Το αρχείο διαρθρώνεται σε τέσσερις (4) αρχειακές σειρές: 1) Φάκελοι Νομαρχίας περί Εμπορίου (Αποφάσεις – Πρακτικά Συνεδρίων- Εκθέσεις), 2) Διεύθυνση Αγορανομίας (Αποφάσεις - Διαταγές - Αρτοποιεία και Αρτεργάτες – Αρτοποιητική Νομοθεσία - Κοστολόγηση Άρτου - Κυλινδρόμυλοι), 3) Διεύθυνση Τεχνικού Ελέγχου Α΄και Β΄ (Αποφάσεις – Διαταγαί – Γενικά Στοιχεία Ελαιοτριβείων – Βιοτεχνίαι Αεριούχων Ποτών – Στοιχεία Παραγωγής – Πυρηνελαιουργεία – Σαπωνοποιεία, Εγκύκλιοι Γενικού Χημείου του Κράτους - Δείγματα Πειραματικών Εργαστηρίων), 4) Φάκελοι Παραβάσεων και Στατιστικών Στοιχείων Εμπορίου.