Συλλογή που περιλαμβάνει
Α. Έντυπα:

1. Γενικοί Λογαριασμοί της Οικονομικής Διαχειρίσεως του Κράτους από 21 Ιανουαρίου 1833 μέχρι 31 Δεκεμβρίου 1843. Μετά της προς τον Βασιλέα Εκθέσεως του Υπουργού των Οικονομικών. Αθήνησιν, εν έτει 1849,
2. Μονόφυλλο επικολλημένο σε φύλλο χαρτιού όπου βενετικά σημειώματα με τίτλο "Διοίκησις των Ιονικών Νήσων. Ημερίς Κριτής της Ειρήνης εξ αναζητήσεως του Κυρ. Δομηνίγγου Γρόφου...Εδόθη τας 4/16 Ιουνίου 1814",
3. Μονόφυλλο "Προς τους απανταχού Συμπολίτας και Ομογενείς Έλληνας...Εν Αθήναις τη 18 Μαΐου 1880 ο Πρόεδρος Σ. Σωτηρόπουλος, ο Γραμματεύς Τιμολέων Φιλήμων, ο Ταμίας Μ. Χαρίλαος, τα Μέλη κλπ., περί της καταστάσεως των φυλακών" (εγκύκλιος άγνωστου σωματείου).
   Β. Χειρόγραφα:
4. Αντίγραφο της 15ης Φεβρουαρίου 1831 με τίτλο "Διδαχή του εν Αγίοις Πατρός ημών Κοσμά του Ιερομάρτυρος",
5. Έκθεση δακτυλογραφημένη "Ίδε οι άνθρωποι το πρώτον" σχετικά με την εκλογή του Επισκόπου Αρκαδίας.
   Γ. Έγγραφα:
6. Επιβεβαιωτήριο του Πατριάρχη Ιεροσολύμων Δαμιανού σχετικά με τη γνησιότητα του τιμίου ξύλου που δόθηκε στην Φλώραν Αγ. Κουτσογιάννη (20 Απριλίου 1911).
7. Επιβεβαιωτήριο του Πατριάρχη Ιεροσολύμων Δαμιανού σχετικά με τη γνησιότητα του τιμίου ξύλου που δόθηκε στην Καλλιόπη Κ. Τσουκαλά (20 Απριλίου 1911).
8. Τρία έγγραφα προς τον Ι. Παπαδόπουλο καθηγητή Πανεπιστημίου: α. του Πατριάρχη Κωνσταντινούπολης (20 Μαρτίου 1949), β. του δημάρχου της Lyon και προέδρου της Εθνικής Συνέλευσης της Γαλλίας Edouard Herriot (19 Ιουλίου 1947), γ. του προξένου του Ισραήλ στην Αθήνα (28 Απριλίου 1949).
9. Διάταγμα του Γεώργιου Α' (14 Νοεμβρίου 1881).
10. Επιστολή του Δημητρ. Π. Πασχάλη από την Άνδρο σε άγνωστο συγγραφέα μελέτης για τον Θ. Καΐρη (29 Ιανουαρίου 1926)
    Δ. Οθωμανικό φιρμάνι.

Η συλλογή περιέχει πρωτότυπα έγγραφα και χειρόγραφα που αφορούν, κυρίως, στην εκκλησιαστική, πολιτική και εσωτερική ιστορία των νησιών του Αιγαίου Πελάγους και άλλων ελληνικών χωρών τους χρόνους της Φραγκοκρατίας και της Τουρκοκρατίας, αντίγραφα και φωτογραφίες εγγράφων και χειρογράφων από αρχεία της Ευρώπης, της Ελλάδας και της Ανατολής, διάφορα χειρόγραφα και σημειώματα του ιστοριοδίφη καθώς και την αλληλογραφία του με διαπρεπείς Έλληνες και ξένους επιστήμονες.
Επίσης, περιλαμβάνει διάφορα φιρμάνια, μπουγιουρντί, ακτιναμέδες (ahitname) και άλλα έγγραφα, που αφορούν ποικίλες υποθέσεις των νησιών του Αιγαίου Πελάγους, όπως φορολογικές υποθέσεις, απόδοση ιλτιζάμ (iltizam) νήσων και εκμίσθωση δεκάτης, διενέξεις Φράγκων και Ρωμαίων, αποστολή ανδρών και υλικών για τις ανάγκες του αυτοκρατορικού στόλου, περί προστασίας ρωσικών εμπορικών πλοίων, περί μη καταπίεσης ραγιάδων, περί επίλυσης διαφορών ραγιάδων, κ.ά.

Ο κατάλογος της συλλογής διαιρείται σε εννιά (9) κεφάλαια:

1. Εκκλησιαστικά και μοναστηριακά (Πατριαρχεία Κωνσταντινουπόλεως, Ιεροσολύμων, Μητροπόλεις Αγαθοπόλεως, Αθηνών, Άρτης, Βάρνας, Ευρίπου, Εφέσου, Ηρακλείας, Ιωαννίνων, Καισαρείας, Μονεμβασίας, Σάμου, Τυρνόβου, Επισκοπές, Μονές, Μονύδρια, Ναοί)
2. Λατινική Εκκλησία των Νήσων,
3. Σχολικά (Κάσος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Φολέγανδρος),
4. Κοινοτικά (Κέα, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Πάτμος, Σύρος, Φολέγανδρος),
5. Διοικητικά και Φορολογικά (Λατίνοι δυνάστες, Τουρκοκρατία-Νήσοι Αιγαίου, Άνδρος, Μύκονος, Νάξος, Πάρος, Σίκινος, Σύρος, Φολέγανδρος),
6. Ελληνικές Παροικίες του Εξωτερικού (Ανκόνα & Λιβόρνο),
7. Ιδιωτικά,
8. Διάφορα,
9. Χειρόγραφα
   και εντός των κεφαλαίων έγιναν μικρότερες υποδιαιρέσεις κατά γεωγραφικές ενότητες.

Αναλυτικότερα:
Κ36_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: χειρόγραφα 1-6
Κ37_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 1-43
Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 44-59,
Κ38_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 60-90
Κ39_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 91-110
Κ40_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 111-135
Κ41_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 136-155
Κ42_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 156-172
Κ43_Συλλογή Περικλέους Ζερλέντη: φ. 173-185