Φάκελοι: Γραφείο Γραμματείας → Αλληλογραφίας θεμάτων εθιμοτυπίας, Φάκελοι αναφορών (Κ.Λ. Βόλου, Κ.Λ. Θεσσαλονίκης , Υ/Χ Καρύστου, Λ/Χ Αιδηψού, Υ/Χ Σκοπέλου, Υ/Χ Κύμης, Κ.Λ. Χαλκίδας), Γραφείο Επιστασίας → Ατομικοί Φάκελοι, Φάκελος δελτίων μηνιαίων συσκέψεων Λιμενικών Αρχών, Λιμενική Αστυνομία → Διενέργειες ελέγχων από Λιμενικές Αρχές, Φάκελος συνόδου κορυφής Ευρωπαϊκής Ένωσης στη Χαλκιδική, Φάκελος αναφορών για ναυαγοσώστες, Γραφείο Ασφαλείας Ναισιπλοΐας → Φάκελος αναφορών Λιμενικών Αρχών για περιστατικά έρευνας διάσωσης, Φάκελος πτώσης ελικοπτέρου «ΣΙΝΟΥΚ» με επιβαίνοντα τον Πατριάρχη Αλεξανδρείας και τη συνοδεία του την 01.10.2004.

Φάκελοι: Δελτία συμβάντων Λιμενικών Αρχών, Ημερήσιες αναφορές 4ης ΠΕΔΙΛΣ και Λιμενικών Αρχών υπαγωγής.

Ναυτικοί πράκτορες,εγκύκλιοι,λεμβούχοι-αχθοφόροι,κλοπές έργων τέχνης,απεργίες,λιποτάκτες ναυτικοί,φάροι και φανοί, πρόληψη αρχαιοκαπηλείας

Δελτία εμπορευματικής κίνησης, μπλοκάκια είσπραξης, ημερολόγια συμβάντων, αιτήσεις για άδεια αλιείας

Φάκελος συμβάντων

Βουλευτικές εκλογές, δημοσιεύματα τοπικού τύπου, έκθεση γενικής τακτικής επιθεώρησης Λιμενικής Αρχής Ηγουμενίτσας (Εμπιστευτικό), δελτία δραστηριότητας Λιμενικών Αρχών 3ης Περιφερειακήσ Διοίκησης Λιμενικού Σώματος - Ελληνικής Ακτοφυλακής και Λιμενικών Αρχών Υπαγωγής (περιέχει εμπιστευτική αλληλογραφία), αναφορές προβλημάτων σε λιμένα Κέρκυρας και Λιμενικών Αρχών Υπαγωγής

Έγγραφα που αφορούν αστυνομικούς και αγορανομικούς ελέγχους, FRONTEX, διάφορα συμβάντα