Επίσημα έγγραφα, επιστολές κλπ. του Αγώνα και υστερότερα από τα αρχεία των Δημ. Υψηλάντη, Διον. Ρώμα, Π. Αναγνωστόπουλου κ.ά., αρχείο του συνοικισμού των Χίων στον Πειραιά, βιογραφίες, διατριβές και απομνημονεύματα (Σπυρομίλιου κ.ά.), σχέδια για άρθρα και άλλα τεκμήρια των ιστορικών ερευνών του Φιλήμονα.

Ιδιωτικά έγγραφα του Φιλήμονα, έγγραφα Π. Αναγνωστόπουλου, έντυπα αποδείξεων συνδρομών με υπογραφή Α. και Ν. Υψηλάντη (1/1/1821), τεσκερέδες επάρχου Τριπολιτσάς Κων. Ράδου (1825), λογαριασμοί, τελωνειακά και άλλα διάφορα Οθωνικής περιόδου.

Πιο αναλυτικά (από κατάλογο Λίνου Πολίτη):
Παραλειπόμενα του Αρχείου:
1.Διάφορα έγγραφα (Φλ 1-20)

2. Διάφοροι λογαριασμοί (και Κουντουριωτών, Φιλήμονος, Φρουραρχείου, Π.Αναγνωστοπούλου;) (Φλ 21-151)
3. Ιδιωτικά Φιλήμονος (Φλ 152-170)
4. Διάφορα (Φλ 171-196)
5. Έγγραφα Π. Αναγνωστοπούλου, φιλικού (Φλ 197-215)
6. Βεβαιωτικά φλορινίων ολλανδικών (Φλ 216-294)
7. Διάφοροι σημειώσεις (Φλ 295-476)
8. “Τεσκερέδες” Φεβρουαρίου και Μαρτίου 1825 κ.ά. (χ.α)