Το αρχείο περιλαμβάνει:
(α) τα συγγράμματά του (ιστορικής/ιστοριοδιφικής φύσεως) που αφορούν τους Έλληνες της Ρουμανίας, το Κουτσοβλαχικό ζήτημα και ιστορικά πρόσωπα της ορθοδοξίας,
(β) αλληλογραφία,
(γ) φωτογραφικό αρχείο,
(δ) τους Έλληνες από τη Ρουμανία στο Λαύριο,
(ε) αρχείο του πατέρα του, Θωμά Μουδόπουλου,
(στ) σχολικό αρχείο.

Σύμμεικτη συλλογή:

1. Έγγραφα από τη Ρουμανία (1865-1907) και μια (1) φωτογραφία από το φωτογραφείο Sebastianuti στην Τεργέστη.
2. Χρεωστικά γραμμάτια και ναυτοδάνεια από τη Σκιάθο και τη Σκόπελο (1866-1883). Αποδείξεις πληρωμής της Ελληνικής Ασφαλιστικής Εταιρείας "Ο Φοίνιξ" (1870 - 1873).
3. Απόδειξη παραλαβής χρημάτων των μοναχών του Κοινοβίου του ρωσικού (1821), έγγραφο της Ελληνικής Πολιτείας προς τον χιλίαρχο Στάθη Κατσικογιάννη (Ναύπλιο, 1830), έγγραφα της Αστυνομίας Αποκούρου Νάξου (1830-1831).