Περιέχει εκθέσεις, κανονισμούς, έγγραφα της Κεντρικής Υπηρεσίας, οικονομικά, περί του πολεμικού στόλου (σκάφη, πληρώματα, άδειες, οικονομικά, λογιστικά, ταμειακά, Ναύσταθμο, εκπαίδευση, δικαιοσύνη, υγειονομία, ιματισμό, τροφοδοσία), τη λιμενική υπηρεσία, την εμπορική ναυτιλία, τους ναυτικούς αγωνιστές και ποικίλα έγγραφα.

Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με το Υπουργείο Γεωργίας, τη Διεύθυνση Υγείας και Πρόνοιας Νομαρχίας Λακωνίας, τη Διεύθυνση Κτηνιατρικής Νομαρχίας Λακωνίας, τη Νομαρχία Χανίων, το Υπουργείο Εμπορικής Ναυτιλίας, το Υπουργείο Υγείας και Πρόνοιας, το Υπουργείο Κοινωνικών Υπηρεσιών και τη Διεύθυνση Θαλάσσιων Συγκοινωνιών, έγγραφα περί γνωμοδοτήσεων για χρήση αιγιαλού, εκδόσεως αδειών τοποθέτησης τραπεζοκαθισμάτων και ομπρελών στη χερσαία ζώνη του Λιμένος Γυθείου, μέτρησης θερμοκρασίας επιφάνειας θαλάσσης, μεταφοράς χαρουπιών
Β. Στοιχεία Πλοίων - Πληρωμάτων: έγγραφα περί δρομολογίων επιβατηγών, οχηματαγωγών, θαλαμηγών, κρουαζιερόπλοιων και πλοίου στη γραμμή Γυθείου – Κυθήρων – Αντικυθήρων – Κισάμου, μηχανογραφικές καταστάσεις εισιτηρίων, έγγραφα περί αναγγελιών – καθυστερήσεων - απαγορεύσεων απόπλου, καρτέλες καταπλεόντων πλοίων με ξένη σημαία, άδειες πετρέλευσης σκαφών, άδειες εξόδου πληρωμάτων καταπλεόντων πλοίων
Γ. Στοιχεία Ναυτικών: εγκύκλιοι απογραφής ναυτικών, έγγραφα Γραφείου Ευρέσεως Ναυτικής Εργασίας (ΓΕΝΕ), κατάλογοι και δικαιολογητικά προσφερομένων για ναυτολόγηση ανέργων ναυτικών, εγκύκλιοι προκηρύξεων για την εισαγωγή σπουδαστών στις Ακαδημίες Εμπορικού Ναυτικού (Α.Ε.Ν.)
Δ. Στοιχεία Παραβάσεων: έγγραφα περί διοικητικών παραβάσεων κανονισμού λιμένος
Ε. Στοιχεία Αλιείας: εκθέσεις αλιευτικής επιθεώρησης.

Το αρχείο του Ναυτικού Διευθυντηρίου αποτελείται από φακέλους εγγράφων, η θεματολογία των οποίων είναι κοινή με του Υπουργείου Ναυτικών. Στο αρχείο περιλαμβάνονται έγγραφα για τα θέματα προσωπικού (ανάγκες του Ναυτικού Διευθυντηρίου και Ναυστάθμου, διορισμοί, απολύσεις, πρωτόκολλα ορκωμοσίας, μετακινήσεις κ.ά.), λογαριασμούς τροφοδοσίας πλοίων και μισθοδοσίας ναυτικών, θέματα δικαιοσύνης, υγειονομικής περίθαλψης, ναυτικής εκπαίδευσης, προμήθειες και διαχείριση υλικών, κατασκευαστικά και επισκευαστικά έργα στο ναύσταθμο και σε πλοία. Τα λυτά έγγραφα του αρχείου ταξινομούνται θεματικά ανά θυρίδα και φάκελο (56 θυρίδες). Επίσης, στο αρχείο συμπεριλαμβάνονται και κατάστιχα (κυρίως πρωτόκολλα).

Το υλικό αφορά τη λειτουργία της Ανώτερης Δημόσιας Σχολής Εμπορικού Ναυτικού Μηχανικών Ελευσίνας (ΑΔΣΕΝ/Μ/Ε). Περιέχει υπηρεσιακή αλληλογραφία με τις Διευθύνσεις του Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας που εμπλέκονται στην εκπαίδευση Ναυτικών: τη Διεύθυνση Εκπαίδευσης Εμπορικού Ναυτικού / Διεύθυνση Ναυτικής Εκπαίδευσης (ΔΕΚ ΔΝΕΚ), τη Διεύθυνση Οργάνωσης και Λειτουργίας Σχολών Εμπορικού Ναυτικού (ΔΟΛΣ), την Υπηρεσία Ναυτικών Μητρώων (ΥΝΜ), την Διεύθυνση Διοικήσεως (ΔΔ), την ΑΣΔΕΝ Πλοιάρχων Ασπροπύργου σχετικά με τη λειτουργία της Σχολής. Περιλαμβάνονται έγγραφα σχετικά με:

α) Διοίκηση: ανάρτηση ημερησίων διαταγών, οικονομικά, την εγγραφή των τέκνων του προσωπικού σε κατασκηνώσεις της Χριστιανικής Αδελφότητας Νέων (ΧΑΝ), κατάθεση δικαιολογητικών εγγραφής υποψηφίων, μαθήματα ξένων γλωσσών (κυρίως χωρών της ΕΟΚ), συντήρηση κτηριακών εγκαταστάσεων, λειτουργία Γνωμοδοτικού Συμβουλίου ΔΣΕΝ κ.ά

β) Φοίτηση: κανονισμούς εκπαίδευσης, προγράμματα σπουδών, πίνακες μετεξεταστέων και αποφοίτων, σχέσεις με ιδιωτικές ναυτικές σχολές, μέριμνα για την έκδοση ναυτικών φυλλαδίων των αποφοίτων (ΥΝΜ), διεξαγωγή διαλέξεων από ιδιωτικές εταιρείες (Motor Oil) κ.ά.

γ) Διδακτικό προσωπικό: θέματα επιμόρφωσης, διορισμών, συμμετοχή σε συνέδρια / σεμινάρια, μελέτες και σχολιασμό διδακτικών βιβλίων εκδόσεων κ.ά.

Φύλλα ελέγχου προσόντων και ατομικοί φάκελοι ναυτικών ειδικοτήτων όπως: αρχιμάγειροι, ατμομηχανικοί , ατμομηχανικοί Α΄ τάξεως , ατμομηχανικοί Β΄τάξεως, Ατμομηχανικοί Γ΄ τάξεως, εφαρμοστές μηχανών εσωτερικής καύσης Β΄ και Γ΄ τάξεως, θαλαμηπόλοι, αρχιθαλαμηπόλοι, θερμαστές, λιπαντές, μάγειροι Α΄ τάξεως, Μάγειροι Β΄ τάξεως, μηχανικοί δόκιμοι, ναύτες, πλοίαρχοι (Διεύθυνση Εκπαίδευσης Ναυτικών Δ΄), φάκελοι Δορυφορικού Συστήματος Παρακολούθησης EMSA (European Maritime Safety Agency - Ευρωπαϊκή Υπηρεσία Ασφάλειας Ναυσιπλοΐας), φάκελοι σχετικά με ασκήσεις καταπολέμησης της ρύπανσης με συνημμένο φωτογραφικό ή/και οπτικοακουστικό υλικό, φάκελοι γενικού αρχείου (Διεύθυνση Εκπαίδευσης Ναυτικών Γ΄) με την πρωτότυπη αλληλογραφία της υπηρεσίας.

Το αρχείο αποτελείται από υλικό που χρησιμοποιήσε κατά καιρούς ο Χ. Ντούνης για τη συγγραφή βιβλίων και άρθρων και αφορά κυρίως την εμπορική ναυτιλία και θέματα ναυτικής εκπαίδευσης. Το αρχείο περιλαμβάνει επίσης χειρόγραφα, αλληλογραφία, διοικητικά και επίσημα έγγραφα (πιστοποιητικά, διπλώματα, αναφορές, νηολογήσεις, ναυτολόγια κ.ο.κ.), έντυπα, αποκόμματα Τύπου και φωτογραφικό υλικό.

Βιβλιάριο Ταμιευτηρίου, Ιατρόσημα, επιστολές, ψηφοδέλτια κομμάτων, γραμματόσημα, τραπεζογραμμάτιο, τρίπτυχο ενημερωτικό, κόλλα αλληλογραφίας και φάκελος με το λογότυπο του Ξενοδοχείου «Παλλάς» του Βόλου, κάρτα διαφημιστική του Ξενοδοχείου «Ιωλκός» του Βόλου, ενημερωτικό έγγραφο του Ξενοδοχείου «Ξενία» του Βόλου, ευχετήριες κάρτες, ημερολόγια τσέπης, φύλλα της εφημερίδας «Γεωργικά Νέα», βιβλίο με τον κανονισμό του Ιδιωτικού Ναυτικού Γυμνασίου (Διδακτηρίου – Οικοτροφείου) «Ο Νηρεύς», τεύχος του περιοδικού «Η Αφή των Τυφλών», βιβλίο γενικών οδηγιών ανωτέρων σπουδών της «Ακαδημίας Θεωρητικών και Θετικών Επιστημών Δημ. Α. Τσίκα» ακαδημαϊκό έτος 1935-1936, τουριστικός οδηγός Μαγνησίας, διαφημιστικό φυλλάδιο – οδηγός για κρουαζιέρα στην Ιταλία (στα αγγλικά), έντυπα, τιμολόγια, προσκλήσεις του 1957.