Βιβλία Εισερχομένων-εξερχομένων εγγράφων, ατομικοί φάκελοι εργαζομένων, άδειες απόπλου, δελτία απόπλου, δρομολόγια, ημερολόγια παράδοσης-παραλαβής καθηκόντων, καταγραφής συμβάντων κ.ά..

Συνοπτικά στατιστικά των ετών 2008-2009, πενθήμερα-νυχτερινά, μεταφορές ασθενών, ατομικές ερασιτεχνικές άδειες, απόψεις επί δρομολογίων, ΜΗΔΕΑΔ κ.ά..

Ατομικοί φάκελοι προσωπικού, άδειες τουρκικών πλοίων έτους 2014, λίστες επιβατών - πληρωμάτων τουρκικών πλοίων 2015, βιβλία ημερήσιας αναφοράς προσωπικού, φάκελοι πλοίων Β΄κλάσης και φορτηγίδων κ.ά..

1. Γραφείο τροχαίας: φάκελος εκδηλώσεων
2. Διαβιβαστικά κλήσεων προς Λιμενικό ταμείο Ν. Σάμου
3. Ενστάσεις
4. Αλληλογραφία για πλοία-σκάφη
5. Δικαιολογητικά γραμματίων είσπραξης ΤΚΕΠ, τοπικό κλιμάκιο επιθεώρησης πλοίων
6. Αρχείο πιστοποιητικών Γενικής Επιθεώρησης
7. Αναγγελίες προς ναυτιλομένους
8. Μισθοδοσία προσωπικού 2004
9. Σήματα ανεργίας 2004
10. Δικαιολογητικά υγειονομικών-προσωπικού
11. Σήματα ανεργίας
12. Κοινό αρχείο ναυτολογίας: συνταξιοδοτήσεις ναυτικών
13. Κοινό αρχείο επιθεώρησης
14. Κοινό αρχείο επιστασίας
15. Κινήσεις τουρκικών σκαφών
16. Κινήσεις Κεφαλαίου Λιμενικής Αστυνομίας, Λιμενική Αστυνομία
17. Κεφάλαιο Λιμενικής αστυνομίας.
18. Τροχαία ατυχήματα.
19. Ενστάσεις τροχαίας
20. Πενθήμερα νυχτερινά προσωπικού
21. Φάκελος Βουλευτικών Εκλογών
22. Νυχτερινά προσωπικού
23. Κοινό αρχείο Επιστασίας
24. Δημοτικές εκλογές
25. Βάρδιες-υπηρεσίες προσωπικού
26. Τιμές εντύπων ΕΔΕΝ
27. Φαρικά τέλη
28. Πενθήμερα προσωπικού
29. Κοινό αρχείο επιστασίας
30. Κοινό αρχείο επιστασίας
31. Βάρδιες, υπηρεσίες προσωπικού
32. Πρωτόκολλα παράδοσης-παραλαβής Λ/Σ Πυθαγορείου-Λ/Σ Καρλοβάσου
33. Ναυλοσύμφωνα
34. Αιτήσεις ατομικών ερασιτεχνικών αδειών έτος 1999-2000
35. Κατάπλοι φορτηγών-δεξαμενόπλοιων
36. Κοινό αρχείο Διεύθυνσης Εκπαίδευσης Ναυτικών
37. Κοινό αρχείο ΔΛΛΕ.
38. Βιβλίο παραλαβής-κατανάλωσης καυσίμων χερσαίων μέσων 40.
    Ευρετήριο τιμωρηθέντων Λ/Κ σκαφών
39. Φάκελος ευρωεκλογών
40. Δικαιολογητικά γραφείου πλωτών χερσαίων μέσων
41. Φάκελος κοινοτικών-νομαρχιακών εκλογών
42. Υποβολή πινάκων μεταθέσεων
43. Υπηρεσίες-άδειες προσωπικού
44. Φάκελος ναυτικής εβδομάδας

Εκμισθώσεις, λίστες πλοίων, στατιστικά.

Βιβλία: Πρωτόκολλα αλληλογραφίας, κατάπλου-απόπλου πλοίων, συμβάντων ημερησίων αναφορών, πληρωμάτων Υ.Ε.Ν., κ.ά..
Έγγραφα: Απόρρητον και εμπιστευτικόν αρχείον, δικογραφίες, ερωτηματολόγια κατασκευής λιμένων και αγκυροβολίων, στατιστικά στοιχεία επιβατών μεταξύ Σάου - Κουσάντασι, κ.ά..

Βιβλίο Μητρώου και φάκελοι: Αλληλογραφία, ατομικοί φάκελοι, μεταβολές λιμενικών αρχών - σύσταση, κατάταξη στρατιωτικού προσωπικού Λ.Ε., προγράμματα μετεκπαίδευσης- επιμόρφωσης προσωπικού, αποζημίωση προσωπικού Λ.Ε. για εργασία, νυχτερινώς απασχολούμενοι, ετήσιοι πίνακες καυσίμων, δελτίο συμβάντων κ.ά..

Φάκελοι εγγράφων: πραγματογνωμοσύνες - εισαγγελικοί λειτουργοί - διερμηνείς, περί βολών, αλληλογραφία με Λιμεναρχείο Σάμου - λιμεναρχεία, άδειες ρυμούλκησης, ελευθεροκοινωνία πλοίων, άδειες μεταφοράς νεκρών με πλοίο - ασθενών - ζώων, εκχώρηση αιγιαλού, αλληλογραφία για ρύπανση θαλάσσια, περί ναυτιλιακών εγγράφων, σήματα ανέργων ναυτικών, αλληλογραφία με Δ.Ε.Π. για θέματα αξιοπλοΐας κ.λπ..

Δελτία συμβάντων, καταστάσεις Φ.Λ.Τ. Σάμου, πίνακας παραβιάσεων Κ.Ο.Κ., δελτία κίνησης, φαρικά τέλη, δελτία δραστηριότητας, κ.ά..

Αιτήσεις έκδοσης αδειών αλιείας, εκθέσεις επιθεωρήσεων, αιτήσεις ανέργων κ.ά..

Φάκελοι κατάπλου τουρκικών πλοίων, υπηρεσία υγειονομικού, απογραφή συνταξιούχων Ν.Α.Τ., αναφορές Frontex κ.ά...

Δικαιολογητικά Ν.Α.Τ., κεφάλαιο Λ.Α. Υπουγείου Οικονομικών, εισπράξεις λιμενικών τελών, αναφορές συμβάντων, υποβολή δελτίων ναυτιλιακής κίνησης κ.ά..

Ναυλοσύμφωνα, σήματα τουριστικών θαλαμηγών, καταστάσεις κατάπλου και απόπλου, Κ/2 καταστάσεις, τέλη, καταστάσεις κίνησης επιβατών.