Το αρχείο περιλαμβάνει τα εξής:
Α. Αλληλογραφία: αλληλογραφία με το Υπουργείο Γεωργίας, τη Διεύθυνση Υγείας και Πρόνοιας Νομαρχίας Λακωνίας, τη Διεύθυνση Κτηνιατρικής Νομαρχίας Λακωνίας, τη Νομαρχία Χανίων, το Υπουργείο Εμπορικής Ναυτιλίας, το Υπουργείο Υγείας και Πρόνοιας, το Υπουργείο Κοινωνικών Υπηρεσιών και τη Διεύθυνση Θαλάσσιων Συγκοινωνιών, έγγραφα περί γνωμοδοτήσεων για χρήση αιγιαλού, εκδόσεως αδειών τοποθέτησης τραπεζοκαθισμάτων και ομπρελών στη χερσαία ζώνη του Λιμένος Γυθείου, μέτρησης θερμοκρασίας επιφάνειας θαλάσσης, μεταφοράς χαρουπιών
Β. Στοιχεία Πλοίων - Πληρωμάτων: έγγραφα περί δρομολογίων επιβατηγών, οχηματαγωγών, θαλαμηγών, κρουαζιερόπλοιων και πλοίου στη γραμμή Γυθείου – Κυθήρων – Αντικυθήρων – Κισάμου, μηχανογραφικές καταστάσεις εισιτηρίων, έγγραφα περί αναγγελιών – καθυστερήσεων - απαγορεύσεων απόπλου, καρτέλες καταπλεόντων πλοίων με ξένη σημαία, άδειες πετρέλευσης σκαφών, άδειες εξόδου πληρωμάτων καταπλεόντων πλοίων
Γ. Στοιχεία Ναυτικών: εγκύκλιοι απογραφής ναυτικών, έγγραφα Γραφείου Ευρέσεως Ναυτικής Εργασίας (ΓΕΝΕ), κατάλογοι και δικαιολογητικά προσφερομένων για ναυτολόγηση ανέργων ναυτικών, εγκύκλιοι προκηρύξεων για την εισαγωγή σπουδαστών στις Ακαδημίες Εμπορικού Ναυτικού (Α.Ε.Ν.)
Δ. Στοιχεία Παραβάσεων: έγγραφα περί διοικητικών παραβάσεων κανονισμού λιμένος
Ε. Στοιχεία Αλιείας: εκθέσεις αλιευτικής επιθεώρησης.

Το αρχείο περιλαμβάνει:
Α. Δικαστικά Στοιχεία: ποινικές καταστάσεις
Β. Στοιχεία Πλοίων: έγγραφα ελέγχων στελέχωσης πλοίων, πίνακες προσεγγίσεων πλοίων υπό κοινοτική σημαία και σημαία Τρίτων Χωρών στο Λιμένα Γυθείου, άδειες απόπλου πλοίων
Γ. Στοιχεία ναυτικών: απογραφές ναυτικών, κατάλογοι ναυτικών προσφερόμενων για ναυτολόγηση, υποβολές ναυτικών φυλλαδίων για χορήγηση πιστοποιητικών θαλάσσιας υπηρεσίας, αιτήσεις ανανέωσης ναυτικού φυλλαδίου, αποδεικτικά ναυτικής ικανότητας, παραπεμπτικά προς φοίτηση στην Δημόσια Σχολή Σωστικών και Πυροσβεστικών Μέσων (Δ.Σ.Σ.Π.Μ.).

Σήματα προτεραιότητας πλοίων, υποβολή δελτίων Ναυτιλιακής κίνησης (στατιστικά), αλιευτικές επιθεωρήσεις, ημερολόγια αλιείας (κοινά-Μεσογείου), στατιστικά στοιχεία θαλασσίων συγκοινωνιών, μέτρηση θερμοκρασίας θάλασσας.