Τη σχολική χρονιά 1939-40 λειτουργεί για πρώτη φορά το Β' γυμνάσιο Αρρένων Λαρίσης ως σχολείο νέου τύπου με 3 τάξεις. Το σχολείο στεγάστηκε προσωρινά στο κτίριο του Α' Γυμνασίου Αρρένων στη γωνία Ηπείρου και Ανθίμου Γαζή. To 1957, προς υποστήριξη του σχολείου, λειτούργησε το Γυμνασιακό Παράρτημα του Β' Γυμνασίου Λαρίσης στους Γόννους. Το 1960 το εκπαιδευτικό σύστημα μεταβάλλεται και καταργείται το 8τάξιο Γυμνάσιο ενώ ιδρύεται το 6τάξιο. Το 1964-65 ψηφίζεται ο Νόμος για την ίδρυση 3ετών Γυμνασίων και Λυκείων. Επίσης, αυτή τη χρονιά το Παράρτημα στους Γόννους μετατρέπεται σε ανεξάρτητο σχολείο. (Το σχολικό έτος 1976-77 το εκπαιδευτικό σύστημα αλλάζει εκ νέου και, σύμφωνα με το Σύνταγμα, η υποχρεωτική εκπαίδευση γίνεται 9ετής σε 6τάξιο Δημοτικό, 3ετές Γυμνάσιο και 3ετές Λύκειο (Γενικό ή Επαγγελματικό) και σε Τεχνικές Σχολές 2 ή 4 εξαμήνων (χωρίς εξετάσεις). Παράλληλα τα Γυμνάσια και τα Λύκεια μετατρέπονται σε μεικτά και η επίσημη γλώσσα που χρησιμοποιείται σε αυτά είναι η Δημοτική.) Το Β' Γυμνάσιο λειτούργησε ως Γυμνάσιο Αρρένων μέχρι το τέλος της δεκαετίας του '70. Από το 1981-82 το σχολείο χωρίζεται σε 2ο Γυμνάσιο και 2ο Γενικό Λύκειο Λάρισας.
Το αρχείο του 2ου Γυμνάσιου - Λύκειου Λάρισας καλύπτει τα έτη 1939 - 2003 και αντικατοπτρίζει όλες τις προαναφερθείσες αλλαγές στην οργάνωση και λειτουργία του σχολείου. Αποτελείται από 38 βιβλία, μαθητολόγια, βιβλία γενικού ελέγχου, βιβλία πιστοποιητικών σπουδής, βιβλία ειδικού ελέγχου κ.ά., καθώς και 20 φακέλους με διάφορα έγγραφα που παρήχθησαν κατά την καθημερινή λειτουργία του σχολείου.
Το υλικό του αρχείου είναι ταξινομημένο θεματικά και χρονολογικά.
