Ο Νικόλαος Γ. Οικονομίδης ήταν γιος του φιλολόγου Γεωργίου Οικονομίδη (1813-1887) και ανιψιός του Ιωάννη Οικονομίδη (1812-1884), επίσης φιλολόγου, καθηγητή της Ιονίου Ακαδημίας, πολιτικού (υπουργός Παιδείας) και γραμματέως του Γεωργίου Α΄. Η οικογένεια Οικονομίδη κατάγεται από την Κύπρο. Διέφυγαν το 1821 μετά το ξέσπασμα της ελληνικής επανάστασης και εγκαταστάθηκαν πρώτα στην Τεργέστη και το 1825 στην Κέρκυρα. Ο θείος του Γεωργίου και του Ιωάννη, Πέτρος Οικονομίδης, ήταν δημογέροντας στη Λευκωσία. Συνελήφθη από τους Τούρκους με την κατηγορία ότι ήταν Φιλικός και αποκεφαλίστηκε στις 10 Ιουλίου 1821.
[Πηγή σύνταξης βιογραφικού: Μεγάλη Ελληνική Εγκυκλοπαίδεια, τ.ΙΗ, Αθήνα: Πυρσός, 1932: 747.]