Φάκ. 1: Αφορά στη δημαρχοντία του Γεώργιου Κων/νου Κουτσομητόπουλου (1903-1907). Έντυπα με τη λογοδοσία πεπραγμένων και κρίσεις επί του προϋπολογισμού του Παναγιώτη Εμμ. Μπενάκη. Το πρόγραμμα του Γ. Κουτσομητόπουλου ως υποψήφιου δημάρχου, αλληλογραφία του με διάφορες αρχές, αποκόμματα εφημερίδων των ετών 1899-1930. Δημόσια έγγραφα που αφορούν την οδό Λεϊκων επί δημαρχίας Γ. Κουτσομητόπουλου, τοπογραφικά, αντίτυπα εφημερίδων, έγγραφα του κτηματολογίου, κ.ά.
Φάκ. 2, 3: Αφορούν στην οικογένεια Λυβοπούλου: Εξοφλητικό συμβόλαιο, έγγραφα σχετικά με κληρονομικά θέματα των Παναγιώτη και Χρυσούλας Λυβοπούλου, εμπορικής φύσεως έγγραφα του Π. Λυβόπουλου (1865- 1891), ισοζύγια πληρωμών (1867-1891). Δικαστικά έγγραφα του Π. Λυβόπουλου των ετών 1866-1900 (γραμμάτια, κατασχετήρια, πλειστηριασμοί, συμβόλαια, αγωγές κ.ά.)
Φάκ. 4: Αφορά στον Εμπορικό Σύλλογο «Ερμής» (1878- 1920). Καταστατικά λειτουργίας του, αποκόμματα εφημερίδων, εκθέσεις πεπραγμένων. Αιτήσεις για φιλανθρωπικές δωρεές προς τον Γ. Κουτσομητόπουλο.
Φάκ. 5,6: Αφορούν στο Εμπορικό και Βιομηχανικό Επιμελητήριο Καλαμών: Επιμελητηριακά έγγραφα (1914-1932): τιμές προϊόντων, αλληλογραφία με το Υπουργείο Εθνικής Οικονομίας, κατάλογοι εμπόρων, προϋπολογισμοί, κατάλογοι με καταστήματα, βιομηχανίες, εισαγωγές-εξαγωγές, ασφαλιστικούς πράκτορες, πληροφορίες από νομογεωπόνους κ.ά. Πρακτικά συνεδριάσεων, αλληλογραφία, αντίτυπα εφημερίδας Σημαία, αποφάσεις διαιτητικές κ.ά.
Φάκ. 7, 8, 9: Αφορούν στα «Αλεξανδράκεια Κληροδοτήματα» κ.ά.
α) Κανονισμός της διοικήσεως των εν Καλάμαις Κληροδοτημάτων Σπυρίδωνος Αλεξανδράκη. β) ΄Εκθεσις ελεγκτών 1906 για διαχείριση Πτωχοκομείου-Νοσοκομείου, έγγραφα, ισολογισμοί, αλληλογραφία (1876-1903), απολογισμοί (1897-1904). Κανονισμός του εν Καλάμαις Νοσοκομείου και Πτωχοκομείου. γ) Διαχείριση Σχολείου εν Κάμπω, απολογισμοί (1872- 1922), κανονισμοί της διοίκησης, πρακτικά συνεδριάσεων. Σχέδια που αφορούν το Ελληνικό σχολείο Κάμπου (1928). δ) Προσχέδιο του Μεγάρου του Επιμελητηρίου. ε) Υδραγωγείο Αλμυρού (1873-1933) (εκθέσεις πραγματογνωμόνων, επιστολές, πωλητήρια κ.ά.). στ) Θάνατος Μητροπολίτη Μελετίου (1904-1933) και αλληλογραφία του Μητροπολίτη με τον Θεμιστοκλή Κουτσομητόπουλο.
Φάκ. 10 , 11,12: Αφορούν το «Παπαδοπούλειο Βρεφοκομείο», ήτοι: Βιβλίο καταμερισμού εμπορευμάτων. Έγγραφα 1880-1911 (ιδιοκτησίες-σχέδια Βρεφοκομείου Γεωργίου Εμμ. Παπαδόπουλου, τοπογραφικό διάγραμμα κ.ά). Έγγραφα (κυρίως συμβολαιογραφικά) 1880-1910 του Γεώργιου Εμμ. Παπαδόπουλου. Έγγραφα 1905-1928 (δωρεές, αλληλογραφία Θεμ. Κουτσομητόπουλου, ταμία Βρεφοκομείου Καλαμών). Βιβλίο πρακτικών 1901-1912. Δικαστικές υποθέσεις, 1909-1910.

Το αρχείο αποτελείται από την επίσημη αλληλογραφία του Σκουλούδη, λευκώματα με αποκόμματα εφημερίδων, και βιβλία από την ιδιωτική του βιβλιοθήκη. Παρέχουν έναν πλούτο πληροφοριών για την πολιτική σταδιοδρομία του Σκουλούδη και την ιστορία της Σύγχρονης Ελλάδας στο τελευταίο μέρος του 19ου αιώνα και το πρώτο τέταρτο του 20ου αιώνα. Ο Σκουλούδης ήταν επίσης ιδρυτής της Εταιρείας της Λίμνης Κωπαΐδος (1883), που ανέλαβε το πρόγραμμα για την αποξήρανση της Λίμνης Κωπαΐδος στα τέλη του 19ου αιώνα.

Το αρχείο του Φ.Δ. xαρακτηρίζεται από μία πλούσια μακεδονική θεματολογία σε πολιτικό, τοπικό κυρίως επίπεδο (τοπική πολιτική ιστορία Δυτικής Μακεδονίας) και σε εθνικό (εθνικές διεκδικήσεις). Χαρακτηρίζεται επίσης από μία τάξη και εσωτερική διάρθρωση που συμβαδίζει με την “πολιτική αταξία” της εποχής που έζησε. Παράλληλα, είναι φανερό ότι το αρχείο τηρήθηκε από τον δημιουργό του, με ιδιαίτερη φροντίδα και έγνοια να διασωθεί η παραμικρή λεπτομέρεια και να καταγραφεί κάθε ενέργεια.

Στο αρχείο υπάρχουν τα χειρόγραφα σχέδια απαντητικών επιστολών καθώς και η τελική δακτυλογραφημένη μορφή τους, σχεδόν για κάθε επιστολή που ελάμβανε. Ετσι ο αναγνώστης έχει πλήρη εικόνα των θέσεων και απόψεων του αποστολέα αλλά και του παραλήπτη. Υπάρχουν επίσης όλες οι μορφές των κειμένων του, από την πρώτη γραφή μέχρι την τελική, όπου παρεμβάλλονται διορθώσεις (ουσιαστικές και μη), προσθαφαιρέσεις κ.λ.π. Είναι ιδιαίτερα ενδιαφέρουσα η παρακολούθηση της εξέλιξης ενός κειμένου για τη μελέτη της προσωπικότητας του δημιουργού του. ΄Ενα άλλο χαρακτηριστικό του αρχείου ήταν τα πολλαπλά δακτυλογραφημένα αντίγραφα (5-10 για πολλά έγγραφα) και τα πολλαπλά αποκόμματα εφημερίδων.

Το αρχείο του Φ.Δ. αναφέρεται κυρίως στην περίοδο του Μεσοπολέμου και στον Εμφύλιο, που είναι από τις πλέον περίπλοκες και συγκεχυμένες περιόδους της νεοελληνικής ιστορίας. Η μεταφορική “αταξία” του αρχείου, συνίσταται σε μια συνεχή, διάχυτη αίσθηση και εντύπωση, ότι σχεδόν όλα τα θέματα, της πρώτης κυρίως ενότητας, είναι αλληλένδετα και συναντιώνται σε όλους τους φακέλους, και αυτό γιατί τα περιεχόμενα των φακέλων επικαλύπτονται ή έχουν εκ των πραγμάτων θεματική συνάφεια και συνέχεια. Η αποτύπωση της ιστορικής περιόδου άφησε τα ίχνη της στη διάρθρωση του αρχείου στο οποίο απεικονίζονται η προσωπική δράση και τα ενδιαφέροντα του δημιουργού του.

Ο κύριος όγκος του αρχείου, είναι επικεντρωμένος στα εθνικά και πολιτικά θέματα της Μακεδονίας και κυρίως, της Δυτικής. Αλλά τα εθνικά θέματα που αντιμετωπίζει η χώρα είναι αναγκαστικά και πολιτικά, ενώ τα πολιτικά συνίστανται σε κομματικά, βουλευτικά, εκλογικά, οικονομικά, εκπαιδευτικά και κυβερνητικά θέματα. Είναι προφανές ότι η αλληλεπίδραση και η αλληλεξάρτηση όλων των παραπάνω θεμάτων και των ανθρώπων που εμπλέκονται δημιουργούν ένα σύμπλεγμα διαλεκτικών σχέσεων, με ιστορική διάρκεια μέσα στο χρόνο.