Αλληλογραφία με προξενικά Λιμεναρχεία, εγκρίσεις χορηγήσεως πληρωμάτων, ναυτολόγηση αλλοδαπών, Διάφορα διμερών συμβάσεων, αποφάσεις αλλαγής ειδικότητας, αιτιολόγησης απολύσεων, αναγνώρισης προϋπηρεσίας, κοινοβουλευτικός έλεγχος, υπομνήματα-αναφορές σωματείων, οργανώσεων, ιδιωτών, εποπτεία ΓΕΝΕ, στατιστικά ανεργίας και επιδοτήσεων, απεργίες, επιθεωρήσεις πλοίων, ναυτεργατικές διαφορές αλλοδαπών, πρωτότυπα συλλογικών συμβάσεων.

Άδειες αλιείας, δηλώσεις απωλειών, παράνομες πράξεις αλιείας, ανακοινώσεις προαγωγών, χορηγήσεις Ψ.Π., αναζητήσεις σκαφών, μέτρα ασφαλείας, απογραφόμενοι ναυτικοί προσφερόμενοι για ναυτολόγηση, χορηγήσεις βεβαιώσεων Θ.Υ., αιτήσεις για έκδοση άδειων οδήγησης ταχύπλοου σκάφους κ.τ.ό.

Έγγραφα σχετικά με αλλοδαπούς και λαθρεπιβάτες αλλοδαπούς στη Θεσσαλονίκη. Παλιννόστηση ατόμων ποντιακής καταγωγής, αποναυτολογήσεις, άρνηση εισόδου αλλοδαπών, αλλοδαποί εισαχθέντες σε νοσοκομεία, είσοδοι κρουαζιερόπλοιων, ναυτολογήσεις και πλοία που κατέπλευσαν στο λιμάνι του Σταυρού Ν. Θεσσαλονίκης.

Το αρχείο εκτείνεται από το έτος 1863, καλύπτει κατά συνέπεια την Οθωμανική περίοδο, στο πλαίσιο της οποίας είχε παραχωρηθεί στην Κάλυμνο αυτονομία, με την υποχρέωση καταβολής ενός φόρου κατ’ αποκοπή που ονομάζονταν «μακτού». Τα προνόμια του νησιού επιβεβαιώθηκαν το 1835 με σουλτανικό φιρμάνι. Το έτος 1869 η Κάλυμνος αποδέχεται την παρουσία «Καϊμακάμη» (δικαστή).
Στο αρχείο περιλαμβάνεται η αλληλογραφία της δημογεροντίας με την Καϊμακαμία (Υποδιοίκηση), στην οποία καταγράφονται ζητήματα προνομίων, φόρων, ενοικιάσεων, μηνύσεων και καταγγελιών σε βάρος πολιτών για παραβατικές συμπεριφορές, αδικήματα, για μη ανταπόκριση σε οικονομικές υποχρεώσεις κ.ά. Περιλαμβάνονται ακόμα σπουδαίες πληροφορίες για την σπογγαλιεία του νησιού, καθώς ζητήματα εκπαίδευσης, διορισμών και μισθοδοσίας, δημόσιας υγείας και πρόνοιας (ιατροφαρμακευτική κάλυψη), δημοσίων έργων, διακηρύξεων, απαγορεύσεων κ.λπ.
Το αρχείο καλύπτει επίσης την περίοδο από το 1912 και εξής οπότε το νησί βρισκόταν υπό ιταλική διοίκηση, μέχρι την ένωση με το ελληνικό κράτος το 1948 έως το έτος 1968.
Συγκεκριμένα περιλαμβάνονται οι εξής ενότητες:

1. Πρακτικά Δημοτικού Συμβουλίου και γενικών συνελεύσεων (1863-1927 και 1946-1951)
2. Αλληλογραφία εξερχομένων εγγράφων δημογεροντίας – δημαρχίας των ετών 1864 – 1922
3. Πρωτόκολλα αλληλογραφίας των ετών 1919 – 1957
4. Βιβλία συμβολαιογραφικών πράξεων των ετών 1879 – 1947
5. Βιβλία συμβολαιογραφικών πράξεων ακινήτων (πωλητήρια-υποθήκεςς κ.α.) των ετών 1879 – 1948
6. Σπογγαλιευτικά – ναυτολογήσεις των ετών 1881 – 1926
7. Προνομιούχες εκκινήσεις-άδειες σπογγαλιείας-σπογγαλιευτικά πληρώματα κ.α. των ετών 1902 – 1947
8. Πωλητήρια-ενοικιάσεις-ιδιοκτησίες πλοίων των ετών 1902 – 1947
9. Οικονομικά διάφορα των ετών 1885 – 1965
10. Διάφορα των ετών 1902 – 1968
11. Σύμμεικτοι τόμοι των ετών 1881 – 1946

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: φάκελοι των πλοίων «ΠΑΝΑΓΙΤΣΑ», «ΕΛΑΦΟΝΗΣΟΣ», «ΜΥΡΤΙΩΤΙΣΣΑ», «ΠΑΝΑΓΙΑ ΚΟΙΜΗΣΗΣ», «ΕΛΑΦΙ», «ΑΡΧΑΓΓΕΛΟΣ» και «ΠΟΡΦΥΡΟΥΣΑ», ημερήσιες αναφορές πληρωμάτων
Β. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με Διεύθυνση Προγραμματισμού Οργάνωσης και Εκπαίδευσης, Διεύθυνση Λιμενικής Αστυνομίας (Δ.Λ.Α.), Διεύθυνση Ασφαλείας Ναυσιπλοΐας (Δ.Α.Ν.), Διεύθυνση Οργάνωσης και Ποιότητας Υπηρεσιών, Διεύθυνση Προσωπικού Λιμενικού Σώματος (Δ.Π.Λ.Σ.), Γραφείο Επικοινωνίας και Μέσων Μαζικής Ενημέρωσης (Γ.Ε.Μ.Μ.Ε.) και 5η Περιφερειακή Διοίκηση Λιμενικού Σώματος (5η ΠΕ.ΔΙ.Λ.Σ.), έγγραφα περί έκδοσης αδειών τραπεζοκαθισμάτων, καύσης πυροτεχνημάτων και μεταφοράς νεκρού
Γ. Στοιχεία Αλιείας: ατομικές άδειες επαγγελματικής αλιείας, έγγραφα περί ανανεώσεως αδειών αλιείας
Δ. Στοιχεία Προσωπικού: πίνακες βαρδιών προσωπικού, ανακοινώσεις και έγγραφα περί συνδικαλιστικών θεμάτων, προερχόμενα από την Πανελλήνια Ομοσπονδία Ενώσεων Προσωπικού Λιμενικού Σώματος και την Πανελλήνια Ομοσπονδία Αξιωματικών Λιμενικού Σώματος
Ε. Οικονομικά Στοιχεία: έγγραφα περί οδοιπορικών εξόδων και καταστάσεις μισθοδοσίας προσωπικού Λιμεναρχείου
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: έγγραφα περί εγγεγραμμένων ναυτικών και ναυτολόγησής τους, θεωρήσεις αποδεικτικών ναυτικής ικανότητας.

Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με το Υπουργείο Γεωργίας, τη Διεύθυνση Υγείας και Πρόνοιας Νομαρχίας Λακωνίας, τη Διεύθυνση Κτηνιατρικής Νομαρχίας Λακωνίας, τη Νομαρχία Χανίων, το Υπουργείο Εμπορικής Ναυτιλίας, το Υπουργείο Υγείας και Πρόνοιας, το Υπουργείο Κοινωνικών Υπηρεσιών και τη Διεύθυνση Θαλάσσιων Συγκοινωνιών, έγγραφα περί γνωμοδοτήσεων για χρήση αιγιαλού, εκδόσεως αδειών τοποθέτησης τραπεζοκαθισμάτων και ομπρελών στη χερσαία ζώνη του Λιμένος Γυθείου, μέτρησης θερμοκρασίας επιφάνειας θαλάσσης, μεταφοράς χαρουπιών
Β. Στοιχεία Πλοίων - Πληρωμάτων: έγγραφα περί δρομολογίων επιβατηγών, οχηματαγωγών, θαλαμηγών, κρουαζιερόπλοιων και πλοίου στη γραμμή Γυθείου – Κυθήρων – Αντικυθήρων – Κισάμου, μηχανογραφικές καταστάσεις εισιτηρίων, έγγραφα περί αναγγελιών – καθυστερήσεων - απαγορεύσεων απόπλου, καρτέλες καταπλεόντων πλοίων με ξένη σημαία, άδειες πετρέλευσης σκαφών, άδειες εξόδου πληρωμάτων καταπλεόντων πλοίων
Γ. Στοιχεία Ναυτικών: εγκύκλιοι απογραφής ναυτικών, έγγραφα Γραφείου Ευρέσεως Ναυτικής Εργασίας (ΓΕΝΕ), κατάλογοι και δικαιολογητικά προσφερομένων για ναυτολόγηση ανέργων ναυτικών, εγκύκλιοι προκηρύξεων για την εισαγωγή σπουδαστών στις Ακαδημίες Εμπορικού Ναυτικού (Α.Ε.Ν.)
Δ. Στοιχεία Παραβάσεων: έγγραφα περί διοικητικών παραβάσεων κανονισμού λιμένος
Ε. Στοιχεία Αλιείας: εκθέσεις αλιευτικής επιθεώρησης.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Δικαστικά Στοιχεία: ποινικές καταστάσεις
Β. Στοιχεία Πλοίων: έγγραφα ελέγχων στελέχωσης πλοίων, πίνακες προσεγγίσεων πλοίων υπό κοινοτική σημαία και σημαία Τρίτων Χωρών στο Λιμένα Γυθείου, άδειες απόπλου πλοίων
Γ. Στοιχεία ναυτικών: απογραφές ναυτικών, κατάλογοι ναυτικών προσφερόμενων για ναυτολόγηση, υποβολές ναυτικών φυλλαδίων για χορήγηση πιστοποιητικών θαλάσσιας υπηρεσίας, αιτήσεις ανανέωσης ναυτικού φυλλαδίου, αποδεικτικά ναυτικής ικανότητας, παραπεμπτικά προς φοίτηση στην Δημόσια Σχολή Σωστικών και Πυροσβεστικών Μέσων (Δ.Σ.Σ.Π.Μ.).

Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Στοιχεία Προσωπικού: προκηρύξεις πρόσληψης, πίνακες υπηρεσιών προσωπικού Λιμεναρχείου, έγγραφα περί υπαλληλικών και συνδικαλιστικών θεμάτων
Β. Στοιχεία Πλοίων: πίνακες κρουαζιερόπλοιων
Γ. Αφίσες: περί καθαριότητας των παραλιών, ληπτέων μέτρων υγιεινής για την προστασία από κορονοϊούς και τον ιό Ebola
Δ. Στοιχεία ναυτικών: καταστάσεις ναυτικών προσφερόμενων για ναυτολόγηση, δελτία απογραφής ναυτικών, αιτήσεις και δικαιολογητικά έκδοσης ναυτικών φυλλαδίων, έγγραφα περί ναυτικής ικανότητας
Ε. Στοιχεία αλιείας: αιτήσεις - υπεύθυνες δηλώσεις ανανεώσεων ερασιτεχνικών αδειών αλιείας, έγγραφα περί αλιείας ξιφία, ερυθρού τόνου και μεγάλων πελαγικών ψαριών
ΣΤ. Αλληλογραφία: έγγραφα περί προστασίας της θαλάσσιας χελώνας.

Αρχειακό υλικό του Κεντρικού Λιμεναρχείου Θεσσαλονίκης και των γραφείων που υπάγονται σε αυτό, του Π.Ο.Ν.Θ., των Λιμενικών Τμημάτων Ν. Μουδανιών και Κατερίνης: Βιβλία καυσίμων. Πρωτόκολλο παράδοσης-παραλαβής πλωτού σκάφους και περιπολικών, πιστοποιητικά επιθεώρησης πνευστής σωστικής σχεδίας, πρωτόκολλα παράδοσης-παραλαβής τηλεπ/κού υλικού 1974-1982. Φάκελοι αλληλογραφίας και αποστολής Επιδοτηρίων Λιμενικών Αρχών 1990-1991. Φάκελοι άδειας Οστρακαλιείας. Μέτρα τάξης κατά την απο-επιβίβαση επιβατών και οχημάτων στα Ε/Γ-Ο/Γ πλοία 1990-1992. Φάκελος εσωτερικής αλληλογραφίας Τμήματος Γραμματείας με ΛΑ/Δικαστικό 1990-1995. Φάκελος ΛΑ/Δικαστικού: διαβιβαστικά αποφάσεων και κλήσεων σε λιμενικές και αστυνομικές Αρχές 1992-1993. Διοικητικά θέματα, 1986-1992, ρύπανση θάλασσας 1980-1996, φάκελος Νηολογίων 1996. Πίνακες διαφόρων δαπανών Υγειονομικής Περίθαλψης 1994. Από το Α΄ Λ/Τ Ν.Μηχανιώνας: 1 φάκελος Γαλάζιες σημαίες της Ευρώπης 1997. Από Β΄ Λ/Τ Ν.Μουδανιών: 1 φάκελος Παράνομη αλιεία-άδειες αμμοληψίας- αλληλογραφία με Εφορεία Εναλίων Αρχαιοτήτων 1995-1997. 3 φάκελοι αδειών πετρέλευσης πλοίων 1996-1997. 11 φάκελοι αδειών σκαφών, γρι-γρι, κ.λπ. Από το Γ΄ Λ/Τ Κατερίνης: 1 Βιβλίο καταγγελιών για παράνομη αλιεία 1992-94. 8 φάκελοι ποικίλων θεμάτων. Από το Δ΄ Λ/Τ Ν. Μαρμαρά: 1 φάκελος κίνησης Θ/Γ σκαφών 1991-1994. Ατυχήματα πλοίων 1986. Από το Λ/Σ Πλαταμώνα: 1 φάκελος ποικίλων θεμάτων 1986-1994. Από Οίκο Ναύτου 1 φάκελος Υγειονομικών. Γραφείο Γενικής Αστυνομίας: α) Αιτήσεις-εγκρίσεις φορτοεκφόρτωσης επικίνδυνων φορτίων 1988. β) Βιβλίο καταγγελιών παράνομης αλιείας 1985-1989. γ) Άδειες ανέλκυσης-καθέλκυσης 1995-1999. δ) Άδειες πετρέλευσης 1996, 1999. Γραφείο Μικρών Σκαφών: Αιτήσεις έκδοσης-ανανέωσης ατομικών αδειών αλιείας (ερασιτεχνικές/επαγγελματικές) 2000. Τμήμα Ναυτολογίας: Ναυτικοί που έτυχαν προστασίας λόγω ασθενείας ή ατυχήματος. Σημειώματα ΓΕΝΕ των προς ναυτολόγηση ναυτικών έως και 1999. Τμήμα ΛΑ/ΓΓΑ: σχετικά με άδειες καταδυτικών εργασιών, εκδηλώσεις στους χώρους λιμανιού, λειτουργία πλωτών αναψυκτηρίων, άδειες ναυτικών πρακτόρων κ.λπ. Έγραφα του ΠΟΝ Θεσσαλονίκης. Εγκρίσεις φορτοεκφόρτωσης επικίνδυνων ειδών 2000-2001. Φάκελος φορτοεκφόρτωσης φορτίου χύμα πετρελαίου-αερίων σε δεξαμενόπλοια 2001. Φάκελοι του Γραφείου Ασφάλειας με Βεβαιώσεις Ναυτολόγησης-Απόλυσης αλλοδαπών ναυτικών 2001-2003. Φάκελος του Γραφείου Επιστασίας. Φάκελοι του Γρ. Ναυτολογίας (κύρωση συλλογικής σύμβασης εργασίας για πλόες στον Περσο-αραβικό Κόλπο, 1990. Φάκελος Υγειονομικού Ελέγχου αλιευμάτων 2001. Αγγελίες – Κ/Π – Α/Π πλοίων σημαίας εξωτερικού και εσωτερικού 2015. Βεβαιώσεις ναυτολόγησης και απόλυσης αλλοδαπών ναυτικών 2015. Αγγελίες – Κ/Π – Α/Π Κ/Ζ 2012. Καταχωρήσεις σημάτων SCHENGEN-SIRENE 2012. Έντυπα πληροφοριακών στοιχείων για είδος φορτοεκφορτωθέντων πετρελαιοειδών φορτίων έτους 2013.Υπηρεσιακά σημειώματα ελεγχθέντων πλοίων ετών 2013-2014. Φύλλα εκθέσεων επιθεωρήσεων MARPOL ετών 2013-2014. Έγγραφα του ΚΛΘ/Β’ Λ/Τ Ν. Μουδανιών και του Κ.Λ.Θ./Δ’ Λ/Τα Πλαταμώνα.

Το αρχείο περιέχει υλικό σχετικό με τις αρμοδιότητες του ναυτιλιακού ακολούθου στο Χονγκ Κονγκ. Δηλώσεις κατάπλου-απόπλου, θέματα ελλήνων ναυτικών (ασφαλιστικά, πειθαρχικά), εκθέσεις δραστηριότητας του ναυτιλιακού ακολούθου, ετήσιοι απογραφικοί έλεγχοι, διενέργεια ελέγχων και επιθεωρήσεων.

Δελτία κατάπλου-απόπλου πλοίων στους λιμένες αρμοδιότητας της ΕΝΑ Οδησσού, πίνακες άρσης-απαγόρευσης ναυτολόγησης, πίνακες πειθαρχικών ποινών ναυτικών, διαταγές παύσης διενέργειας προανάκρισης ναυτικών, ναυτιλιακές πληροφορίες (εμπορευματική κίνηση-ναύλοι-κατηγορίες πλοίων κ.λ.π.) δελτία μηνιαίας δραστηριότητας ΚΕΕΠ.