Χειρόγραφα Οικουμενικού Πατριαρχείου, Μοναχολόγιο, κτηματολόγιο, οθωμανικά χειρόγραφα με θέματα περιουσίας της Μονής (αρχείο σε ψηφιακή μορφή)

Πατριαρχικά έγγραφα, μεταφράσεις τουρκικών εγγράφων, καταγραφή βιβλίων και ειδών μουσείου, βιβλία αποθήκης, ημερολόγια, καθολικά, βιβλία ταμείου, βιβλίο αιγοπροβάτων, πρωτόκολλα, κτηματολόγιο, ευχολόγιο, μοναχολόγιο

Αντίγραφο διατάγματος του Καρόλου 6ου Αυτοκράτορα και Βασιλιά της Γερμανίας, των Ισπανιών, των Δύο Σικελιών, της Ουγγαρίας κλπ, με το οποίο λαμβάνει υπό την προστασία του τη Μονή του Ευαγγελιστή Ιωάννη της Πάτμου κατά των πειρατών.

Σχέδιο που απεικονίζει τη μονή Καισαριανής το 1745.

Κατάστιχο εσόδων - εξόδων

Ακέφαλο χειρόγραφο που περιέχει αφιερώσεις στη Μονή Προδρόμου Τερβέκιστας (ή Δερβέκιστας: σημερινή Ανάληψη Αιτωλοακαρνανίας) από το 1733 έως το 1824. Επίσης, εκφωνήσεις από 20 Μαΐου 1820 έως 27 Μαρτίου 1831.

Γράμματα πατριαρχών Κωνσταντινουπόλεως: Διονυσίου Δ' (1676), Νεοφύτου ΣΤ' (1[7]36), Σεραφείμ Β' (1759), Σαμουήλ (1763), Θεοδοσίου Β' (1769), του μητροπολίτη Ουγγροβλαχίας Γρηγορίου (1775) κ.ά. προς τη μητρόπολη Παροναξίας, αναφερόμενα στις ρυθμίσεις θεμάτων των μονών της μητρόπολης Παροναξίας, όπως: παράνομες πωλήσεις μοναστηριακών εκτάσεων, ηγουμενίες, διεκδικήσεις χωραφιών, νερόμυλων, σύσταση σχολής Ελληνικών στη Νάξο (1799), τη σταυροπηγιακή μονή του Τιμίου Σταυρού στη Ναξο (1801) κ.ά.

Σιγίλλιο του Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως Νεοφύτου σε περγαμηνή για τη Μονή Καισαριανής.

Σιγίλλιο σε περγαμηνή του Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως Γρηγόριου Ε΄ σχετικά με τη Μονή της Υπεραγίας Θεοτόκου Χοζοβιώτισσας στην Αμοργό.

Έγγραφα πατριαρχικά, επισκοπικά & νομικού χαρακτήρα της Ιεράς Μονής Αγίου Αντωνίου Μάρπησσας Πάρου.

Συλλογή εγγράφων διαφόρων Μονών της Αιτωλίας (πωλητήρια, διαθήκες, ψυχοχάρτια, αφιερωτικά, ομολογίες, επιστολές, οθωμανικά ταπιά (tapu), χοτζέτια (huccet), φετφάδες (fetva), μπουγιουρντί (buyuruldu), τεζκερέδες (tezkere), κ.ά.) που αφορούν, κυρίως, στην κτηματική περιουσία των Μονών.

Συλλογή εγγράφων από τη Νάξο:

1. Κώδικας στον οποίο καταχωρίζονται μοναστηριακές συμβάσεις της Νάξου της περιόδου από 27 Ιανουαρίου 1755 έως 12 Δεκεμβρίου 1791
2. Σπάραγμα κώδικα με μοναστηριακές συμβάσεις της Νάξου από 23 Σεπτεμβρίου 1751 έως 1808
3. Εκκλησιαστικά και νοταριακά έγγραφα των ετών 1699-1844 που αναφέρονται, κυρίως, στη Μονή του Αγίου Ελευθερίου στο χωριό Σαγκρί της Νάξου και στη σχολή της μονής.

Συλλογή εγγράφων σχετικά με την Φολέγανδρο:

1. Πατριαρχική κοινή απόδειξη περί της Μονής της νήσου Πολυκάνδρου (Φολεγάνδρου) της Επαρχίας Σιφνομήλου Κοιμήσεως της Θεοτόκου ότι επλήρωσε προς την Μεγάλην Εκκλησίαν το ετήσιο χρέος, Μάρτιος 1799.
2. Ανάλογη απόδειξη της 1ης Μαρτίου 1801.
3. Έγγραφο του Μαρτίου του 1816 προς την νήσο Πολύκανδρο (Φολέγανδρο) που εκδόθηκε από το Υψηλό Διβάνι περί διορισμού επιτηρητών.
4. Ομολογία ενυπόγραφος και ενσφράγιστος σχετικά με δάνειο της Δημογεροντίας Πολυκάνδρου (Φολεγάνδρου) από την κοινή Εκκλησία, 2 Απριλίου 1828.
5. Γράμμα ενσφράγιστο και ενυπόγραφο σχετικά με αφιέρωση κτήματος σε ναό της Πολυκάνδρου (Φολεγάνδρου), 11 Μαΐου 1830.
6. Έγγραφο της Δημογεροντίας Πολυκάνδρου (Φολεγάνδρου) στις 8 Μαΐου 1832 προς τους επιτρόπους της κοινής Εκκλησίας.
7. Έντυπο διάταγμα της Αντιβασιλείας στις 4 Δεκεμβρίου 1834 περί μοναστηρίων,
   8-9. Δύο (2) έγγραφα οθωμανικά.

Δύο φιρμάνια, δύο ιλάμια και δύο αρζουχάλια, σχετικά κυρίως με τις φοροαπαλλαγές της μονής Ορθοκωστάς και άλλων μοναστηριών της Κυνουρίας

Ταπιά και φετφάς για χωράφια της μονής του Φονιά στην περιοχή του Αγιώργη (Νεμέας), καθώς και ένα έγγραφο του 1743 σχετικό με μια διένεξη του ίδιου μοναστηριού με το χωριό Ταρσός