Το προσωπικό αρχείο περιλαμβάνει ένα βιβλίο με την καταγραφή της προσωπικής αλληλογραφίας του Δ. Μπακογιάννη: εισερχόμενη και εξερχόμενη αλληλογραφία με Νομαρχία, Υπουργείο Εθνικής Αμύνης, Υπουργείο Δικαιοσύνης, κ.α., χειρόγραφες σημειώσεις προγράμματος και αντιγραφή της προσωπικής και επαγγελματικής του αλληλογραφίας κατά την άσκηση της επαγγελματικής του ιδιότητας ως εφέδρου ταγματάρχη.

Το αρχείο αποτελείται από στρατιωτικά εγχειρίδια, έγγραφα υπηρεσίας και προσωπικές σημειώσεις του ταξιάρχου Ηλία Μπομπορίδη, σημειωματάρια, ημερολόγια και αλληλογραφία κατά την υπηρέτησή του στον Ελληνικό Στρατό, αποκόμματα εφημερίδων, διαφημιστικά, καρτ ποστάλ και βιβλία εσόδων-εξόδων.
Επίσης περιλαμβάνεται υλικό από το προσωπικό αρχείο του Στυλιανού Μπομπορίδη, των τέκνων του, Φιλίππου και Χρήστου Μπομπορίδη (αρχιτεκτονικά σχέδια και ξενόγλωσσο υλικό από σημειώσεις και εκθέσεις), καθώς και ένα μικρό μέρος από το αρχείο του Χρήστου Κέλλα.
Τέλος περιέχει μεγάλο αριθμό χαρτών: τοπογραφικούς, παγκόσμιους και ελληνικούς, προερχόμενους από τη Γεωγραφική Υπηρεσία Στρατού.