Α. Ιόνια Διοίκηση Ι. Έγγραφα του Γενικού Εισπρακτορείου των Ιερών και Εκκλησιαστικών Εισοδημάτων. α. Εκκλησίες και Φέουδα, (1. Θεσπίσματα, δουκικές διαταγές, διαθήκες, συμβόλαια και διαχειριστικά έγγραφα διαφόρων εκκλησιών λατινικών και ορθοδόξων, 2. Διαχειριστικά έγγραφα από εκμετάλλευση γαιών. II. Έγγραφα του Γενικού Θησαυροφυλακείου και του Εγχωρίου Εισπρακτορείου: α. Αλληλογραφία, πρακτικά συνεδριάσεων (Φ. 289 – 329), β. Ημερολόγια εισπράξεων – πληρωμών, γ. Κλήσεις, δ. Διαταγές σύλληψης, ε. Γνωστοποιήσεις, στ. Βιβλία ταμείου, ζ. Εισπράξεις από την εκμετάλλευση εδαφονομίων εκκλησιών και δημοσίων φέουδων, η. Έγγραφα διαχειριστικά εκκλησιών Κεφαλληνίας, θ. Έγγραφα διαχειριστικά εκκλησιών Ζακύνθου, Λευκάδας και Κυθήρων, ι. Βιβλία αποδείξεων του Εγχωρίου Εισπρακτορείου, ια. Εντάλματα εκτίμησης, ιβ. Κατάστιχα καταχώρισης εκτιμήσεων, ιγ. Έγγραφα δημεύσεων, ιδ. Δικαστικές αποφάσεις σχετικές με ενοικιάσεις, ιε. Αλληλογραφία, αναφορές και προσφορές, ιστ. Γνωστοποιήσεις και ειδοποιήσεις για ενοικιάσεις – εγγυήσεις, ιζ. Συμβόλαια εκμισθώσεων, ιη. Συμβόλαια απελευθέρωσης γαιών, ιθ. Συμβόλαια μεταλλαγών, κ. Ικετήρια, κα. Παραχωρήσεις κτημάτων, κβ. Απαλλοτριώσεις, κγ. Εκτιμήσεις ελαιοκάρπου, κδ. Καταχωρήσεις ελαιολάδου, κε. Εγγραφές κτημάτων, κστ. Καταγραφές πυρομαχικών και τροφοδοσίας πλοίων, κζ. Εγκύκλιοι προς υπαλλήλους, κη. Καταχωρίσεις αποθηκευμένου ελαιολάδου, κθ. Κατάστιχα των δημοσίων εισπρακτόρων (Φ. 1100 – 1122, 2534) III. Γραφείο Δημοσίου Μηχανικού (Αναφορές, εκτιμήσεις, συμβόλαια και σχέδια σπιτιών και αλληλογραφία). IV. Εγχώριο (Επιχώριο) Συμβούλιο) (Συμβολαιογραφικές πράξεις, καταθέσεις, αλληλογραφία, δηλοποιήσεις, ευρετήρια πράξεων Κοινοβουλίων, πίνακες προϋπολογισμού εσόδων και εξόδων, απόγραφα αποφάσεων Επιχωρίου Συμβουλίου). V. Επιτροπή της Γεωργίας (Καταχωρίσεις διανομής σιτηρών και εισπράξεων). VI. Τελωνείο, Λιμάνι (Αναχωρήσεις, αναφορές, κατάστιχο εισιτηρίων). VII. Επιτροπή των σιτηρών (Καταχωρίσεις διανομής σιτηρών και εισπράξεων). VIII. Αρχείο εσόδων (Αλληλογραφία). ΙΧ. Κοινοβούλιο, Σύγκλητος (Πράξεις και αποφάσεις του Κοινοβουλίου και της Συγκλήτου, αλληλογραφία). Χ. Επιτροπή των Προσφύγων εξ Ηπείρου (Έγγραφα οικονομικής διαχείρισης). ΧΙ. Επιτροπή Θεάτρου (Αποδείξεις πληρωμών από τη θεατρική επιτροπή).
Β. Δικογραφίες, 443 Φάκελοι, 17ος-19ος αι.
Γ. Ελληνική Διοίκηση, 887 Φάκελοι και κτχ., (1864-1926)Ι. Διαχειριστικές Επιτροπές (Πρακτικά συνεδριάσεων, βιβλίων εσόδων-εξόδων, πρωτόκολλα, βιβλία πράξεων). ΙΙ. Έντυπα διαφόρων προελεύσεων (Νομοσχέδια, Εφημερίδες της Κυβερνήσεως, πράξεις του Κοινοβουλίου και της Γερουσίας). ΙΙΙ. Γραφείο Νομάρχη (Αναφορές, Έγγραφα που αφορούν το Δήμο Κερκυραίων, Αλληλογραφία Νομαρχίας και Εισπρακτορείου). IV. Αρχειοφύλακας και Ταμίας (Εισπράκτορας) (Έγγραφα οικονομικής διαχείρισης, αλληλογραφία, πρακτικά συνεδριάσεων, αναφορές, αιτήσεις, γνωμοδοτήσεις, πρωτόκολλα). V. Διαχειριστικά και λογιστικά θέματα (Υπουργικές αποφάσεις, ημερολόγια εσόδων και εξόδων, απολογισμοί Εγχωρίου Διαχειρίσεως, πρακτικά και προϋπολογισμοί). VI. Ειδική Επιτροπή κατά τον Ν. ΒΣΙΓ΄ (Έγγραφα σχετικά με τιμάρια).

Το αρχείο περιλαμβάνει στοιχεία που αφορούν στην αποπληρωμή του εξωτερικού χρέους, λόγω δανείων από τη Βαυαρική Αυλή στους κληρονόμους του Όθωνα, στα δάνεια που συνήψε το Ελληνικό κράτος στο εξωτερικό από το 1881-1918, στα δάνεια της αναγκαστικής κυκλοφορίας, στην επιβολή του ΔΟΕ (Διεθνούς Οικονομικού ελέγχου) και στην επιτήρηση του ΔΟΕ στα προϊόντα του μονοπωλίου (αλάτι, παιγνιόχαρτα, σιγαρόχαρτα κ.α).

Επιπλέον, περιλαμβάνονται πρωτόκολλα εξόφλησης των τοκομεριδίων των διαφόρων δανείων, οι πίνακες ομολογιών, η αλληλογραφία των ταμιών με το Γενικό Λογιστήριο και της Υπηρεσίας Δημοσίου Χρέους με τη Διεθνή Επιτροπή, καθώς και η πληρωμή του αναδόχου για την κατασκευή της σιδηροδρομικής γραμμής Πειραιώς-Λαρίσης, στατιστικοί πίνακες του Εμπορικού Συλλόγου Βόλου και της Θεσσαλίας μετά την ενσωμάτωση (δημητριακοί καρποί, αροτριώντα κτήνη, πίνακες σποράς πρώιμων και όψιμων προϊόντων), καθώς και στοιχεία δανείων που χορηγούνται μετά τον Α΄ Παγκόσμιο πόλεμο (1919) σε πρόσφυγες (Ρώσους, Πόντιους, πρόσφυγες της Θράκης και της Μ. Ασίας). Όσον αφορά στο εσωτερικό χρέος, στο αρχείο περιλαμβάνονται στοιχεία των αποζημιώσεων του Ελληνικού κράτους στα τρία ναυτικά νησιά Ύδρα, Σπέτσες και Ψαρά.

Οι φάκελοι σε μεγάλο μέρος ήταν συγκροτημένοι από το Ειδικό Λογιστήριο. Σε κάθε φάκελο αναγράφεται ο αριθμός ελέγχου που αντιστοιχεί στον αύξοντα αριθμό του πλοίου, όπως καταχωρίζεται στο ΦΕΚ του 1856, και το όνομα του χορηγιούχου.

Μία ειδική κατηγορία αποτελούν οι φάκελοι στους οποίους καταγράφονται αναλυτικά από τους ιδιοκτήτες ή τους διοικητές των πλοίων, οι προμήθειες και οι επισκευές των πλοίων κατά τη διάρκεια των πολεμικών επιχειρήσεων 1821-1829. Οι φάκελοι αυτοί ταξινομήθηκαν αλφαβητικά.

Τέλος, στη σειρά του Εσωτερικού χρέους έχουν συμπεριληφθεί οι εκκαθαρίσεις των συντάξεων της Επτανήσου και η πληρωμή των εδαφονομίων της Επτανήσου, τιμαριωτικά δηλαδή δικαιώματα τα οποία με την ένταξη της Επτανήσου στην Ελλάδα οφείλει το Ελληνικό κράτος ως αποζημίωση στους ιδιοκτήτες που διέθεταν ακίνητα στα φρούρια Κερκύρας, Ζακύνθου, Κεφαλονιάς και Κυθήρων.

α) 1907, Δεκεμβρίου 19: Επιστολή του Δημητρίου Σούτσου (Αθήνα) προς τον Δημήτριο Kαμπούρογλου.
Του στέλνει ως αναμνηστικό δώρο το «ψήφισμα της Βουλής της Επτανήσου», που είχε στην κατοχή του.
β) 1863, Σεπτεμβρίου 23: Ψήφισμα της Βουλής της Επτανήσου για την ένωση των νησιών με την Ελλάδα. Ακολουθούν οι υπογραφές 37 βουλευτών. Στο οπισθόφυλλο: Donné à mon ami Georges Typaldo (fils) F. Lenormant. Athènes 11/63 Septembre 1863.

Φωτογραφίες, επιστολικά δελτάρια και λευκώματα. Τα λευκώματα, πολυτελέστατα, περίτεχνα, συνήθως δερματόδετα, περιέχουν κυρίως πορτραίτα προσωπικοτήτων που ανήκουν σε επώνυμες οικογένειες όπως των Κριεζή, Φωτιάδη, Βικέλα, Οικονόμου, κ.ά. Μερικά περιλαμβάνουν απεικονίσεις διαφόρων ελληνικών περιοχών και πόλεων όπως της Αθήνας, της Κρήτης, της Κέρκυρας, της Θεσσαλίας, της Τραπεζούντας και είναι δημιουργήματα σπουδαίων φωτογράφων, των αδελφών Ρωμαΐδη, J. Berrinda, B. Borri, Δ. Μιχαηλίδη, Κ. Κακουλή και άλλων.
Το φωτογραφικό υλικό, ταξινομημένο σε παράλληλες με τα ιστορικά γεγονότα ενότητες ή σε θεματικές κατηγορίες, καλύπτει το τμήμα της σύγχρονης ελληνικής ιστορίας από τις αρχές του δεύτερου μισού του 19ου αι. έως τις πρόσφατες δεκαετίες. Οι φωτογραφίες, έργα των πρωτοπόρων της ελληνικής φωτογραφικής τέχνης οι παλαιότερες (Φ. Μαργαρίτη, Δ. Κωνσταντίνου, Π. Μωραΐτη, Ι. Λαμπάκη, Κ. Δημητρίου, Γ. Κολόμβου, Γ. Δαμιανού, Σπ. Βενιού, Αυγ. Κόλλα, Αδελφών Ρωμαΐδη, Π. Διαμαντόπουλου, κ.ά) και καταξιωμένων επαγγελματιών οι μεταγενέστερες (Ν. Ζωγράφου, Γ. Μπούκα, Π. Πουλίδη, Μ. Μεγαλοκονόμου, Σπ. Μελετζή, Nelly’s κ.ά.) αλλά και παραγωγές χωρίς ταυτότητα, παρέχουν στοιχεία για την εξελικτική πορεία της νεοελληνικής φωτογραφίας από την πρώτη εμφάνισή της στην Ελλάδα.
Αξιοσημείωτος είναι ο αριθμός των φωτογραφιών καταξιωμένων ξένων φωτογράφων (Beck, E. Lester, Boeringer, Bergamasco κ.ά.), που εμπλουτίζει τη συλλογή του Φωτογραφικού Αρχείου.
Η προσπέλαση στην πολιτική, στρατιωτική, κοινωνική και πολιτιστική ζωή του 19ου αι. γίνεται μέσα από ομάδα φωτογραφιών προσωπικοτήτων, από στιγμιότυπα των αλυτρωτικών εξεγέρσεων, της επτανησιακής ενσωμάτωσης, απεικονίσεις του πολέμου του 1897, από φωτογραφίες συλλόγων, πνευματικών ιδρυμάτων κ.ά.
Το ιστορικό πλαίσιο του 20ού αι. διαγράφεται με μεγάλες φωτογραφικές ομάδες που αναφέρονται στην Κρητική Πολιτεία, στο Μακεδονικό Αγώνα, στους Βαλκανικούς πολέμους, στον Α΄ Παγκόσμιο Πόλεμο, στην εκστρατεία της Μικράς Ασίας, στον πόλεμο του 1940, την Κατοχή, τον Εμφύλιο, την ένωση της Δωδεκανήσου, την τουρκική εισβολή στην Κύπρο. Πλούσια αντικατοπτρίζεται και η ελληνική πολιτική δραστηριότητα. Αναφέρονται ορισμένα χαρακτηριστικά σύνολα και μεμονωμένες φωτογραφίες:

• Το δαγγεροτυπικό πορτραίτο του Όθωνα αποδιδόμενο στον Φ. Μαργαρίτη, 1848-1850.
• Η σειρά φωτογραφιών των Ολυμπιακών Αγώνων του 1896 (σύγχρονη δωρεά του Δ. Βικέλα) καθώς και της Μεσολυμπιάδας του 1906.
• Πλούσιο σύνολο φωτογραφιών που μεταφέρουν την εικόνα της αλλοτινής Αθήνας.
• Ικανός αριθμός απεικονίσεων διαφόρων άλλων πόλεων ή τοποθεσιών. Ενδεικτικά αναφέρεται η συλλογή φωτογραφιών της Κύπρου (πόλεις, αρχαιότητες, ηθογραφικές και λαογραφικές εικόνες) προσφορά προς την ΙΕΕΕ του Πατριωτικού Συνδέσμου των Κυπρίων, ύστερα από την Παγκύπρια Έκθεση στην Αθήνα το 1901.
• Ενότητα φωτογραφιών που απεικονίζουν βυζαντινά και μεταβυζαντινά μνημεία. Πραγματικά καλλιτεχνήματα Γερμανών φωτογράφων, είχαν εκτεθεί στο ελληνικό τμήμα της Διεθνούς Έκθεσης της Ρώμης το 1911.
• Σώμα φωτογραφιών από τη Μικρασιατική Εκστρατεία (περισσότερες από 6.000), μέρος του οποίου είναι προϊόν οργανωμένων φωτογραφικών συνεργείων οπλιτών της ελληνικής στρατιάς. Οι τελευταίες, τραβηγμένες και τυπωμένες (πολλές μεγάλων διαστάσεων) από το Δεκέμβριο του 1920 έως τον Ιανουάριο του 1922, αποδίδουν όχι μόνο τις φάσεις των στρατιωτικών επιχειρήσεων στο Μικρασιατικό Μέτωπο αλλά και την ανθρώπινη διάσταση της καθημερινής ζωής του Έλληνα στρατιώτη. Τεκμηριώνουν ακόμη την έντονη ελληνική παρουσία στη Μικρά Ασία (ελληνικοί οικισμοί, ελληνικές αρχαιότητες, βυζαντινά μνημεία κ.ά.).
• Έντυπα φωτογραφικά λευκώματα, παλαιότερα ή νεότερα, όπως το σύνολο σχεδόν της έντυπης δημιουργίας του Fr. Boissonnas, που με ρομαντισμό καταγράφει την Ελλάδα της πρώτης εικοσαετίας του 20ού αι.