Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: διαταγές, καταστάσεις διακίνησης αλληλογραφίας, αποφάσεις καθαρισμού αιγιαλών, έγγραφα περί διακομιδών ασθενών, βλαβών αναμεταδοτών και αξιοποίησης υλικών και μέσων Λιμενικών Αρχών
Β. Στοιχεία Προσωπικού: έγγραφα περί ανάπαυσης, μετάθεσης, εκπαίδευσης προσωπικού, πίνακες οργανικής σύνθεσης και βαρδιών
Γ. Οικονομικά στοιχεία: δικαιολογητικά περί ύδρευσης, προμηθειών και επιδομάτων προσωπικού Λιμενικού Σταθμού
Δ. Στοιχεία Νομοθεσίας - Παραβάσεων - Προστίμων: έγγραφα περί αστυνόμευσης και τάξης οχημάτων και ατόμων, περί καταπολέμησης φοροδιαφυγής, καταπολέμησης και διαχείρισης κρουσμάτων Covid, κατασχέσεων πλωτών και χερσαίων μέσων και περί μεταφοράς επικίνδυνων εμπορευμάτων, διαταγές Εισαγγελίας Πρωτοδικών Σπάρτης
Ε. Στοιχεία Αλιείας: δελτία αλιευτικής δραστηριότητας, διαταγές περί αλιείας ερυθρού τόνου, έγγραφα περί αλιείας στα ελληνικά χωρικά ύδατα από αλιευτικά σκάφη ξένης εθνικότητας και περί αλιευτικών ελέγχων
ΣΤ. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: έγγραφα περί θαλαμηγών, επαγγελματικών πλοίων αναψυχής, επιβατικής κίνησης και πρόσδεσης σκαφών στους λιμένες, συμβάσεις εργασίας πληρωμάτων.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία Νομοθεσίας - Παραβάσεων - Προστίμων: έγγραφα περί περιστατικών εξαφάνισης, περί καταπολέμησης φοροδιαφυγής, και εφαρμογής κεκτημένου Schengen, νομοθεσία περί καπνίσματος, πολυθεσίας και εισόδου μεταναστών
Β. Αλληλογραφία: περί υλοποίησης ψηφιακών υπογραφών
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: καταστάσεις εργασίας προσωπικού κατά τις νυχτερινές ώρες
Γ. Οικονομικά στοιχεία: υποβολές καυσίμων και λιπαντικών
Δ. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: δελτία ελέγχων φορτηγών πλοίων προερχομένων από Τουρκία – Αίγυπτο – Συρία, πίνακες προσεγγίσεως κρουαζιερόπλοιων, έγγραφα περί στελέχωσης και κατάπλου πλοίων, ναυλώσεως σκαφών και σύνθεσης προσωπικού δρομολογημένων πλοίων, έγγραφα Τοπικού Κλιμακίου Επιθεώρησης Εμπορικών Πλοίων (Τ.Κ.Ε.Π.)
Ε. Στοιχεία Αλιείας: δελτία αλιευτικής δραστηριότητας, υποβολές αλιευτικών επιθεωρήσεων, έγγραφα περί έκδοσης και ανανέωσης αδειών αλιείας, περί διαμαρτυρίας για την αλιεία ξιφία από αλιευτικά σκάφη με ξένη σημαία, έγγραφα περί εθνικού προγράμματος αλιείας ξιφία και τόνου και περί του αλιευτικού εργαλείου γρίπου – βενζινότρατας.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: βιβλία διεκπεραίωσης αλληλογραφίας, πρωτόκολλα εισερχομένων εγγράφων, αλληλογραφία περί παραεμπορίου, ναυαγοσωστών και λουτρικών εγκαταστάσεων
Β. Στοιχεία Προσωπικού: πρωτόκολλο αιτήσεων υποψηφίων υπαξιωματικών και λιμενοφυλάκων, βιβλία αδειών προσωπικού και νυχτερινής απασχόλησης
Γ. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: βιβλία διαίρεσης φυλάκων πληρώματος, ημερήσιες αναφορές πληρωμάτων, έγγραφα περί επαγγελματικών πλοίων αναψυχής και περί πλοίου «Οddin Finder», πίνακες ελέγχων επιθεωρήσεων πλοίων
Δ. Στοιχεία Παραβάσεων και Προστίμων: ανακλήσεις αποφάσεων, πρόστιμα
Ε. Οικονομικά Στοιχεία: έγγραφα δαπανών απορρύπανσης Κάβου Μαλέα (εμπεριέχονται φωτογραφίες), υποβολές μισθώματος κτηρίου Λιμενικού Σταθμού Μονεμβασίας.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: πίνακες κρουαζιερόπλοιων και καταστάσεις κίνησης θαλαμηγών, ημερολόγια κίνησης πλωτών, πιστοποιητικά επιβατηγών και οχηματαγωγών πλοίων, πιστοποιητικά γραμμής φόρτωσης πλοίων και ασφαλούς διαχείρισης, έγγραφα και βιβλία περί απόπλου και δρομολογίων πλοίων, άδειες σκοπιμότητας πλοίου στη γραμμή Πούντας – Ελαφονήσου – Νεάπολης Βοιών, άδειες πετρελαίου, άδειες λειτουργίας τηλεπικοινωνιακού σταθμού πλοίων, άδειες VHF, έγγραφα περί επιθεωρήσεων πλοίων, ναύλων, εθνικότητας πλοίων, άγονης γραμμής Κυθήρων – Αντικυθήρων, τακτικής δρομολόγησης στην γραμμή Ελαφόνησος – Πούντα, μεταφοράς επικίνδυνων φορτίων, φάκελοι πλοίων: «Ελαφόνησος», «ΒΕΡΟΝΙΚΗ», «Χρυσή Άμμος», «Μαράκι», «ΑΘΗΝΑ», «Ανδρέας ΙΙ», «ΕΤΖΙΑΝ ΓΚΛΟΡΥ», «ΡΟΜΙΛΝΤΑ», «ΔΕΛΦΙΝΙ Ι», «ΔΕΛΦΙΝΙ ΙΙ», «ΔΕΛΦΙΝΙ V», «ΔΕΛΦΙΝΙ XIV», «ΣΠΥΡΙΔΟΥΛΑ», «ΕΛΑΦΙ», «ΔΩΡΑ», «ΜΥΡΤΙΔΙΩΤΙΣΣΑ», βιβλία ημερήσιας αναφοράς και παρουσίασης πληρώματος, έγγραφα περί σύνθεσης πληρωμάτων και καθορισμού συνδέσεως πληρωμάτων επιβατηγών – οχηματαγωγών, φωτογραφίες του επιβατηγού – οχηματαγωγού «ΜΑΡΘΑ»
Β. Οικονομικά στοιχεία: έγγραφα περί μισθώσεων και εκμισθώσεων θαλάσσιων μέσων αναψυχής, δικαιολογητικά οδοιπορικών εξόδων και καυσίμων, καταστάσεις μισθοδοσίας προσωπικού Λιμεναρχείου, έγγραφα περί επιδομάτων και αμοιβών πληρωμάτων, καταστάσεις ενοικίου οικήματος Λιμεναρχείου.
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: έγγραφα διαγωνισμών δοκίμων υπαξιωματικών και λιμενοφυλάκων, μηνιαία προγράμματα βαρδιών προσωπικού, έγγραφα περί νυχτερινής απασχόλησης, ατομικοί φάκελοι των υπηρετούντων στο Λιμεναρχείο Νεάπολης Βοιών και στους Λιμενικούς Σταθμούς Αγίας Πελαγίας, Καψαλίου, Ελαφονήσου και Μονεμβασίας
Δ. Λιμενική Αστυνομία: δελτία συμβάντων, πίνακες παραβάσεων και ατυχημάτων. Έγγραφα περί προστίμων, ατυχημάτων εργασίας στη θάλασσα, παραβάσεων κανονισμού λιμένος, ύποπτων σκαφών και καταζητούμενων λέμβων
Ε. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με Διευθύνσεις και Τμήματα Υπαξιωματικών και Λιμενοφυλάκων, Διοικητικής Μέριμνας, Προγραμματισμού, Οργάνωσης και Εκπαίδευσης – Μετεκπαίδευσης, Απλούστευσης Διαδικασιών και Ποιότητας Υπηρεσιών, Υγειονομικού, Έρευνας και Διάσωσης, Νομοπαρασκευαστικής Εργασίας, έγγραφα περί αντιμετώπισης κλοπών, διεξαγωγής παιγνίων, συναλλάγματος, βουλευτικών και δημοτικών εκλογών, λειτουργίας θαλάσσιων λουτρών και ύπαρξης λουόμενων και ναυαγοσωστών
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: κατάλογοι και δικαιολογητικά ανέργων ναυτικών.
Ζ. Στοιχεία Αλιείας: αιτήσεις και άδειες κινήσεως αλιευτικών σκαφών, έγγραφα περί αλιευτικών επιθεωρήσεων και προστίμων, έγγραφα περί σπογγαλιείας
Η. Στοιχεία Λιμενικού Σώματος: στατιστικά στοιχεία δραστηριοτήτων Λιμενικού Σώματος.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Αλληλογραφία: πρωτόκολλα κοινών εισερχομένων εγγράφων και εισερχομένων σημάτων, βιβλία ταχυδρομικής υπηρεσίας Υπουργείου Εμπορικής Ναυτιλίας, υποβολές εντύπων επιθεώρησης υλικών και μέσων απορρύπανσης, έγγραφα περί μεταφοράς νεκρών, εξαφάνισης ανηλίκων, ναυτικών ατυχημάτων και ελέγχων αλκοτέστ
Β. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: έγγραφα περί των δρομολογίων των πλοίων «Ελαφόνησος», «Πορφυρούσα», «Αγιαννάκης» και «Κάτω Νησί», πίνακες εκδοθέντων εισιτηρίων επιβατών ανά λιμένα, έγγραφα περί διακίνησης επιβατών την Καθαρά Δευτέρα, πίνακες καταχώρισης λέμβων, στατιστικά στοιχεία ναυτιλιακής κίνησης, βιβλία διαίρεσης φυλάκων πληρώματος
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: βιβλία αδειών προσωπικού, έγγραφα περί του υπηρετούντος προσωπικού στους Λιμενικούς Σταθμούς Μονεμβασίας και Καψαλίου
Δ. Στοιχεία Ελέγχων - Απολογισμοί: έγγραφα περί ετησίου ελέγχου συμμόρφωσης υπόχρεων λιμενικών εγκαταστάσεων, απολογισμού προστασίας της θάλασσας, ελέγχου φορτηγών οχημάτων, εξαμηνιαία δελτία δραστηριότητας λιμενικής αρχής
Ε. Στοιχεία Παραβάσεων: πίνακες προστίμων, έγγραφα περί εφαρμογής νόμων και κοινών υπουργικών αποφάσεων.

Φάκελοι: Διενέργεια μηνιαίων συσκέψεων για προώθηση στην ιεραρχία θεμάτων τοπικού ενδιαφέροντος των Λιμενικών Αρχών, Υποβολή δικαιολογητικών για θεώρηση βιβλιαρίων υγειονομικής περίθαλψης, Ημερολόγια αλιείας για εκφορτώσεις μεγάλων πελαγικών ψαριών, Δελτία αλιευτικής δραστηριότητας, Έντυπο σήμα, Συμφωνητικά εκμίσθωσης αιγιαλού παραλίας, Αλιευτικές επιθεωρήσεις.

Πειθαρχικές-ποινικές υποθέσεις προσωπικού, μεταθέσεις, τοποθετήσεις, αποσπάσεις, θαλάσσιες έρευνες-υποβρύχια δραστηριότητα, έλεγχος αλιείας, αλιευτική εργασία-εκμετάλλευση αλιευτικών σκαφών, μέτρα προστασίας αιγιαλού, ευρετήρια πλοίων, πλοιαρίων και πλωτών ναυπηγημάτων που εγγράφονται στα ελληνικά νηολόγια, μελέτες και εισηγήσεις επί θεμάτων ναυλολογίου κ.λπ.

Πειθαρχικές και ποινικές υποθέσεις, μετεκπαίδευση και επιμόρφωση προσωπικού, μητρώα απογραφής ναυτικών, φορτοεκφόρτωση πλοίων, μεταφορά επιβατών – τροχαία κίνηση, στατιστικά στοιχεία για το απασχολούμενο και άνεργο ναυτεργατικό δυναμικό, οδηγίες για την ασφάλεια της ναυσιπλοΐας, στελέχωση ελληνικών πλοίων - σύνθεση πληρωμάτων, εκτέλεση τουριστικών πλόων κ.ά

Πειθαρχικές και ποινικές υποθέσεις προσωπικού, προγράμματα μετεκπαίδευσης και επιμόρφωσης προσωπικού Λιμενικού Σώματος, κατάταξη επιτυχόντων στις σχολές του Λιμενικού Σώματος, μεταβολές λιμενικών αρχών, φορτοεκφόρτωση πλοίων, μεταφορά επιβατών – τροχαία κίνηση, ναυταθλητικούς αγώνες, έλεγχο αλιείας κ.λπ.

Μετεκπαίδευση και επιμόρφωση προσωπικού, κατάρτιση-τροποποίηση τακτικού προϋπολογισμού, φορτοεκφόρτωση πλοίων, μεταφορά επιβατών, τροχαία κίνηση, θαλάσσιες έρευνες, υποβρύχια δραστηριότητα, ρύπανση από πλοία και από πηγές ξηράς, νομοθεσία πλοίων επαγγελματικής και ιδιωτικής χρήσης, στατιστικά στοιχεία για το απασχολούμενο και άνεργο ναυτεργατικό προσωπικό της χώρας κ.ά.

Πειθαρχικές-ποινικές υποθέσεις προσωπικού, μητρώα απογραφής ναυτικών, εργατών θαλάσσης, κατάρτιση, τήρηση ατομικών φακέλων, γενικά θέματα αλιείας, διοικητικά-οικονομικά θέματα αλιείας, ρύπανση από πλοία, τιμολογιακή πολιτική λιμένων, διαχείριση-διατήρηση αλιευτικών πόρων , έσοδα Λιμενικού Ταμείου από φόρους-τέλη κ.ά.

Πειθαρχικές και ποινικές υποθέσεις, μετεκπαίδευση και επιμόρφωση προσωπικού, μητρώα απογραφής ναυτικών, φορτοεκφόρτωση πλοίων, μεταφορά επιβατών – τροχαία κίνηση, στατιστικά στοιχεία για το απασχολούμενο και άνεργο ναυτεργατικό δυναμικό, επιδότηση άνεργων ναυτικών, εξοπλιστικά προγράμματα πλωτών-χερσαίων μέσων, στελέχωση ελληνικών πλοίων - σύνθεση πληρωμάτων, εκτέλεση τουριστικών πλόων, ιχθυοκαλλιέργεια κόλπου Μεσσαράς κ.ά

Φάκελος με έγγραφα σχετικά με βεγγαλικά, φάρους-φαροφύλακες, εκθέσεις επιθεώρησης επαγγελματικών σκαφών, υποτροφίες-εκπαίδευση-επιμόρφωση, σχολή δυτών στην Κάλυμνο, άδειες αλιείας μεγάλων πελαγικών ψαριών, οικονομική ενίσχυση μικρής παράκτιας αλιείας, παράνομη αλιεία αλλοδαπών, μέτρα αστυνόμευσης υποβρύχιων καταδύσεων-αποφυγή παράνομης υποβρύχιας αλιείας-αποφυγή διενέργειας αρχαιοκαπηλίας, μελέτη μεσογειακής φώκιας, ατυχήματα εργασίας στη θαλάσσια αλιεία-σπογγαλιεία, βιβλιοθήκες πλοίων, αναζητήσεις σκαφών, επιλογή προσωπικού για ελικόπτερα super puma, νέες τεχνολογίες

Φάκελοι: Ένταξη αθλητών – προπονητών Λ.Σ – ΕΛ. ΑΚΤ. σε κατηγορίες, Άγώνες πρωταθλήματος κολύμβησης ενόπλων δυνάμεων και σωμάτων ασφαλείας, Κλοπές εκκλησιαστικών εικόνων/ αντικειμένων, Συμμετοχή σε σχολείο ειδικών αποστολών Λ.Σ – ΕΛ. ΑΚΤ. ΚΗ΄ εκπαιδευτικής σειράς: αθλητική αξιολόγηση υποψηφίων και υγειονομικές εξετάσεις, Θέματα έρευνας και διάσωσης, Παράνομη απουσία αλλοδαπών ναυτικών, Κατάπλους – απόπλους Θ/Γ και Ι/Φ με Τούρκους επιβαίνοντες.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: πίνακες κρουαζιερόπλοιων, πίνακες προσεγγίσεως πλοίων υπό ξένη σημαία, άδειες, καταστάσεις και στατιστικά στοιχεία απόπλου και κατάπλου πλοίων και θαλαμηγών, καταστάσεις φορτώσεως σε πλοία, έγγραφα περί ονομασιών και σημαιών πλοίων και περί ελέγχων στελέχωσης πλοίων, στατιστικά στοιχεία θαλάσσιων συγκοινωνιών, δελτία συμβάντων, βιβλία διαιρέσεως φυλάκων πληρώματος, βιβλία ημερήσιας αναφοράς πληρώματος
Β. Οικονομικά στοιχεία: μπλοκ με αποδεικτικά εισπράξεως Λιμενικής Αρχής και Ειδικού Κλάδου Οικονομικής Ενίσχυσης Μερισματούχων Ναυτικών (Ε.Κ.Ο.Ε.Μ.Ν.), βιβλία αποθήκης και κατανάλωσης καυσίμων Λιμενικού Σταθμού Μονεμβασίας, έγγραφα περί τηλεπικοινωνιακών και φαρικών τελών
Γ. Αλληλογραφία: περί κανονισμού χερσαίας ζώνης και αδειών χρήσης αιγιαλού, έγγραφα περί κίνησης μοτοσυκλετών και περί λειτουργίας αιγιαλού και παραλίας
Δ. Στοιχεία Νομοθεσίας - Παραβάσεων - Προστίμων : έγγραφα περί οργανωμένου εγκλήματος
Ε. Στοιχεία Αλιείας: ατομικές, ερασιτεχνικές και επαγγελματικές άδειες αλιείας, άδειες αλιείας πελαγικών ψαριών, ημερολόγια αλιείας
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: απογραφές ναυτικών, έγγραφα Οίκου Ναύτου.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Στοιχεία πλοίων και πληρωμάτων: καταστάσεις επιβατών και οχημάτων, έγγραφα περί κίνησης κρουαζιερόπλοιων και θαλαμηγών, περί περιπολιών πλωτών, χερσαίων μέσων και λέμβων και περί ατυχημάτων μελών πληρώματος, άδειες ερασιτεχνικών και επαγγελματικών σκαφών
Β. Οικονομικά στοιχεία: πινάκια δαπανών ιατρών και Νοσοκομείου Σπάρτης, απολογισμοί φαρμάκων, δώρων και οδοιπορικών εξόδων, απολογισμοί Μετοχικού Ταμείου Ναυτικού, μισθοδοτικές καταστάσεις υπαλλήλων Λιμενικού Σταθμού Μονεμβασίας, δικαιολογητικά είσπραξης λιμενικών τελών, τελών προσόρμισης πλοίων και παγίων προκαταβολών, δικαιολογητικά Ειδικού Κλάδου Οικονομικής Ενίσχυσης Μερισματούχων Ναυτικών (Ε.Κ.Ο.Ε.Μ.Ν.), έγγραφα περί πόρων ασφαλιστικών ιδρυμάτων, πίνακες καυσίμων και λιπαντικών, έγγραφα περί μισθώσεως ακινήτου Λιμενικού Σταθμού Μονεμβασίας, έγγραφα περί εκκαθαρίσεως συντάξεων Ναυτικού Απομαχικού Ταμείου (Ν.Α.Τ.)
Γ. Στοιχεία Προσωπικού: έγγραφα περί υπηρεσιών, εκπαίδευσης και μετεκπαίδευσης προσωπικού Λιμενικού Σώματος
Δ. Λιμενική Αστυνομία: δικαιολογητικά Λιμενικής Αστυνομίας
Ε. Αλληλογραφία: περί αδειών χρήσεως και έργων επί αιγιαλού, εκλογών, ελέγχων λυμάτων και ρύπανσης
ΣΤ. Στοιχεία Ναυτικών: έγγραφα περί ανέργων ναυτικών
Ζ. Στοιχεία Αλιείας: αιτήσεις, υπεύθυνες δηλώσεις και δικαιολογητικά για έκδοση ερασιτεχνικών και επαγγελματικών αδειών αλιείας, έγγραφα περί παρουσίας Αιγυπτίων αλιεργατών σε αλιευτικά σκάφη, αλιευτικές επιθεωρήσεις
Η. Στοιχεία Λιμενικού Σώματος: πίνακες με στατιστικά και συγκριτικά στοιχεία

Αρχείο Λ/Σ Σερίφου το οποίο περιέχει τροποποιήσεις δρομολογίων, πίνακες δρομολογίων, καταστάσεις προσωπικού υπηρεσίας που ασχολήθηκε σε νυχτερινή υπηρεσία, διακινήσεις αλληλογραφίας και αποδείξεις κατάθεσης, δελτία εμπορευματικής κίνησης σκαφών, δελτία κίνησης Θ/Γ Σκαφών, μεταφορές επικίνδυνων φορτίων, υπεύθυνες δηλώσεις πλοιάρχων κ.α.

Φάκελοι: Γραφείο Επιστασίας (Μεταθέσεις - αποσπάσεις - τοποθετήσεις - επανδρώσεις - εκδηλώσεις ενδιαφέροντος αιτήματα μεταθέσεων, Προμήθειες βιβλίων, Άδειες προσωπικού, Υπηρεσιακή κατάσταση προσωπικού, Πειθαρχικές ποινές, Τελετές – εορτές – εθιμοτυπία, Κλήσεις προσωπικού για δικαστήρια, Εκθέσεις αξιολόγησης προσωπικού, Στολές, Εκλογές – απογραφή, Περιουσιακή κατάσταση προσωπικού, Οικονομική ηθική συμπαράσταση, Αθλητικά, Διαγωνισμοί – Προκηρύξεις - Προσλήψεις προσωπικού, Υγειονομικά).

Φάκελοι: Γραφείο Επιστασίας (Προγράμματα Ψυχαγωγίας Προσωπικού Λ.Σ, Αθλητισμός, Ναυτική εβδομάδα), Γραφείο Διαχειρίσεως (Μίσθωση κτηρίου στέγασης Λ/Σ Σκοπέλου, Παραχωρήσεις χώρων για ανέγερση Λιμενικών Καταστημάτων), Γραφείο Δ/νσης Προστασίας Θαλάσσιου Περιβάλλοντος (Ρύπανση από πηγές ξηράς, Επιτήρηση θαλάσσιου χώρου από αέρα και θάλασσα για ρύπανση)

Φάκελοι: Γραφείο Επιστασίας (Τοποθετήσεις, Μεταθέσεις, Προαγωγές - Τοπικές Εορτές - Eκλογικά - Κλήσεις προς Λ/Σ για δικαστήρια - Κανονικές , Προφορ. Άδειες & Αναρρωτικές), Γραφείο Ν.Α.Τ. ( Διάφορα-Αλληλ/φία-Έξοδα κηδείας , Εξοφλήσεις Ν/γίων, Φύλλα Εκκ/σεως Ν/γίων) Γραφείο Λιμενικής Αστυνομίας (Ρυμουλκήσεις, Μεταφορά ασθενών με πλοία, Ναυτικοί Πράκτορες, Εορτές-Εκδηλώσεις-Έρανοι-Πανηγύρια, Λεμβολόγια, Μισθώσεις άγονων γραμμών & Ταχυδρομικών γραφείων)