Το αρχείο περιλαμβάνει βιβλία και φακέλους αλληλογραφίας. Υπηρεσιακά βιβλία: Απόπλου-κατάπλου, μεταβολών πληρωμάτων εμπορικών πλοίων, πρωτοκόλλου απορρήτων εγγράφων, θεωρήσεων πιστοποιητικών ξένης υπηρεσίας, κινήσεως πάγιας προκαταβολής Προξενικού Λιμεναρχείου Αμβέρσης, πρωτότυπων ναυτολογίων, γενικού πρωτοκόλλου. Φάκελοι: Πίνακες καταπλευσάντων πλοίων με ελληνική σημαία στην Αμβέρσα, αλληλογραφία με ΥΕΝ και υπηρεσίες του ΥΕΝ (κυρίως Διεύθυνση Ωκεανοπόρου Ναυτιλίας/ΔΩΝ, Διεύθυνση Υποστήριξης Ασφαλιστικών Οργανισμών/ΔΥΑΣΟ, Επιθεώρηση Εμπορικών Πλοίων/ΕΕΠ), πίνακες κίνησης πλοίων με ελληνική σημαία, ναυτικά ατυχήματα.

Αρχειακό υλικό του Κεντρικού Λιμεναρχείου Θεσσαλονίκης και των γραφείων που υπάγονται σε αυτό, του Π.Ο.Ν.Θ., των Λιμενικών Τμημάτων Ν. Μουδανιών και Κατερίνης: Βιβλία καυσίμων. Πρωτόκολλο παράδοσης-παραλαβής πλωτού σκάφους και περιπολικών, πιστοποιητικά επιθεώρησης πνευστής σωστικής σχεδίας, πρωτόκολλα παράδοσης-παραλαβής τηλεπ/κού υλικού 1974-1982. Φάκελοι αλληλογραφίας και αποστολής Επιδοτηρίων Λιμενικών Αρχών 1990-1991. Φάκελοι άδειας Οστρακαλιείας. Μέτρα τάξης κατά την απο-επιβίβαση επιβατών και οχημάτων στα Ε/Γ-Ο/Γ πλοία 1990-1992. Φάκελος εσωτερικής αλληλογραφίας Τμήματος Γραμματείας με ΛΑ/Δικαστικό 1990-1995. Φάκελος ΛΑ/Δικαστικού: διαβιβαστικά αποφάσεων και κλήσεων σε λιμενικές και αστυνομικές Αρχές 1992-1993. Διοικητικά θέματα, 1986-1992, ρύπανση θάλασσας 1980-1996, φάκελος Νηολογίων 1996. Πίνακες διαφόρων δαπανών Υγειονομικής Περίθαλψης 1994. Από το Α΄ Λ/Τ Ν.Μηχανιώνας: 1 φάκελος Γαλάζιες σημαίες της Ευρώπης 1997. Από Β΄ Λ/Τ Ν.Μουδανιών: 1 φάκελος Παράνομη αλιεία-άδειες αμμοληψίας- αλληλογραφία με Εφορεία Εναλίων Αρχαιοτήτων 1995-1997. 3 φάκελοι αδειών πετρέλευσης πλοίων 1996-1997. 11 φάκελοι αδειών σκαφών, γρι-γρι, κ.λπ. Από το Γ΄ Λ/Τ Κατερίνης: 1 Βιβλίο καταγγελιών για παράνομη αλιεία 1992-94. 8 φάκελοι ποικίλων θεμάτων. Από το Δ΄ Λ/Τ Ν. Μαρμαρά: 1 φάκελος κίνησης Θ/Γ σκαφών 1991-1994. Ατυχήματα πλοίων 1986. Από το Λ/Σ Πλαταμώνα: 1 φάκελος ποικίλων θεμάτων 1986-1994. Από Οίκο Ναύτου 1 φάκελος Υγειονομικών. Γραφείο Γενικής Αστυνομίας: α) Αιτήσεις-εγκρίσεις φορτοεκφόρτωσης επικίνδυνων φορτίων 1988. β) Βιβλίο καταγγελιών παράνομης αλιείας 1985-1989. γ) Άδειες ανέλκυσης-καθέλκυσης 1995-1999. δ) Άδειες πετρέλευσης 1996, 1999. Γραφείο Μικρών Σκαφών: Αιτήσεις έκδοσης-ανανέωσης ατομικών αδειών αλιείας (ερασιτεχνικές/επαγγελματικές) 2000. Τμήμα Ναυτολογίας: Ναυτικοί που έτυχαν προστασίας λόγω ασθενείας ή ατυχήματος. Σημειώματα ΓΕΝΕ των προς ναυτολόγηση ναυτικών έως και 1999. Τμήμα ΛΑ/ΓΓΑ: σχετικά με άδειες καταδυτικών εργασιών, εκδηλώσεις στους χώρους λιμανιού, λειτουργία πλωτών αναψυκτηρίων, άδειες ναυτικών πρακτόρων κ.λπ. Έγραφα του ΠΟΝ Θεσσαλονίκης. Εγκρίσεις φορτοεκφόρτωσης επικίνδυνων ειδών 2000-2001. Φάκελος φορτοεκφόρτωσης φορτίου χύμα πετρελαίου-αερίων σε δεξαμενόπλοια 2001. Φάκελοι του Γραφείου Ασφάλειας με Βεβαιώσεις Ναυτολόγησης-Απόλυσης αλλοδαπών ναυτικών 2001-2003. Φάκελος του Γραφείου Επιστασίας. Φάκελοι του Γρ. Ναυτολογίας (κύρωση συλλογικής σύμβασης εργασίας για πλόες στον Περσο-αραβικό Κόλπο, 1990. Φάκελος Υγειονομικού Ελέγχου αλιευμάτων 2001. Αγγελίες – Κ/Π – Α/Π πλοίων σημαίας εξωτερικού και εσωτερικού 2015. Βεβαιώσεις ναυτολόγησης και απόλυσης αλλοδαπών ναυτικών 2015. Αγγελίες – Κ/Π – Α/Π Κ/Ζ 2012. Καταχωρήσεις σημάτων SCHENGEN-SIRENE 2012. Έντυπα πληροφοριακών στοιχείων για είδος φορτοεκφορτωθέντων πετρελαιοειδών φορτίων έτους 2013.Υπηρεσιακά σημειώματα ελεγχθέντων πλοίων ετών 2013-2014. Φύλλα εκθέσεων επιθεωρήσεων MARPOL ετών 2013-2014. Έγγραφα του ΚΛΘ/Β’ Λ/Τ Ν. Μουδανιών και του Κ.Λ.Θ./Δ’ Λ/Τα Πλαταμώνα.

Πληρώματα αλιευτικών. Δελτία καιρού. Αναγγελίες βολών. Έλεγχος πλοίων. Ποικίλα θέματα: ρύπανση θάλασσας και ακτών, κίνηση θαλαμηγών, έλεγχος δικτύων σκαφών, δικαιολογητικά ναύλωσης πλοιαρίων, έλεγχοι σκαφών για παράνομη αλιεία, ετήσια γενική επιθεώρηση σκαφών, ατυχήματα στη θαλάσσια αλιεία και σπογγαλιεία, εκτίσεις ποινών αλιευτικών σκαφών, αναγγελίες θυέλλης, πεδία βολής.

Ατυχήματα σκαφών, αλληλογραφία με Λιμενικές Αρχές για ναυτικά ατυχήματα, δελτία συμβάντων, αποφάσεις επιβολής προστίμου, ναυάγια–ανελκύσεις, κλοπές–αναζητήσεις πλοίων, ρύπανση από πλοία, επιστολές-καταγγελίες ναυτεργατικών θεμάτων, ναυάγιο Jupiter, παραβάσεις παράνομης αλιείας, θέματα Διεύθυνσης Προστασίας Θαλάσσιου Περιβάλλοντος, Συνεδριάσεις του Συμβουλίου Ακτοπλοϊκών Συγκοινωνιών (Σ.Α.Σ.), ναυλολόγιο.

Το αρχείο περιλαμβάνει: Φακέλους ναυτικών ατυχημάτων σχετικά με την αρμοδιότητα του διοικητικού ελέγχου ναυτικών αδικημάτων. Φάκελος στρατιωτικού προσωπικού. Φάκελος συντονισμού ελέγχου. Φάκελος θεμάτων έρευνας και διάσωσης. Φάκελος ατυχημάτων. Διεθνείς Αγγελίες. Διεθνείς Αγγελίες. Εφοδιασμός λιμενικών αρχών με χάρτες και βοηθήματα.

Φάκελοι ναυτικών ατυχημάτων που σχετίζονται με την αρμοδιότητα της μέριμνας για την κατάρτιση δικογραφιών για διερεύνηση των αιτίων που προκάλεσαν ατυχήματα σε Έλληνες ναυτικούς, η εισήγηση μέτρων για τον περιορισμό των ατυχημάτων και η διασφάλιση των περιουσιακών στοιχείων εκείνων που απεβίωσαν ή εξαφανίστηκαν στην αλλοδαπή. Φάκελοι περιόδου 1940-1970 περίπου. Αρ. φακέλων περ. 3030 ταξινομημένοι αλφαβητικά.

1) Γραμματεία: Θέματα ολοκληρωθέντων / εξελισσόμενων / προγραμματισθέντων, κοινοβουλευτικός έλεγχος. 2) Τμήμα 1 Πρόνοιας Ναυτικών Υλικό που αφορά την αρμοδιότητα της μέριμνας για την κατάρτιση δικογραφιών για διερεύνηση των αιτίων που προκάλεσαν ατυχήματα σε Έλληνες ναυτικούς, την εισήγηση μέτρων για τον περιορισμό των ατυχημάτων και τη διασφάλιση των περιουσιακών στοιχείων εκείνων που απεβίωσαν ή εξαφανίστηκαν στην αλλοδαπή. Περιλαμβάνονται φάκελοι δικογραφιών. 3) Τμήμα 2 Εποπτείας Οργανισμών Ασφάλισης Διαχειριστικός έλεγχος εστίας Ναυτικών (1987) Πρακτικά ΔΣ ΕΛΟΕΝ. Άγνωστο ποιο Τμήμα το συγκέντρωσε.

Το αρχείο αποτελείται από υλικό που χρησιμοποιήσε κατά καιρούς ο Χ. Ντούνης για τη συγγραφή βιβλίων και άρθρων και αφορά κυρίως την εμπορική ναυτιλία και θέματα ναυτικής εκπαίδευσης. Το αρχείο περιλαμβάνει επίσης χειρόγραφα, αλληλογραφία, διοικητικά και επίσημα έγγραφα (πιστοποιητικά, διπλώματα, αναφορές, νηολογήσεις, ναυτολόγια κ.ο.κ.), έντυπα, αποκόμματα Τύπου και φωτογραφικό υλικό.