Το αρχείο περιλαμβάνει αρχειακό υλικό από όλα τα Τμήματα της Υπηρεσίας: α) Τμήμα Απογραφής, β) Τμήμα Διπλωμάτων, γ) Τμήμα Πτυχίων και Αδειών, δ) Τμήμα Μητρώων και ε) Γραμματεία Περιλαμβάνονται: Ναυτικά φυλλάδια από διάφορες ναυτικές περιφέρειες, φύλλα προσόντων ναυτικών, φάκελοι εξετάσεων απόκτησης διπλώματος διαφόρων ναυτικών ιδιοτήτων, φάκελοι πτυχίων κ.ά. εργατών θαλάσσης, αλληλογραφία με διάφορα θέματα, οικονομικά, τελωνειακά, εκπαιδευτικά, διοικητικά κ.ά. Ειδικότερα τα ναυτικά φυλλάδια είναι από τις εξής ναυτικές περιφέρειες Α΄ Ναυτική Περιφέρεια α) ΑΤΤΙΚΗΣ (πλην Επαρχίας Μεγαρίδος, Δήμου Λαυριωτικής – Κερατέας και Κοινοτήτων Αναβύσσου, Ραφήνας, Νέας Μάκρης) Επαρχίας Ύδρας–Τροιζηνίας–Αιγίνης και Δήμου Σπετσών). β) Η εκ της Επαρχίας ΜΗΛΟΥ του Νομού Κυκλάδων Β΄ Ναυτική Περιφέρεια ΚΛ Πατρών (ΑΧΑΙΑΣ (πλην της Επαρχίας Αιγιαλείας) ΕΥΡΥΤΑΝΙΑΣ-ΑΙΤΩΛΙΑΣ ΚΑΙ ΑΚΑΡΝΑΝΙΑΣ (πλήν των Επαρχιών Βάλτου-Βονίτσης και Ξηρομέρου). Γ΄ Ναυτική Περιφέρεια Λ/Χ ΣΥΡΟΥ - ΚΥΚΛΑΔΩΝ (πλην των Επαρχιών Μήλου–Κέας–Τήνου και Δήμου Μυκόνου) και Επαρχίας Άνδρου. Δ΄ Ναυτική Περιφέρεια Λ/Χ Βόλου (Μαγνησίας, Λάρισας, Τρικάλων, Καρδίτσας) Ε΄ Ναυτική Περιφέρεια Λ/Χ ΚΕΡΚΥΡΑΣ Ζ΄ Ναυτική Περιφέρεια Λ/Χ Χανίων Η΄ Ναυτική περιφέρεια Λ/Χ ΜΥΤΙΛΗΝΗΣ - ΛΕΣΒΟΥ (πλην Επαρχίας Λήμνου) Θ΄ Ναυτική περιφέρεια Κ.Λ. ΧΙΟΥ. Ι΄ Ναυτική περιφέρεια Λ/Χ ΑΛΕΞΑΝΔΡΟΥΠΟΛΕΩΣ ΕΜΒΡΟΥ – ΡΟΔΟΠΗΣ ΣΤ΄ Ναυτική Περιφέρεια Λ/Χ Θεσσαλονίκης- ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ – ΚΙΛΚΙΣ – ΠΕΛΛΗΣ – ΚΟΖΑΝΗΣ – ΦΛΩΡΙΝΗΣ – ΚΑΣΤΟΡΙΑΣ – ΗΜΑΘΙΑΣ – ΠΙΕΡΙΑΣ και ΧΑΛΚΙΔΙΚΗΣ (εκτός Επαρχίας Αρναίας).