Διοικητική αλληλογραφία του Υπουργείου/Γραμματείας Δικαίου με άλλα υπουργεία, γραμματείες, αρχές, δημόσιες υπηρεσίες/επιτροπές/όργανα (Εκτελεστικό Σώμα, Βουλευτικό Σώμα, Βουλή των Ελλήνων, Αντικυβερνητική Επιτροπή, Υπουργείο Εσωτερικών, Υπουργείο Θρησκείας, Υπουργείο Αστυνομίας, Υπουργείο Οικονομίας, Υπουργείο Πολέμου, Υπουργείο Ναυτικών, Γραμματέα της Επικρατείας και Υπουργό των Εξωτερικών Υποθέσεων, Γερουσία της Δυτικής Χέρσου Ελλάδος, Πελοποννησιακή Γερουσία, Δικαστήριο των Εκκλήτων, Δικαστική Επιτροπή Αθηνών, Επιτροπή του εν Αθήναις Κριτηρίου, Θαλάσσιο Δικαστήριο, Εμπορικό Δικαστήριο Σύρου, Πενταμελή Επιτροπή Τόπον επέχουσα Θαλασσίου κριτηρίου, Προσωρινό Εγκληματικό Δικαστήριο, Εν Αιγίνη Επιτροπή των Ψαριανών, Αρμοστή της Αστυνομίας, Γενικούς Αστυνόμους επαρχιών, Επάρχους, Εφόρους Επαρχιών, Δημογεροντίες, Προκρίτους κ.ά.) και φυσικά πρόσωπα με επιστολές, αναφορές, διαταγές, εντολές, διαβιβαστικά κ.ά. σχετικά με υπηρεσιακά θέματα αρμοδιότητας του υπουργείου: οργάνωση-αρμοδιότητες Υπουργείου Δικαίου, διαβίβαση νόμων, εντολές προσαγωγών/σύλληψης/φυλάκισης/αποφυλάκισης κατηγορουμένων/εναγομένων, μισθοδοσία υπαλλήλων της διοίκησης, μισθολογικές διαφορές, διορισμοί, κλήσεις προσώπων για εξετάσεις/απολογίες/ανακρίσεις, επίλυση υποθέσεων με διαφιλονικούμενες ιδιοκτησίες ή άλλες οικονομικές διαφορές μεταξύ Ελλήνων και Τούρκων λόγω εμπόλεμης κατάστασης, αγωγές-καταγγελίες κατά τρίτων, σύσταση/διορισμός δικαστηρίων/επιτροπών, δικαστικές αποφάσεις, δικαστικά εντάλματα, δικαστικές υποθέσεις, παραγγελία διενέργειας ερευνών, κλοπές, ζωοκλοπές, ληστείες, βιαιοπραγίες, φόνοι, οικονομικές διαφορές, χρεωστικές ομολογίες, κτηματικές διαφορές, κιβδηλοποιία, ανακρίσεις, απολογίες, μαρτυρικές καταθέσεις, αποζημιώσεις, πληρωμή χρεών, κληρονομικά, οικογενειακά/γαμήλια ζητήματα, καταγγελίες για απείθεια σε δικαστικές αποφάσεις, καταχρήσεις στρατιωτικών, εθνικές πρόσοδοι, εμφύλιες διαμάχες, κατασκοπία, αναζήτηση δραπετών/φυγάδων, βιασμοί, πειρατεία/δράση κουρσάρων-καταδρομικών, λάφυρα/λείες, εμπορικές διαφορές, μοναστήρια, εκπαίδευση κ.λπ

Κατάστιχο του εμπόρου σιτηρών Κ. Γεωργούλη από τη Μύκονο. Πρόκειται για βιβλίο χρεωστών με ονομαστικούς λογαριασμούς ιδιωτών και άλλων εμπόρων, όπως ο Μάρκος Καλογεράς, Μιχαήλ Σταυρακόπουλος, Λορέντζος Καμπάνης. Στην αρχή του κατάστιχου υπάρχει αλφαβητικό ευρετήριο χρεωστών και στο τέλος, μεταξύ άλλων ιδιωτικών σημειώσεων, συμπεριλαμβάνονται ιατρικές συνταγές (γιατροσόφια).

Το αρχείο του Στέφανου Μακρυμίχαλου περιλαμβάνει υλικό που αφορά τις ιστοριοδιφικές του έρευνες και λευκώματα αποκομμάτων και δημοσιευμάτων του. Περιλαμβάνει αντίγραφα από τα αρχεία της οικογένειας Γρυπάρη, του αρχείου Μυκόνου (από τα Γενικά Αρχεία του Κράτους), αρχείο Σκυλίσση, κείμενα διαφορόρων άρθρων του Μακρυμίχαλου και του υλικού τεκμηρίωσής τους που αφορούν τις μελέτες του Μακρυμίχαλου

• Άρθρο σχετικά με το υπόμνημα του Γ. Γρυπάρη και Σολωμού "περί ερημονήσων" στην Εθνοσυνέλευση του 1864. Περιέχεται υλικό που αφορά τη συγγραφή του άρθρου: βιογραφικά σημειώματα, γενεαλογικά της οικογένειας Γρυπάρη, το κείμενο της μελέτης του Μακρυμίχαλου, αντίγραφο του υπομνήματος κ.λπ.).

Αρχείο Γεωργίου Γρυπάρη

Αντίγραφα των εγγράφων του αρχείου Γεωργίου Γρυπάρη, ανώτατου δικαστικού και πληρεξουσίου Μυκόνου στην Εθνοσυνέλευση του 1864 που μαζί με τον Μ. Σολωμό είχαν υποβάλει υπόμνημα «περί των εις την Μύκονον ανηκουσών ερημονήσων». Το υλικό του αρχείου του Γ. Γρυπάρη περιλαμβάνει έγγραφα που αφορούν τον ίδιο και την οικογένεια Γρυπάρη: οικονομικά αλληλογραφία (οικογενειακή και κοινοποιήσεις διορισμών του Γεωργίου κ.λπ.1689-1889) . Τα έγγραφα του αρχείου παραχωρήθηκαν στον Μακρυμίχαλο από την την Καίτη Σακελλαροπούλου, απόγονο της οικογένειας Γρυπάρη (ο Γεώργιος ήταν προπάππους της). Η οικογένεια Γρυπάρη υπήρξε από τις πιο ισχυρές της Μυκόνου (ο Θεόδωρος Γρυπάρης διετέλεσε δήμαρχος Μυκόνου (1891-1895, 1903-1907)

Αρχείο Μυκόνου (ο τίτλος είναι αποδιδόμενος)

Ποικίλα:
Α. Αρχείο Μητρόπολης Σύρου . Φάκελος με 6 υποφακέλους
Β. Αρχείο Μητρόπολης Σύρου . Φάκελος με 7 υποφακέλους
Γ. Ημερολόγια
Δ. Αρχείο Κωνσταντίνου Ξενιώτη, παιδιάτρου
1 φάκελος με 1 υποφάκελο και στηθοσκόπιο σπασμένο
Ε. Φάκελος με 2 υποφακέλους:

1. Περίθαλψις του παιδός
2. Γ. Θραψιάδη , δικηγόρου, κόπιες επιστολών (1921-1923;)
   ΣΤ. Φάκελος με 2 υποφακέλους:
   1. Παραγγελίες τυπογραφείου Φρέρη
   2. Φωτοτυπίες : Διαθήκη Σταματίου Βαφιαδάκη( 1945, 1998;), Νέο Καταστατικό της Φ.Ε.Ε., Ορφανοτροφείο Θηλέων, Αδελφών Μπαμπαγιώτου (καταστατικό , διαθήκη, κανονισμός), αίτηση Ε. Πετρίδη προς το Ισιδώρειο (1984)
      Ζ. «Πίναξ συνοικεσίων Αρχιεπισκοπής Σύρου», 1868- 1881 (δεμένο φωτοαντίγραφο)
      Η. «Πίναξ συνοικεσίων Αρχιεπισκοπής Σύρου, Τήνου και Μυκόνου» 1890-1903
      Θ. «Πρωτόκολλο Αλληλογραφίας Μητροπόλεως Σύρου» Δεκ. 1988- Ιούλ. 1992

Προεπαναστατικά έγγραφα των ετών 1451-1820: λιθογραφημένο αντίγραφο του 19ου αι. από χρυσόβουλο του Κωνσταντίνου Παλαιολόγου (1451).
Νοταριακά έγγραφα από την περιοχή της Κεφαλληνίας (1653, 1671, 1689)· αντίγραφό της προκήρυξης της Μεγάλης Αικατερίνης προς τους Έλληνες με την οποία τους καλεί να εξεγερθούν (1769)· εκκλησιαστικά των ετών 1684-1803· οθωμανικοί τίτλοι ιδιοκτησίας για αγοραπωλησίες κτημάτων, ελαιοδένδρων κ.ά. στις περιοχές Αθηνών, Λιβαδειάς, Τήνου, Μυκόνου, Αίγινας και αλλού (1768-1820)· φορολογικό κατάστιχο της περιοχής Πύργου της Τήνου (1805).
Έγγραφα των ετών 1821-1827: αναφορές και επιστολές αγωνιστών, χρεωστικές ομολογίες, πωλητήρια κ.ά. Έγγραφα φιλελλήνων (1822-1828, 1853). Αναφορές, διαταγές, εγκύκλιοι του Ιωάννη Καποδίστρια (1828-1831).
Οθωνικά (1832-1861): επιστολές προς τον βασιλιά Όθωνα και απαντήσεις του ίδιου (1840-1853)· πιστοποιητικά συμμετοχής στον Αγώνα· χρεωστικές ομολογίες και αποδείξεις πληρωμών· βασιλικά διατάγματα Όθωνα και Αμαλίας.
Επιστολές του Γεωργίου Α’ και της βασίλισσας Όλγας (1878-1879). Διαθήκη της Aspasie von Schottenberg (1927).

Δικαιοπρακτικά και άλλα έγγραφα από τη Μύκονο.

1. Ένσταση του Μανωλάκη Σκιαθίτη εναντίον του Πασχάλη Λησάρδου ενώπιον της Καντζελλαρίας της Μυκόνου περί κατοχής οικοπέδου (21 Νοεμβρίου 1741).
2. Δήλωση του διδάσκαλου κυρ Αθανασίου προς την Καντζελλαρία Μυκόνου περί προφορικής διαθήκης του παπά Αθανάσιου Μοσκονά (9 Μαρτίου 1743).
3. Διοριστήριο τριμελούς κριτικής επιτροπής εκ μέρους του Οικονόμου Μυκόνου και του αδελφού του Πέτρου Σαντοριναίου προς επίλυση της μεταξύ των οικονομικής διαφοράς (29 Απριλίου 1749).
4. Δωρεά οικίας από τον Κόντε Giovanni Voinovich προς τη Μανταλένα Σαργάδαινα της Ειρήνης, βαπτισιμιά του. Δωρίζει επίσης, και τα έπιπλα του σπιτιού (3 Νοεμβρίου 1774).
5. Σύσταση εταιρείας διά την πώληση τσόχας στην Κωνσταντινούπολη εκ μέρους του Σπυρίδωνα Βανδούρου και του Ιάκωβου Μπαζαίγου (28 Φεβρουαρίου 1795, Νάξος).

Συλλογή νοταριακών εγγράφων και χειρογράφων από τη Μύκονο:

1. Λυτά έγγραφα των ετών 1635-1915.
2. Χειρόγραφα (Αρ. 135, 85, 83, 84, 137, 136, 124, 120,116, 107, 123, 122, 106, 86, 108, 139, 138, 140, 134, 132, 113, 133, 131, 67, 94, 87, 74, 72, 118, 55, 90, 45, 59, 119, 70, 129, 53, 130, 65, 125, 61, 80, 58, 64, 54, 82, 128, 60, 57, 46, 79, 36, 25, 51, 48, 47, 66, 62, 56, 71, 52, 43, 69, 50, 68, 49, 76, 115, 112, 23, 37, 88, 14, 16, 26, 13, 17, 81, 96, 21, 18, 121, 4, 39, 24, 15, 20, 91, 6, 5, 101, 38, 22, 2, 1, 30, 29, 34, 11, 78, 3, 100, 77, 89, 7, 35, 12, 75, 98, 63, 10, 9, 31, 8, 28, 33, 32, 19, 114, 97, 117, 93, 111, 110, 102, 104, 92, 103, 99, 105, 109, 95).
3. Έντυπα.

Συλλογή Θουκυδίδη Καπνουτζή αποτελούμενη από τριάντα (31) έγγραφα, κυρίως, της περιόδου της Επανάστασης του 1821:

1. Έγγραφο του Υπουργείου Δικαίου προς το Βουλευτικό σχετικά με ιδιωτική υπόθεση.
2. Είκοσι (20) έγγραφα και αντίγραφα του Υπουργείου Πολέμου σχετικά με διάφορους στρατιωτικούς της Επανάστασης.
3. Έγγραφο του Υπουργείου Οικονομίας προς το Βουλευτικό σχετικά με δαπάνη πολίτη.
4. Τρία (3) έγγραφα του Υπουργείου Θρησκείας για διάφορες στρατιωτικές υποθέσεις.
5. Έγγραφο σχετικό με την εκλογή του Επαρχιακού Δικαστηρίου Ναυπλίου.
6. Έγγραφο του Υπουργείου Εσωτερικών προς το Βουλευτικό σχετικά με τη Μαντώ Μαυρογένους.
7. Διακήρυξη του Δημάρχου Μυκόνου (1856).
8. Πίνακας τροπολογικός του προϋπολογισμού των κατά το 1846 εξόδων του επί των Εσωτερικών Υπουργείου.
9. Αναφορά ιδιώτη προς το Εκτελεστικό.

Η συλλογή περιέχει πρωτότυπα έγγραφα και χειρόγραφα που αφορούν, κυρίως, στην εκκλησιαστική, πολιτική και εσωτερική ιστορία των νησιών του Αιγαίου Πελάγους και άλλων ελληνικών χωρών τους χρόνους της Φραγκοκρατίας και της Τουρκοκρατίας, αντίγραφα και φωτογραφίες εγγράφων και χειρογράφων από αρχεία της Ευρώπης, της Ελλάδας και της Ανατολής, διάφορα χειρόγραφα και σημειώματα του ιστοριοδίφη καθώς και την αλληλογραφία του με διαπρεπείς Έλληνες και ξένους επιστήμονες.
Επίσης, περιλαμβάνει διάφορα φιρμάνια, μπουγιουρντί, ακτιναμέδες (ahitname) και άλλα έγγραφα, που αφορούν ποικίλες υποθέσεις των νησιών του Αιγαίου Πελάγους, όπως φορολογικές υποθέσεις, απόδοση ιλτιζάμ (iltizam) νήσων και εκμίσθωση δεκάτης, διενέξεις Φράγκων και Ρωμαίων, αποστολή ανδρών και υλικών για τις ανάγκες του αυτοκρατορικού στόλου, περί προστασίας ρωσικών εμπορικών πλοίων, περί μη καταπίεσης ραγιάδων, περί επίλυσης διαφορών ραγιάδων, κ.ά.

Ο κατάλογος της συλλογής διαιρείται σε εννιά (9) κεφάλαια:

1. Εκκλησιαστικά και μοναστηριακά (Πατριαρχεία Κωνσταντινουπόλεως, Ιεροσολύμων, Μητροπόλεις Αγαθοπόλεως, Αθηνών, Άρτης, Βάρνας, Ευρίπου, Εφέσου, Ηρακλείας, Ιωαννίνων, Καισαρείας, Μονεμβασίας, Σάμου, Τυρνόβου, Επισκοπές, Μονές, Μονύδρια, Ναοί)
2. Λατινική Εκκλησία των Νήσων,
3. Σχολικά (Κάσος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Φολέγανδρος),
4. Κοινοτικά (Κέα, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Πάτμος, Σύρος, Φολέγανδρος),
5. Διοικητικά και Φορολογικά (Λατίνοι δυνάστες, Τουρκοκρατία-Νήσοι Αιγαίου, Άνδρος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Σίκινος, Σύρος, Φολέγανδρος),
6. Ελληνικές Παροικίες του Εξωτερικού (Ανκόνα & Λιβόρνο),
7. Ιδιωτικά,
8. Διάφορα,
9. Χειρόγραφα
   και εντός των κεφαλαίων έγιναν μικρότερες υποδιαιρέσεις κατά γεωγραφικές ενότητες.

Αναλυτικότερα:
Κ36_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: χειρόγραφα 1-6
Κ37_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 1-43
Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 44-59,
Κ38_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 60-90
Κ39_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 91-110
Κ40_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 111-135
Κ41_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 136-155
Κ42_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 156-172
Κ43_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 173-185