Το αρχείο περιλαμβάνει κώδικες, φιρμάνια, πατριαρχικά γράμματα, βεράτια και διάφορα άλλα τεκμήρια που παρήχθησαν ή συγκεντρώθηκαν από τα λειτουργούντα στο πλαίσιο της οθωμανικής διοίκησης εκκλησιαστικά και κοινοτικά όργανα του ελληνορθόδοξου μιλλέτ των περιοχών της Μικράς Ασίας, του Πόντου και της Ανατολικής Θράκης.

Ο κύριος όγκος του αρχειακού υλικού αποτελείται κυρίως από κώδικες που κρατούσαν οι κατά τόπους εκκλησίες και κοινότητες, αφορούν τον 19ο αιώνα και φτάνουν έως το 1922. Το υλικό χωρίζεται κατά κύριο λόγο σε δύο κατηγορίες, τους κοινοτικούς και τους εκκλησιαστικούς κώδικες, η τυπολογία των οποίων παρουσιάζει μεγάλη ποικιλία ενώ υπάρχουν και κώδικες που μετέχουν και των δύο κατηγοριών (κοινοτικοί και εκκλησιαστικοί). Οι κοινοτικοί κώδικες περιλαμβάνουν πρακτικά συνεδριάσεων της δημογεροντίας, κανονισμούς σωματείων, πωλητήρια, δωρητήρια, συμβόλαια δασκάλων, έξοδα συντήρησης σχολείων, καταλόγους βιβλιοθηκών, πατριαρχικές εγκυκλίους, όπως διάφορες ενθυμήσεις για σεισμούς, λιμούς κ.λ.π. αλλά και πληροφορίες για δοσοληψίες με την οθωμανική εξουσία μέσω των φόρων και των απογραφών. Στους εκκλησιαστικούς κώδικες καταγράφονται έσοδα και έξοδα, βαπτίσεις, γάμοι, διαθήκες, θέματα διαχείρισης της εκκλησιαστικής και μοναστικής περιουσίας, το φιλανθρωπικό έργο αλλά και τα ιερά σκεύη και τα κτήματα των εκκλησιών και μοναστηριών με την προοπτική της Ανταλλαγής.

Στο αρχείο εκτός από τους κώδικες διασώζονται φιρμάνια, βεράτια και πατριαρχικά γράμματα κυρίως από τις περιοχές της Καππαδοκίας, του Πόντου, της Κιλικίας, της Ανατολικής Θράκης και της Βιθυνίας που αποτυπώνουν το πλαίσιο των σχέσεων των κοινοτικών και εκκλησιαστικών οργάνων του ελληνορθόδοξου μιλλέτ με την οθωμανική διοίκηση και το Οικουμενικό Πατριαρχείο.

Συλλογή Λαδά, Τμήμα Γ΄: Ποικίλα και υπολείμματα αρχείων ή άλλων συλλεκτών (φ. 22-69):

1. Γεωργαντάς Αντώνιος: επιστολές προς τον Γεωργαντά και έγγραφα οικονομικής φύσεως.
2. Ελευθέρων Τεκτόνων αλληλογραφία, κ.ά.
3. Μανουήλ Γεδεών: Έγγραφα, επιστολές, τετράδια, σημειώματα, αντίγραφα παλιά πατριαρχών και μητροπολιτών από τη συλλογή του Μανουήλ Γεδεών.
4. Μπουρνιά - Κολυβά: διάφορα, κυρίως, επτανησιακά, σπαράγματα και μη κωδίκων, από τη συλλογή Μπουρνιά - Κολυβά.
5. Φιλητάς Χριστόφορος: Αλληλογραφία του Φιλητά και έργα του (όλα σχεδόν ελλιπή), σπαράγματα κωδίκων και παλαιά τετράδια ξένων συγγραφέων.
6. Μπαλάσκα Λ: έργα του περί ναυτικής κ.ά.
7. Φιλήμων Τιμολέων: αλληλογραφία του Φιλήμονος και σχετικά με τη Βιβλιοθήκη της Βουλής.
8. Κουτούζης Νικόλαος: πιστοποιητικά και έργα του Νικολάου Κουτούζη.
9. Επιστολές και έγγραφα προς τους Ιωάννη Θ. Στεφάνου και Φρ. Καρβελλά.
10. Χριστομάνου διάφορα,
11. Μομφεράτου Α. διάφορα.
12. Μίχου Αρτέμιου, Το εν τη πολιορκία του Μεσολογγίου γραφέν (πρωτότυπο) ημερολόγιο.
13. Δρόσος Β.: πιστοποιητικά και διάφορα της περιόδου της Επανάστασης του 1821.
14. Σιγίλλιο που εκδόθηκε επί Γρηγορίου Ε' το έτος 1799 (περγαμηνή με μολυβδόβουλλο).
15. Σιγίλλιο που εκδόθηκε επί Παϊσίου, το έτος 1731 (περγαμηνή με μολυβδόβουλλο).
16. Διάφορα: α. Αθανασίου Ψαλίδα, β. Νικολάου Σπηλιάδου, γ. Ζώτου-Χρυσανθοπούλου, δ-ε. Διαφόρων επιστολές των ετών 1822-1826, στ. Μεταφράσεις παλιών οθωμανικών εγγράφων.

Γράμματα πατριαρχικά και συνοδικά, πατριαρχική απανταχούσα (περγαμηνό), σιγίλλια, επιβεβαιωτήρια, πρωτότυπα ή αρχαία απόγραφα καθώς και δύο (2) επίσημα γράμματα, ανάμεσά τους και σιγίλλιο του Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως Μητροφάνους Γ΄ σχετικά με την ανανέωση προνομίων της Μονής Μετεώρων.

Συλλογή πατριαρχικών και εκκλησιαστικών εγγράφων και σιγιλλίων: σιγίλλιο του Πατριάρχη Κωνσταντινουπόλεως Κυρίλλου Α΄ (Λουκάρεως) (1620), του Πατριάρχη Διονυσίου Δ΄ σχετικά με τη Μονή Ευαγγελιστρίας Ζαγαρά (1679), του Κυρίλλου Ε΄ για τη Μονή της Υπεραγίας Θεοτόκου της Ζωοδόχου Πηγής στη νήσο Πιπέρι Αλοννήσου (1753), του Γρηγορίου του Ε΄σχετικά με τη Μονή Ευαγγελιστρίας Ζαγαρά (1798), κ.ά.