αντιρρησιών συνείδησης (1971-1881).
Δ) ΠΑ.ΣΟ.Κ.: Αλληλογραφία με τον πρόεδρο του ΠΑ.ΣΟ.Κ. Ανδρέα Παπανδρέου, κείμενα ομιλιών του και έντυπα σχετικά με την οργάνωση του κόμματος, τις εκλογές του 1981 και την κυβερνητική πολιτική (1977-1984).
Ε) Μεταπολίτευση – Διάφορα: Ελληνικά και ξενόγλωσσα έντυπα του Συνδέσμου Κυπρίων Γυναικών Επιστημόνων, της Ελληνικής Συντονιστικής Επιτροπής Κυπριακού Αγώνα, έκθεση υπουργείου Εξωτερικών για το Κυπριακό (1977-1983), διάφορα από τη συμμετοχή της σε οργανώσεις για τα δικαιώματα της γυναίκας, και αποκόμματα εφημερίδων της μεταπολιτευτικής περιόδου (1974-1983).
ΣΤ) Αλληλογραφία με Έλληνες και ξένους
Ζ) Προσωπικά: Διάφορα προσωπικά, υλικό (κυρίως δημοσιεύματα) σχετικά με τον Αλέξανδρο Φλέμιγκ (επετειακά για τη γέννησή του και την ανακάλυψη της πενικιλίνης), κατάλοιπα Χαράλαμπου Κουτσούρη, Ινστιτούτο Βασικής Βιολογικής Έρευνας «Αλέξανδρος Φλέμιγκ» (1955-1984)
Η) Έντυπα (1977-1986).

Θεματικοί φάκελοι αρμοδιότητός του (εξωτερική πολιτική, διεθνείς και διμερείς σχέσεις), υπηρεσιακή αλληλογραφία, φάκελοι επισκέψεων διαφόρων αξιωματούχων, αποκόμματα Τύπου, σημειώματα επί ποικίλων θεμάτων, συνεντεύξεις, ανακοινώσεις Τύπου ΥΠΕΞ, άρθρα, ομιλίες, προσωπική αλληλογραφία κ.λπ..