Αρχειακό υλικό που αφορά τις αρμοδιότητες του Τμήματος Β΄ Διοικητικής Οργάνωσης και Νομοθετικού Συντονισμού: οργάνωση υπηρεσιών Υπουργείου, μεταβίβαση αρμοδιοτήτων, οργάνωση εποπτευόμενων νομικών προσώπων, επεξεργασία / εκτίμηση των αναγκών σε προσωπικό του Υπουργείου και των εποπτευόμενων νομικών προσώπων και περιγραφή θέσεων εργασίας, μέριμνα για συγκρότηση υπηρεσιακών συμβουλίων πολιτικού προσωπικού ΥΕΝ, μέριμνα για τη συγκρότηση Διοικητικών Συμβουλίων των εποπτευόμενων νομικών προσώπων και Υπηρεσιακών Συμβουλίων των εποπτευόμενων νομικών προσώπων, κωδικοποίηση νομοθεσίας, κοινοβουλευτικό έλεγχο. Περιέχονται φάκελοι και υπηρεσιακά βιβλία (κυρίως πρωτόκολλα αλληλογραφίας). Από τα νομικά πρόσωπα υπάρχουν φάκελοι που αφορούν, κυρίως, τον Οργανισμό Λιμένος Πειραιώς (ΟΛΠ) και τον Οργανισμό Λιμένος Θεσσαλονίκης (ΟΛΘ). Το αρχείο συγκεντρώθηκε στην Διεύθυνση Οργάνωσης και Πληροφορικής μετά την μεταφορά αρμοδιοτήτων της προκάτοχης Διεύθυνσης: Διεύθυνσις Οργανώσεως και Εκπαιδεύσεως (1977-1988).

Κανονικές εισπράξεις λιμενικών τελών, επιθεώρηση λιμενικών αρχών, καταγραφή ναυαγίων, Γενικές Συνελεύσεις ΟΛΠ και ΟΛΘ και φάκελοι διεθνών Οργανισμών και συναντήσεων.

Το περιεχόμενο του αρχείου αποτυπώνει ανάγλυφα τη συνδικαλιστική δραστηριότητα, την οικονομική διαχείριση και την καθημερινή οργάνωση της εργασίας των σωματείων λιμενεργατών και υπαλλήλων του λιμένα Θεσσαλονίκης. Τα 84 κατάστιχα και οι φάκελοι της ενότητας ταξινομούνται στις ακόλουθες βασικές θεματικές κατηγορίες τεκμηρίων:
Διοικητική Λειτουργία & Συνδικαλιστική Δράση: Περιλαμβάνονται τα επίσημα πρακτικά συνεδριάσεων των διοικητικών συμβουλίων και των γενικών συνελεύσεων των σωματείων των λιμενεργατών και των υπαλλήλων, τα οποία καταγράφουν τις αποφάσεις, τα αιτήματα και τις διεκδικήσεις των εργαζομένων.
Οικονομική Διαχείριση Σωματείων: Βιβλία ταμείου των σωματείων, καθώς και αναλυτικές καταστάσεις πληρωμών, οι οποίες αποτυπώνουν τις οικονομικές ροές, τις συνδρομές των μελών και τις δαπάνες των συνδικαλιστικών φορέων.
Οργάνωση & Παρακολούθηση της Λιμενικής Εργασίας: Κατάστιχα και ημερήσια έγγραφα που αφορούν τη διαχείριση του εργατικού δυναμικού και τις καθημερινές λειτουργίες του λιμανιού, όπως:
Ημερήσια δελτία κανονικής εργασίας του τακτικού λιμενεργατικού προσωπικού.
Βιβλία ομαδοποιήσεως επίκουρων ή εκτάκτων εργατών, τα οποία αποτυπώνουν τον τρόπο κατανομής της έκτακτης εργασίας στο λιμάνι.