Το αρχείο περιλαμβάνει καταγραφές από τα προγράμματα του F. Cooper στην Πελοπόννησο, συγκεκριμένα στις Βάσσες, Περιβόλια και Πύλος (MARWP): επίσημη αλληλογραφία σχετικά με άδειες και χρηματοδότηση, φύλλα καταγραφής πεδίου, σημειώσεις, φωτογραφίες, διαφάνειες και σχέδια. Ένα σημαντικό μέρος των αρχιτεκτονικών σχεδίων αφορά στη μελέτη του και τελική δημοσίευση για το ναό του Απόλλωνα στις Βάσσες (4 τόμοι), που ξεκίνησε ως αντικείμενο της διδακτορικής του διατριβής το 1969. Ενώ εργαζόταν στις Βάσσες, έκανε τα σχέδια για το Δωρικό ναό που είχε πρόσφατα ανακαλυφθεί στα κοντινά Περιβόλια (1972). Επέστρεψε στο χώρο το 1978-1979 με τον J. Wilson Myers για λήψη αεροφωτογραφιών και για μία έρευνα στη Φιγαλεία. Κατά τη διάρκεια της δεκαετίας του 1990, ο Cooper διηύθυνε το πρόγραμμα αρχαιολογικής έρευνας και εξερεύνησης στην Πελοπόννησο του Πανεπιστημίου της Minnesota, MARWP (Minnesota Archaeological Researches in the Western Peloponnese).