Χειρόγραφες σημειώσεις εκκλησιαστικού περιεχομένου και αλληλογραφία Μητροπολίτη Μεσσηνίας Πανάρετου Κωνσταντινίδη (1882-1897), Μητροπολίτη Θεσσαλιώτιδος Ιεζεκιήλ Βελανιδιώτη (1874-1953), Αγιορείτη Μοναχού Κορνήλιου Δουκάκη, κατά κόσμον Κωνσταντίνου Δουκάκη. Υποθέσεις σχετικές με Ι.Μ. Καλογραιών, Άσυλο Προστασίας Απόρων Ανιάτων "Η Στέγη της Εκκλησίας", Αλεξανδράκεια Κληροδοτήματα (κληροδοσίες). Αναγκαστικές απαλλοτριώσεις για ίδρυση αεροδρομίου Καλαμάτας, δημιουργία εγκαταστάσεων Διασποράς, διάνοιξη-διαπλάτυνση εθνικών-επαρχιακών οδών, μετεγκαταστάσεις οικισμών, δημιουργία προσφυγικού οικισμού Πλεύνας, υδραυλικά έργα-αρδευτικό δίκτυο κ.ά. Διαλύσεις Σωματείων. Υποθέσεις διαφόρων Συλλόγων. Υποθέσεις εταιριών, επιχειρήσεων, βιομηχανιών κ.ά. Υποθέσεις ιδιωτών.

Το δικηγορικό αρχείο του Π. Παπαθεοδώρου διαρθρώνεται ως εξής:
α. Υποαρχείο Κυλινδρόμυλων Μεσσηνίας "Ευαγγελίστρια Α.Ε." (1925-1993)
β. Υποαρχείο Κυλινδρόμυλου Καλαμών "Φεραδούρος-Αποστολάκης και Σία" (1922-1985)
γ. Υποαρχείο υποθέσεων διαφόρων Εταιρειών (πχ.Κεραμοποιίας Αφών Αθαν. Αναγνωσταρά, Χρ. Παπαδημητρίου, Εταιρείας Χρ. Οικονομάκη - Γ. Χαρίτση Α.Ξ.Ε.Κ., κ.ά.)και Ιδιωτών.

Υποθέσεις σχετικές με μεσσηνιακά εργοστάσια και επιχειρήσεις (Κυλινδρόμυλους Μεσσηνίας "Ευαγγελίστρια", Διεθνή Βιομηχανία Ενδυμάτων Α.Ε., Ελαιουργία Μεσσηνίας Α.Ε., Ανδρέα Γυφτέα Α.Ε., Ν. Παυλέα & Σία Ο.Ε., Συκική κ.ά.), με δήμους και κοινότητες, με δασαρχείο, με το λατομείο Λεϊκων, με παράνομη εργασία αλλοδαπών, με απάτες, κλοπές, δανειοδοτήσεις, πλειστηριασμούς, κατασχέσεις, υπεξαιρέσεις, διαζύγια, επιμέλεια ανηλίκων, φόνους, ναρκωτικά, κατασκοπεία, αυθαίρετα κ.ά.

-Υποθέσεις εμπορικές, ήτοι νομικές υποθέσεις που σχετίζονται με εμπόρους, βιομηχανίες, με σύσταση και διάλυση εταιριών, πτωχεύσεις, με αγοραπωλησίες προϊόντων, έκδοση γραμματίων, οφειλές, εργασιακά κ.ά.
-Υποθέσεις δήμων και κοινοτήτων, ήτοι χρέη ιδιωτών προς το δήμο, δημοτικοί φόροι, απαλλοτριώσεις για κατασκευή δημοτικών οδών κ.ά.
-Υποθέσεις εκκλησιαστικές
-Υποθέσεις σχετικές με τα "Αλεξανδράκεια Κληροδοτήματα"
-Υποθέσεις ιδιωτών με το δημόσιο για ιδιοκτησιακά κυρίως θέματα.
-Υποθέσεις ιδιωτών σχετικές με κληρονομικές διαφορές, οικονομικές οφειλές, μισθώσεις ακινήτων, διαζύγια, βιαιοπραγίες, φόνους, καταπατήσεις ιδιοκτησιών, ληξιαρχικά, επιτροπείες ανηλίκων, υιοθεσίες κ.ά.
-Υποθέσεις διάφορες σχετικές με υπεξαιρέσεις στρατιωτικών ειδών και ειδών συσσιτίου (1917-1919), με λιποταξίες εν καιρώ πολέμου (1917-1920), με Εθνικό Διχασμό (περί διάδοσης ψευδών φημών, περί δυσμένειας κατά του καθεστώτος, περί παράβασης καθήκοντος, περί εσχάτης προδοσίας, άσκοπων πυροβολισμών, δίωξης βενιζελικού κ.ά.), με κατηγορία για αισχροκέρδεια από πρόχειρο διαγωνισμό προμήθειας τροφίμων από τη 14η Μεραρχία (1924), με Εταιρικό "Επισιτιστικής Ένωσης Καλαμών" (1943-1944), με αιτήσεις συζύγων θυμάτων πολέμου για χορήγηση πιστοποιητικών θανάτου (θύματα στρατοπέδων συγκέντρωσης και εμφυλίου) και για χορήγηση συντάξεων (1944-1946), με αποζημίωση θυμάτων πολέμου στην Κατοχή (1946-1963), με συνεδριάσεις Ειδικού Δικαστηρίου Δοσίλογων (1947) κ.ά.