Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: πρωτόκολλα κοινών εισερχομένων εγγράφων και εισερχομένων σημάτων, βιβλία ταχυδρομικής υπηρεσίας Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας, υποβολές εντύπων επιθεώρησης υλικών και μέσων απορρύπανσης, έγγραφα περί μεταφοράς νεκρών, εξαφάνισης ανηλίκων, ναυτικών ατυχημάτων και ελέγχων αλκοτέστ
Β. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: έγγραφα περί των δρομολογίων των πλοίων «Ελαφόνησος», «Πορφυρούσα», «Αγιαννάκης» και «Κάτω Νησί», πίνακες εκδοθέντων εισιτηρίων επιβατών ανά λιμένα, έγγραφα περί διακίνησης επιβατών την Καθαρά Δευτέρα, πίνακες καταχώρισης λέμβων, στατιστικά στοιχεία ναυτιλιακής κίνησης, βιβλία διαίρεσης φυλάκων πληρώματος
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: βιβλία αδειών προσωπικού, έγγραφα περί του υπηρετούντος προσωπικού στους Λιμενικούς Σταθμούς Μονεμβασίας και Καψαλίου
Δ. Στοιχεία Ελέγχων - Απολογισμοί: έγγραφα περί ετησίου ελέγχου συμμόρφωσης υπόχρεων λιμενικών εγκαταστάσεων, απολογισμού προστασίας της θάλασσας, ελέγχου φορτηγών οχημάτων, εξαμηνιαία δελτία δραστηριότητας λιμενικής αρχής
Ε. Στοιχεία Παραβάσεων: πίνακες προστίμων, έγγραφα περί εφαρμογής νόμων και κοινών υπουργικών αποφάσεων.

Εορτές - Τελετές ορκωμοσιών - Ηθικές αμοιβές, Λειτουργία Κεντρικού Ιατρείου ΥΕΝ, Έλεγχος αλιείας (αλιευτικές επιθεωρήσεις), φάκελος αλληλογραφίας ΑΓΥΕ (Αποθήκης Γενικής Ύλης και Εντύπων)

Το αρχείο περιέχει αιτήσεις-δηλώσεις ατομικών ερασιτεχνικών αδειών αλιείας και διαταγές του Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας.

Διαταγές υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας, έντυπα σήματα, τηλεγραφήματα, έγγραφα συνταξιοδότησης προσωπικού.

Αλληλογραφία με Υπουργείο Εμπορικής Ναυτιλίας, έγγραφα σχετικά με οικονομικά στοιχεία, διατροφή σπουδαστών, προσλήψεις καθηγητών κ.α.