Το αρχείο περιλαμβάνει διοικητική αλληλογραφία, αποφάσεις και διαταγές, φακέλους επιδοτήσεων, επιβολές προστίμων, ανανεώσεις αδειών, αιτήσεις ιχθυοκαλλιέργειας, πληροφοριακά έντυπα και εκδόσεις επιστημονικών συνεδρίων.

Το αρχείο περιέχει αλληλογραφία, έγγραφα για υγειονομικά θέματα, μηνιαία δελτία συμβάντων, άδειες αλιείας κ.ά.

Το αρχείο περιέχει αιτήσεις-δηλώσεις ατομικών ερασιτεχνικών αδειών αλιείας και διαταγές του Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας.