Περιέχει αρχειακό υλικό από τα γραφεία Λιμενικής Αστυνομίας, Επιχειρησιακών Μέσων, Ελέγχου Αλιείας, Ασφάλειας Ναυσιπλοΐας, Εκπαίδευσης Ναυτικών, Ναυτικής Εργασίας, Θαλάσσιων Συγκοινωνιών, Προστασίας Θαλάσσιου Περιβάλλοντος κ.ά.

Βιβλία ημερήσιας αναφοράς πληρώματος Λ/Σ Οινουσσών,φάκελοι Δ.Θ.Σ.,Αρχείο περιπολιών,Νυχτερινά,Δελτία απόπλου-κατάπλου,Σήματα-έγγραφα για Θ/Γ με σημαία Τουρκίας

Περιέχει αρχειακό υλικό από τη Διεύθυνση Ελέγχου Αλιείας, τη Διεύθυνση Προστασίας Θαλασσίων Συνόρων, τη Διεύθυνση Επιχειρησιακών Μέσων, τη Διεύθυνση Προσωπικού, τη Διεύθυνση Χρηματικού Ελέγχου Δαπανών και Ασφάλισης Προσωπικού, τη Διεύθυνση Θαλάσσιων Συγκοινωνιών, τη Διεύθυνση Λιμενικής Αστυνομίας, τη Διεύθυνση Ασφάλειας Ναυσιπλοΐας κ.ά.