Το αρχείο διαρθρώνεται ως εξής: Ι. Υπο-αρχείο Γραµµατείας επί των Οικονομικών (1833-1844, Μάρτιος) Α. Υπο-αρχείο Ανακτόρων Β. Υπο-αρχείο Γραµµατείας - Κεντρική Υπηρεσία ΙΙ. Υπο-αρχείο Υπουργείου των Οικονομικών (1844, Απρίλιος- 1862) Α. Υπο-αρχείο Ανακτόρων Β. Υπο-αρχείο Υπουργείου - Κεντρική Υπηρεσία Τα υπο-αρχεία Ανακτόρων περιλαμβάνουν τα εξερχόμενα έγγραφα της Κεντρικής Υπηρεσίας της Γραμματείας / Υπουργείου προς τα Ανάκτορα: αναφορές, υπομνήματα, εκθέσεις του Γραμματέα / Υπουργού των Οικονομικών με επισυνημμένα σχέδια νόμων και διαταγμάτων υποβαλλόμενα στα Ανάκτορα προς επικύρωση καθώς και αναφορές άλλων Γραμματειών. Περιλαμβάνουν επίσης αναφορές και υπομνήματα διαφόρων διοικητικών αρχών καθώς και αιτήσεις πολιτών απευθυνόμενες στον Βασιλέα. Το υλικό των υπο-αρχείων συμπληρώνεται με τοπογραφικά σχέδια, αρχιτεκτονικές αποτυπώσεις κτηρίων, στρωματογραφήσεις πετρωμάτων, σχέδια μητρών του Νομισματοκοπείου, σχέδια εμβλημάτων δασονόμων, συμβόλαια και συμφωνητικά με οίκους και εταιρείες της αλλοδαπής. Τα υπο-αρχεία της Κεντρικής Υπηρεσίας της Γραμματείας / Υπουργείου των Οικονομικών περιλαμβάνουν τα εισερχόμενα στην Κεντρική Υπηρεσία έγγραφα προερχόμενα από τα Ανάκτορα, τις υπόλοιπες Γραμματείες/Υπουργεία, τις υπάλληλες οικονομικές αρχές, και από ιδιώτες. Λεπτομερέστερα, το αρχειακό υλικό απαρτίζεται από: Βασιλικά Διατάγματα διευθυνόμενα στην Κεντρική Υπηρεσία προς ενέργεια, αναφορές των υπαλλήλων οικονομικών αρχών -με συνημμένα πολλές φορές δικαιολογητικά έγγραφα- ισολογισμούς και λογαριασμούς ληψοδοσίας εφοριών, τελωνείων, ταμείων, αλυκών, έγγραφα και φόρμες τελωνείων, υγειονομείων και λιμεναρχείων, καταλόγους αποδεκατώσεων και επιτροπικά έγγραφα συνταξιοδοτούμενων αγωνιστών, χηρών και ορφανών, οθωμανικά έγγραφα και τίτλους κυριότητας. Όλα τα υπο-αρχεία διαιρέθηκαν σε σειρές σύμφωνα με τα αντικείμενα της αρμοδιότητας της Γραμματείας / Υπουργείου: 1) Οργάνωση-Προσωπικό, 2) Οικονομικοί Επίτροποι/Έφοροι, 3) Δημόσια νομήματα και καταστήματα: α) Δάση, β) Ορυκτά, γ) Αλυκές, δ) Αλιεία-Ιχθυοτροφεία, ε) Βασιλικό Νομισματοκοπείο και Σφραγιστήριο, 4) Τελωνεία, 5) Δημόσια Ταμεία, 6) Προϋπολογισμοί, 7) Συντάξεις, 8) Νεόφυτοι (Νεοφώτιστοι), 9) Δωρεές, 10) Διαφορές με το Δημόσιο. Στο υλικό του αρχείου συγκαταλέγονται επίσης πρωτόκολλα και κατάστιχα/βιβλία της Κεντρικής Υπηρεσίας και των υπαλλήλων υπηρεσιών της Γραμματείας.

Αλληλογραφία σχετική με τη σύσταση και στέγαση του Λ/Σ Κυπαρισσίας, διαταγές είσπραξης ναυτιλιακών τελών, βιβλία κατάπλου πλοίων, βιβλία απόπλου λιμενικής αρχής Κυπαρισσίας, βιβλίο Υγιεινομείου Κυπαρισσίας κ.ά.

Πρωτόκολλα αλληλογραφίας (Νομαρχίας, Υγειονομικού Κέντρου, Νομιάτρου, Κοινωνικής Πρόνοιας, Δασαρχείου). Πρακτικά όλων των υπηρεσιών και ευρετήρια, μητρώα προσφύγων, αδειών οδηγών επιστημόνων, εντάλματα, βιβλία ενταλμάτων, ταμείο οδοποιίας, κ.ά.. Μητρώα αρρένων και αποφάσεις Νομού.

Αποφάσεις και προκηρύξεις (decreti, terminazioni e proclami) των Προβλεπτών της Υγείας (Proveditori alla Sanita). Αποφάσεις, δικογραφίες, δικαστικές αποφάσεις και ποινές του Συμβουλίου της Υγείας (Collegietto di Sanita) που αφορούν στην προστασία της δημόσιας υγείας. Αναφορές του Ιατρικού Συμβουλίου (Collegietto Medico), καταθέσεις σχετικές με τις αφίξεις και τις αναχωρήσεις των πλοίων που προσορμίζονται στο λιμάνι και στις ακτές της νήσου Κέρκυρας. Ναυτολόγια, προέλευση των επιβατών και των φορτίων που επιβιβάζονται στο λιμάνι της Κέρκυρας, διαβατήρια (καθώς και αναθεωρήσεις) και άδειες του Υγειονομείου, πιστοποιητικά θανάτου και γεννήσεων, ονομαστικοί κατάλογοι των υγειονομικών υπαλλήλων (deputati sanitarii) των αλιευτικών, αλληλογραφία και σχετικά έγγραφα, εγγυήσεις, βεβαιώσεις του λοιμοκαθαρτηρίου, γνωστοποιήσεις (notificazioni), λιμενικά τέλη, επισκευές πλοίων, αιτήσεις και αναφορές.

Βιβλία: Χορήγηση εμβολίων, Παραλαβή συνταγών Ο.Γ.Α., Έγκριση αγοράς ναρκωτικών, Μητρώα, Μισθολόγια κ.ά..
Φάκελοι: έγγραφα διαβιβαστικών εντολών υγειονομικής περιθάλψεως, πρόγραμμα υπερηλίκων κ.ά..