Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: έγγραφα περί ανευρέσεως χελωνών
Β. Στοιχεία Πλοίων: Καταστάσεις κίνησης επιβατών – Ακτοπλοϊκό ΑΚΟΥΑ ΤΖΙΟΥΕΛ, έγγραφα περί αναθέσεως πρακτόρευσης κρουαζιερόπλοιων, προγράμματα κατάπλου πλοίων.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: πρωτόκολλα αλληλογραφίας, βιβλία εισερχομένων και εξερχομένων σημάτων, έγγραφα περί προστασίας θαλάσσιων χελωνών
Β. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: βιβλία απόπλου και κατάπλου πλοίων και σκαφών, βιβλία ημερήσιων αναφορών πληρωμάτων, βιβλία και ημερολόγια συμβάντων, βιβλία μεταβολών πληρωμάτων, μητρώα ναυτικών γραφείων και πρακτορείων
Γ. Στοιχεία Νομοθεσίας - Παραβάσεων - Προστίμων: εκθέσεις βεβαίωσης παραβάσεων, βιβλία τιμωρηθέντων ναυτικών
Δ. Οικονομικά στοιχεία: βιβλία εισπράξεως Ναυτικού Απομαχικού Ταμείου (Ν.Α.Τ.), βιβλία ταμείου και εισπράξεως Λιμενικής Αρχής, μπλοκ αποδεικτικών είσπραξης, βιβλία δικαιολόγησης πενθημέρων.

Μεμονωμένοι φάκελοι ποικίλου περιεχομένου (πίνακας μηνιαίας δραστηριότητας σε θέματα ελέγχου ελληνικών πλοίων, αλληλογραφία που αφορά στις απαιτήσεις γραφείου τελετών για υπηρεσίες του σε θέματα του ναυαγίου Εξπρές Σάμινα, αντίγραφο βιβλίου ταμείου, αλληλογραφία για λιμένες-πλοία-ναυτικούς πράκτορες, χρόνος εργασίας ναυτικών, κ.λπ.).

Ναυτικοί πράκτορες,εγκύκλιοι,λεμβούχοι-αχθοφόροι,κλοπές έργων τέχνης,απεργίες,λιποτάκτες ναυτικοί,φάροι και φανοί, πρόληψη αρχαιοκαπηλείας